Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  281  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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90101675--90101718
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0
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2
37
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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23
1.98
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0
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0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
90211632--90211679
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0
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43
1.66
90249729--90249773
18
2.7
17
83
13
58
24
8
2
64
1.34
90249729--90249797
32
2.1
33
89
2
104
26
10
2
60
1.42
90249936--90249987
26
2.0
26
81
11
61
28
5
7
57
1.50
90250023--90250132
26
4.3
26
72
4
80
24
6
7
61
1.45
90251602--90251656
27
2.0
27
85
0
74
12
14
10
61
1.56
90252577--90252704
27
4.7
26
70
9
69
27
17
27
27
1.98
90252712--90252909
81
2.4
81
82
1
218
19
16
26
38
1.92
90254255--90254534
93
3.0
93
91
0
425
26
19
25
28
1.99
90260181--90260310
66
2.0
66
83
3
163
41
12
19
26
1.87
90261670--90261695
11
2.4
11
100
0
52
34
19
0
46
1.50
90262017--90262136
60
2.0
59
98
1
231
30
11
16
41
1.84
90271946--90271986
21
2.0
21
100
0
82
21
19
14
43
1.87
90271965--90272064
40
2.5
40
85
4
123
17
15
25
43
1.87
90273139--90273179
20
2.0
20
85
0
55
34
19
2
43
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90280618--90281010
177
2.2
177
91
0
653
28
21
19
30
1.98
90280847--90281142
132
2.2
132
92
1
486
27
20
20
31
1.98
90280671--90281233
309
1.8
308
93
1
975
26
21
20
31
1.98
90280618--90281327
309
2.3
307
81
4
949
27
21
20
30
1.98
90281102--90281482
134
2.9
133
86
3
523
28
21
19
30
1.97
90281110--90281467
45
8.0
44
65
11
156
28
20
19
31
1.97
90281657--90281784
64
2.0
64
89
0
193
35
14
19
31
1.91
90292047--90292102
20
2.5
23
80
16
73
21
1
10
66
1.32
90292047--90292102
22
2.5
22
83
13
71
21
1
10
66
1.32
90294527--90294577
22
2.3
22
75
0
57
33
3
7
54
1.47
90296270--90296439
47
3.6
47
76
13
197
28
27
20
24
1.99
90296318--90296482
46
3.6
46
75
14
176
29
27
20
23
1.99
90296263--90296488
93
2.4
93
90
0
371
29
26
19
23
1.99
90298120--90298172
23
2.3
23
72
18
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58
1
3
35
1.27
90301511--90301589
31
2.5
31
91
0
131
26
27
16
29
1.97
90301617--90301704
42
2.1
42
89
0
131
35
19
14
30
1.92
90301849--90301972
26
4.8
26
92
1
214
25
23
24
26
2.00
90303527--90303611
31
2.7
31
92
0
143
28
25
15
30
1.96
90303639--90303726
42
2.1
42
89
0
131
35
19
14
30
1.92
90303871--90303968
26
3.8
26
93
1
171
25
23
24
26
2.00
90304718--90304798
27
3.0
27
89
3
110
22
24
22
30
1.99
90304926--90305078
27
5.6
28
86
4
190
30
6
20
42
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90304871--90305146
27
10.1
27
81
6
173
34
7
19
38
1.80
90304923--90305077
81
1.9
81
88
2
231
30
7
20
41
1.79
90304951--90305103
81
1.9
81
83
0
198
32
6
21
39
1.79
90305071--90305389
27
11.8
27
87
1
397
39
8
25
26
1.85
90305413--90305487
27
2.7
27
83
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34
10
16
38
1.83
90308010--90308105
48
2.0
48
100
0
192
25
12
18
43
1.85
90310656--90310693
18
2.1
18
95
0
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7
28
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100
0
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1.88
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2.2
48
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1
135
22
18
16
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1.89
90314660--90314698
18
2.2
18
90
4
62
12
25
15
46
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325