Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  277  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88835733--88835953
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22
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28
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88835828--88836044
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4.9
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1.97
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0
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26
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9
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1.63
88858393--88858460
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0
100
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1.23
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55
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28
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23
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23
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93
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1.99
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3.8
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28
28
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22
1.99
88899573--88899716
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3.1
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28
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198
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23
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1.99
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0
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29
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1.98
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2.0
50
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0
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88931814--88932026
27
7.9
27
79
12
224
34
21
24
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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1
320
34
22
24
18
1.96
88932444--88932473
16
1.9
15
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3
20
23
53
1.60
88933646--88933751
25
4.2
26
91
3
180
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23
7
33
1.83
88933646--88933751
51
2.1
51
96
0
194
35
23
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33
1.83
88938994--88939206
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7.9
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12
197
35
22
23
18
1.96
88939012--88939206
54
3.6
54
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293
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22
17
1.95
88940829--88940936
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19
25
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1.98
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19
2.5
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2
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1.12
88955434--88955581
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1
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0
2
64
1.08
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51
29
0
3
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1.06
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2.2
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177
18
0
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48
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0
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19
20
23
36
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2.1
28
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102
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20
54
1.68
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27
2.6
27
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10
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1.73
88974512--88974603
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4
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1.9
20
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7
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178
17
9
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38
1.82
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3.5
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18
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1
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1.29
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2.6
54
73
12
128
62
0
7
29
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1
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1.12
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0
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22
1.07
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10
4
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1.44
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1.9
38
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26
6
1
65
1.26
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19
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5
0
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1.20
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2.1
21
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9
12.1
9
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5
0
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1.19
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1.16
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1.17
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15
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11
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14
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1.92
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24
11
37
1.89
89027326--89027375
24
2.1
24
100
0
100
28
12
16
44
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89028180--89028225
17
2.6
18
77
19
51
41
13
0
45
1.43
89028849--89028899
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12.8
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0
102
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0
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24
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1.91
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1
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1.33
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2.1
41
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0
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213
24
17
25
32
1.96
89041419--89041732
46
6.8
46
85
2
398
20
23
14
42
1.88
89041419--89041730
138
2.3
138
89
2
473
19
24
14
41
1.88
89045285--89045320
12
3.0
12
87
0
54
25
27
5
41
1.77
89045293--89045324
16
1.9
17
93
6
57
25
28
6
40
1.79
89053293--89053693
139
2.9
139
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1
621
28
16
24
30
1.96
89053724--89053894
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2.2
76
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7
245
30
18
19
32
1.95
89053576--89054052
170
2.8
168
87
5
658
30
18
19
31
1.96
89053819--89053993
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94
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0
260
30
19
16
33
1.94
89053973--89054198
80
2.7
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36
1.91
89053973--89054717
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28
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1.92
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2
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1.95
89053723--89054473
250
3.0
244
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29
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18
34
1.94
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14
2.4
14
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0
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18
12
6
63
1.48
89054214--89054715
87
5.7
86
79
11
416
27
16
18
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89054214--89054752
179
3.0
176
79
10
501
26
16
18
38
1.92
89054413--89054715
92
3.4
94
79
10
241
30
15
18
35
1.92
89054235--89054789
87
6.3
87
77
13
342
27
16
19
37
1.92
89054867--89054908
21
2.0
21
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0
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33
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28
1.88
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3
3
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1.38
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42
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3
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1.39
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11
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1
0
1.09
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0
1.09
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35
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120
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402
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1.39
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52
1
0
45
1.11
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2.0
50
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1.98
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259
28
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1.98
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4
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1.68
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0
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0.98
89102030--89102068
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2.0
20
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25
0
2
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0.98
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2.0
27
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1.60
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0
0
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22
3.0
21
79
9
63
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89120172--89120234
30
2.1
30
81
0
72
19
23
33
23
1.97
89121555--89121606
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1.9
27
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32
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0
50
1.47
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4
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4
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26
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89134531--89134672
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2.0
71
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1.9
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0
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1.91
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2
369
39
15
24
20
1.91
89138803--89139083
137
2.1
136
85
4
368
40
16
23
20
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325