Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  86  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29094967--29095018
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2.2
24
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1.48
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1.46
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2.1
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41
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1.39
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3
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5.0
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28
23
0
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1.51
29099427--29099482
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11
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0
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2.0
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2
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2.2
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25
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53
1.44
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10
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6
3
55
1.42
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23
3.2
20
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18
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3
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1.46
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9
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0
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15
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4
53
32
0
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60
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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2
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0
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39
0
0
60
0.97
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2.0
30
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6
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28
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1.8
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91
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27
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16
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324
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2
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84
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33
17
18
30
1.94
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18
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1.96
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2.8
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4
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32
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21
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36
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4
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0
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2
27
47
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
15
100
0
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65
13
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1.45
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18
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1.42
29198855--29198915
23
2.6
23
94
2
104
26
42
18
13
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29198950--29198990
15
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1.37
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0
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1.87
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28
3.2
27
81
10
94
18
22
24
34
1.96
29232791--29232850
21
3.0
20
77
18
61
6
8
5
80
1.03
29232983--29233011
15
1.9
15
100
0
58
17
0
41
41
1.49
29238969--29239008
18
2.2
19
90
4
64
72
0
7
20
1.08
29239892--29239939
15
3.1
16
83
16
57
70
2
0
27
0.98
29239883--29239953
11
6.5
11
76
12
58
66
2
1
29
1.15
29240923--29240977
28
2.0
27
82
3
65
47
16
7
29
1.73
29240949--29241046
18
5.5
18
70
2
81
39
12
9
38
1.75
29240983--29241056
36
2.1
36
86
0
103
37
12
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40
1.75
29240937--29241053
18
6.4
18
66
9
60
41
13
8
36
1.75
29241106--29241152
18
2.6
19
75
21
55
63
2
4
29
1.25
29243651--29243771
56
2.2
56
92
4
201
64
11
0
23
1.26
29244249--29244316
18
3.7
19
80
5
77
47
14
7
30
1.72
29244497--29244533
6
6.2
6
93
0
65
48
16
18
16
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29246901--29246942
10
4.1
10
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14
50
61
2
0
35
1.09
29253209--29253272
3
21.3
3
100
0
128
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0
0
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0.91
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3
16.7
3
95
0
91
32
2
0
66
1.03
29262481--29262532
18
2.8
19
72
18
56
34
3
0
61
1.14
29271473--29271562
21
4.3
20
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18
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57
0
1
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1.06
29277241--29277280
20
2.0
20
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0
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1.26
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2.5
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5
172
21
18
18
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1.89
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0
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9
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0
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20
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12
0
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1.38
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10
5.0
10
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21
5
1
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1.18
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20
2.5
20
86
0
64
22
6
2
70
1.20
29311433--29311463
15
2.0
16
93
6
55
45
19
9
25
1.81
29316732--29316781
24
2.1
24
92
0
82
32
4
42
22
1.72
29318193--29318303
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4.1
26
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7
105
18
21
21
37
1.94
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44
11.8
44
72
10
321
34
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19
29
1.94
29320637--29320982
184
1.9
182
81
3
417
32
16
20
30
1.95
29320594--29321105
228
2.2
228
86
4
692
34
16
18
30
1.94
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51
3.1
51
78
7
147
36
16
16
30
1.91
29321820--29321858
16
2.5
17
84
15
50
10
10
5
74
1.21
29322035--29322076
20
2.1
20
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0
57
14
42
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9
1.78
29322698--29322731
13
2.7
13
86
4
52
11
5
0
82
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29322828--29322868
14
2.8
15
88
7
66
31
9
2
56
1.45
29323673--29323708
19
1.9
18
88
5
54
58
5
5
30
1.44
29328364--29328410
20
2.3
20
85
7
60
61
6
0
31
1.21
29329475--29329527
13
4.1
13
80
0
70
32
9
16
41
1.81
29329762--29329806
20
2.3
20
84
3
56
55
0
2
42
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2.5
24
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3
0
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2.5
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13
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2
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17
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0
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0
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0
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0
0.88
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18
1.9
18
88
11
52
27
0
18
54
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325