Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  184  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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2.0
26
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2.7
19
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17
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28
13
15
42
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.3
19
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2.2
24
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2.3
13
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13
1.11
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31
3.1
31
77
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38
3
5
53
1.39
58169214--58169316
20
4.9
22
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16
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3
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1.41
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2.2
42
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0
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2.0
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2.3
87
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36
21
22
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
20
1.96
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292
35
20
23
20
1.96
58176769--58177100
44
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236
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19
23
20
1.95
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1.9
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1.31
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1
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1.20
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2.3
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1.50
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15
3.6
14
81
18
65
74
1
1
21
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58231935--58231990
17
3.4
17
76
14
55
76
1
1
19
0.96
58234460--58234500
18
2.3
18
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0
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1.31
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28
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0
0
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47
4.2
47
80
2
188
31
27
16
24
1.96
58257398--58257593
67
2.9
67
93
0
338
23
28
12
35
1.92
58266867--58267085
83
2.6
83
90
1
330
26
26
17
29
1.97
58266923--58267054
41
3.2
41
66
19
101
28
26
16
28
1.97
58267458--58267509
24
2.2
24
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0
104
30
19
3
46
1.68
58268995--58269024
15
2.1
15
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53
36
26
6
30
1.82
58273862--58274084
112
2.0
112
93
0
383
34
12
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26
1.92
58286333--58286578
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4
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20
1.99
58288418--58288504
42
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42
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113
22
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20
1.99
58289636--58289692
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7
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58291260--58291303
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1.9
23
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9
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9
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0
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0
0
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0.75
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2.0
24
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0
17
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1.46
58306825--58306984
39
4.1
39
93
0
266
25
30
23
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
102
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31
15
1.92
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8
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0
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0
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38
1.54
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27
2.4
27
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0
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13
13
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35
1.85
58319482--58319513
16
2.1
16
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11
50
6
0
15
78
0.95
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1.9
176
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1
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17
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1.97
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133
2.0
133
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0
461
25
25
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29
1.98
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176
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1.98
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2.0
309
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1.97
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2.0
21
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1.32
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27
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1.95
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1.9
25
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0
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1.89
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40
1.9
39
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5
116
34
12
20
33
1.89
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2.1
47
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2
185
27
20
20
31
1.98
58345342--58345460
23
5.0
24
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172
26
21
21
30
1.98
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31
2.2
31
91
0
107
38
14
23
22
1.92
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0
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29
17
29
23
1.97
58353986--58354190
5
41.4
5
98
1
396
60
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58356992--58357215
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2.8
79
80
11
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25
21
26
25
2.00
58356993--58357215
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5.6
40
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219
25
21
26
25
2.00
58357065--58357248
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2.3
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7
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27
21
26
25
1.99
58364916--58365140
79
2.8
80
81
11
264
26
22
26
24
2.00
58364916--58365140
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5.7
40
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26
22
26
24
2.00
58364916--58365140
119
1.9
120
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291
26
22
26
24
2.00
58376730--58377193
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1.87
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1.87
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1.9
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1.8
94
86
2
247
30
19
25
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325