Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  14  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5355438--5355469
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15
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2.0
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2.1
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2.0
17
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1.9
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0
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0
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54
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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0
0
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2
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289
100
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2.7
27
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1
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10
0
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5491641--5491671
15
2.1
14
94
5
53
35
3
6
54
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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10
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2.0
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29
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1
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0
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0
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2.1
15
100
0
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38
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32
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1.80
5642396--5642434
18
2.3
17
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8
53
38
5
12
43
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5644185--5644252
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4.2
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17
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11
2
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1.12
5644190--5644268
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2.7
30
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117
10
10
1
78
1.02
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17
3.5
17
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20
66
10
12
1
75
1.14
5644197--5644268
13
4.9
14
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51
11
9
1
77
1.05
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11
4
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3.5
17
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10
5
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0.95
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27
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71
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3
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0
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0
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22
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63
27
6
0
65
1.17
5644735--5644782
18
2.8
17
81
9
53
18
6
4
70
1.25
5644868--5644957
33
2.7
33
70
17
78
35
1
5
57
1.29
5645165--5645226
7
9.1
7
74
11
58
53
0
0
46
1.00
5645169--5645231
21
3.1
21
79
4
67
47
0
0
52
1.00
5645368--5645425
27
2.1
28
87
3
82
46
5
1
46
1.35
5645475--5645525
21
2.3
21
77
16
50
39
3
1
54
1.30
5645484--5645527
21
2.1
22
84
16
58
36
4
0
59
1.18
5647494--5647565
9
7.8
9
71
10
56
79
4
4
12
1.02
5651274--5651307
9
3.9
9
88
7
52
58
0
0
41
0.98
5651274--5651309
17
2.1
17
89
0
54
61
0
0
38
0.96
5651275--5651339
25
2.5
26
80
5
78
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5654569--5654621
3
17.7
3
82
0
52
24
33
1
39
1.66
5655980--5656087
26
4.2
26
90
0
171
32
6
23
37
1.80
5667844--5667888
15
3.1
14
83
6
54
24
0
4
71
1.05
5667848--5667899
24
2.3
22
80
6
59
26
0
5
67
1.13
5684506--5684665
12
13.3
12
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10
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1
33
16
48
1.58
5684507--5684648
24
5.9
24
84
0
176
1
31
18
48
1.57
5685043--5685079
18
2.1
18
89
0
56
13
32
27
27
1.94
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27
1.9
27
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4
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25
29
23
21
1.99
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42
2.0
42
95
0
148
28
8
21
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1.82
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82
2.0
82
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0
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34
22
18
25
1.96
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12
2.2
12
100
0
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0
7
0
0.38
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16
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0
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0
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0
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5.0
5
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0
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0
40
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29
2.0
29
100
0
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0
0
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27
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0
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3
3
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6
4.3
6
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0
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0
0
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12
3.0
12
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0
54
41
30
0
27
1.56
5731612--5731643
16
2.0
16
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0
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46
12
12
28
1.78
5736161--5736284
64
1.9
64
91
0
203
29
8
28
33
1.86
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25
2.0
24
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4
60
12
18
8
60
1.57
5742673--5742733
30
2.0
30
100
0
122
40
13
19
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5744274--5744318
18
2.4
19
81
7
56
4
24
0
71
1.05
5745105--5745130
10
2.6
10
100
0
52
50
7
0
42
1.31
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17
2.0
17
100
0
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11
23
17
47
1.81
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35
2.1
35
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41
19
0
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1.52
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25
2.6
26
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13
61
63
8
1
26
1.32
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16
2.1
16
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0
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2
2
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1.15
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20
1.9
19
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2
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0
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5
7.0
5
93
6
63
61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325