Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  24  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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70
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1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2
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2.2
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2
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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171
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0
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1.12
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0
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29
18
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9279312--9279482
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20
29
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1.99
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100
2.4
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357
20
29
24
26
1.99
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2.5
13
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0
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0
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0
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12
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15
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0
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0
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0
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12
63
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9
0
49
1.35
9291230--9291274
20
2.3
20
85
7
58
48
0
2
48
1.13
9291238--9291281
20
2.4
19
81
11
56
52
0
0
47
1.00
9297704--9297742
17
2.4
17
83
8
55
56
5
0
38
1.22
9309150--9309198
21
2.3
21
78
3
53
38
4
2
55
1.31
9309197--9309231
18
1.9
18
88
11
54
60
8
2
28
1.41
9314402--9314426
7
3.6
7
100
0
50
56
0
0
44
0.99
9328675--9328750
38
2.0
38
100
0
152
47
13
21
18
1.82
9333565--9333620
20
2.7
20
83
10
60
32
0
8
58
1.29
9333563--9333608
19
2.3
20
82
10
60
36
0
8
54
1.32
9333566--9333620
10
5.4
10
74
20
51
30
0
9
60
1.28
9333592--9333632
12
3.3
12
86
3
55
31
0
7
60
1.24
9333672--9333710
18
2.2
18
95
0
69
35
5
7
51
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9336485--9336544
23
2.7
23
71
16
56
63
1
0
35
1.05
9336479--9336555
31
2.5
31
82
6
93
61
3
0
35
1.15
9339280--9339309
14
2.2
13
94
5
51
33
6
20
40
1.78
9339293--9339336
19
2.2
20
92
4
72
25
9
13
52
1.70
9341338--9341499
24
6.8
24
69
10
107
32
27
14
25
1.94
9343732--9343809
32
2.4
32
80
4
86
53
20
2
23
1.57
9348798--9348845
25
1.9
25
83
8
62
60
2
33
4
1.27
9349411--9350318
479
1.9
479
95
0
1636
33
21
12
33
1.90
9351630--9351878
124
2.0
124
98
0
480
31
17
22
27
1.97
9353963--9354008
3
15.3
3
95
0
83
0
34
0
65
0.93
9359405--9359453
19
2.4
21
86
6
66
20
4
0
75
0.96
9359571--9359631
20
3.1
19
83
9
70
62
1
3
32
1.21
9359576--9359648
30
2.4
30
80
15
87
61
1
5
31
1.27
9359605--9359732
33
3.8
31
73
18
96
59
2
5
32
1.33
9359705--9359756
20
2.5
20
81
3
68
65
0
1
32
1.04
9360017--9360072
21
2.7
21
77
5
60
37
5
3
53
1.41
9360017--9360091
21
3.6
20
72
16
55
38
5
2
53
1.38
9360017--9360126
20
5.6
19
70
18
73
34
5
2
57
1.36
9359961--9360137
20
8.9
21
66
12
72
34
6
2
56
1.39
9374605--9374770
53
3.1
53
87
6
212
25
15
28
30
1.95
9378203--9378235
18
1.9
17
88
11
50
51
3
6
39
1.42
9393739--9393779
21
2.0
21
90
0
64
26
21
29
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9395296--9395331
4
9.0
4
100
0
72
25
0
25
50
1.50
9396416--9396531
21
5.8
18
70
18
70
34
1
2
61
1.20
9396857--9396888
15
2.1
16
94
5
57
75
0
0
25
0.81
9404713--9404870
25
6.5
24
82
7
185
21
25
18
34
1.96
9404786--9404912
22
5.5
22
73
11
87
19
24
18
37
1.94
9404787--9404912
47
2.7
47
87
3
186
19
24
19
37
1.94
9405914--9406071
79
2.0
79
100
0
316
44
8
15
31
1.77
9408312--9408346
17
2.1
17
88
0
52
0
28
0
71
0.86
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13
2.0
13
100
0
52
0
23
0
76
0.78
9408315--9408384
31
2.2
31
82
5
77
1
31
5
61
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325