Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  301  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95700594--95700758
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2
2
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2.6
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0
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95724160--95724205
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2.2
21
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0.91
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43
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2.3
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0
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95734875--95735041
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185
31
0
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3.0
39
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0
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46
1.52
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179
32
0
22
44
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2.0
19
94
0
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21
28
31
18
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95738147--95738198
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95739281--95739317
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2.5
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1.9
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3.6
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20
21
33
1.97
95749102--95749313
40
5.6
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71
18
138
25
20
21
32
1.97
95749090--95749319
75
3.1
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318
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20
20
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95751184--95751245
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28
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95756303--95756423
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24
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0
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0
0
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65
0
0
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2.0
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2.0
32
100
0
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12
31
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.23
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16
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4
22
1.26
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2.8
28
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12
72
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3
22
1.30
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1.76
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95818663--95818719
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80
1.00
95818663--95818719
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80
1.00
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3.8
17
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7
62
40
0
2
56
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95832251--95832316
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1
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1
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1.27
95832764--95832854
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26
1.25
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26
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0
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2.0
24
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4
58
58
6
2
32
1.36
95836799--95836838
21
2.0
20
85
14
55
47
0
2
50
1.14
95843050--95843082
12
2.6
13
90
4
50
87
0
3
9
0.63
95843049--95843083
11
2.9
12
91
8
54
82
0
2
14
0.77
95848142--95848379
107
2.3
105
82
5
275
23
7
18
50
1.72
95852972--95853048
21
3.7
20
74
6
64
38
37
6
16
1.75
95859937--95859982
21
2.2
21
92
0
74
34
19
26
19
1.96
95861224--95861253
14
2.1
14
93
0
51
30
3
23
43
1.70
95869091--95869224
45
3.0
45
82
2
146
32
17
23
26
1.96
95870084--95870120
13
2.8
13
91
4
56
51
24
0
24
1.49
95871471--95871518
19
2.6
18
83
9
53
2
27
2
68
1.11
95874935--95875020
27
3.2
27
79
12
104
33
12
25
27
1.93
95877500--95877591
21
4.4
21
87
2
114
39
39
7
14
1.74
95877502--95877584
42
2.0
42
90
0
130
40
37
8
13
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95881540--95881594
25
2.2
25
78
9
60
29
7
3
60
1.41
95885332--95885374
19
2.2
20
87
4
61
30
18
4
46
1.69
95893726--95893931
45
4.6
45
71
11
131
33
17
19
29
1.95
95893627--95894054
227
1.9
223
83
6
551
32
18
20
28
1.96
95895590--95895634
22
2.0
22
86
0
63
26
4
4
64
1.32
95895598--95895640
22
2.1
22
87
12
65
25
0
6
67
1.15
95906053--95906090
20
1.9
20
88
0
58
0
15
5
78
0.91
95908055--95908106
27
1.9
27
88
7
79
34
0
1
63
1.06
95908515--95908563
21
2.3
22
79
10
57
48
28
2
20
1.60
95908550--95908617
21
3.2
21
69
19
52
42
25
4
27
1.74
95913554--95913618
29
2.2
29
84
10
80
27
6
4
61
1.40
95914682--95914728
15
3.1
15
71
17
51
51
2
2
44
1.25
95915202--95915245
22
2.0
22
86
4
61
13
11
18
56
1.66
95916446--95916503
22
2.6
22
94
0
98
29
55
3
12
1.53
95918259--95918320
27
2.2
28
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10
74
38
16
1
43
1.57
95919930--95919966
19
1.9
19
100
0
74
56
21
5
16
1.59
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22
2.0
22
86
0
61
52
0
0
47
1.00
95922460--95922501
15
2.7
16
85
14
61
57
0
2
40
1.12
95922647--95922691
23
1.9
24
86
4
65
24
15
4
55
1.59
95923043--95923081
14
2.8
13
92
7
60
33
20
7
38
1.81
95924040--95924070
15
2.1
15
93
0
53
58
22
0
19
1.40
95925197--95925240
21
2.1
21
82
0
52
36
9
11
43
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95934856--95934931
2
38.5
2
72
7
57
0
60
2
36
1.11
95934862--95934927
14
4.7
14
80
12
73
0
62
3
34
1.11
95934860--95934931
24
3.2
22
79
9
74
0
61
2
36
1.11
95946241--95946337
33
2.9
33
95
0
167
28
40
9
21
1.84
95951123--95951162
20
2.0
20
85
0
53
30
7
20
42
1.79
95953062--95953112
13
3.6
13
78
17
57
49
0
1
49
1.12
95963526--95963578
16
3.3
16
76
10
63
50
1
32
15
1.54
95968139--95968209
4
17.5
4
98
1
133
49
1
23
25
1.59
95968836--95968899
27
2.4
27
86
5
85
25
7
32
34
1.84
95970343--95970396
25
2.2
25
93
6
92
25
22
14
37
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325