Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  70  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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(0-2)
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1.69
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26
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9.6
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16
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5
32
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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40
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
24815852--24815907
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23
2.0
22
81
4
52
54
0
11
34
1.36
24831254--24831460
47
4.2
47
82
7
209
32
28
14
23
1.94
24831236--24831460
93
2.3
98
81
9
246
32
28
15
24
1.95
24831360--24831461
53
1.9
53
88
4
152
32
27
14
25
1.95
24833494--24833544
11
5.0
10
76
9
50
64
9
19
5
1.44
24834281--24834391
45
2.5
45
84
0
141
20
18
17
43
1.88
24834565--24834747
18
10.2
18
78
7
174
35
12
14
37
1.84
24834565--24834848
18
15.4
18
72
8
133
35
11
15
37
1.84
24846686--24846730
21
2.1
21
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1.76
24849199--24849349
68
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214
25
23
15
35
1.94
24860016--24860063
8
5.9
8
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4
51
4
14
0
81
0.84
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19
2.2
19
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57
5
15
0
80
0.88
24860727--24860783
22
2.5
22
80
11
53
29
8
0
61
1.26
24861247--24861279
15
2.1
17
88
11
52
33
0
3
63
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24861247--24861286
19
2.2
17
86
13
53
32
2
2
62
1.22
24861247--24861316
37
1.9
35
83
11
88
31
5
1
61
1.28
24861310--24861362
26
2.0
27
85
3
72
26
7
3
62
1.39
24862286--24862323
15
2.5
16
83
12
53
13
0
18
68
1.21
24870275--24870384
50
2.2
50
83
0
130
31
18
28
21
1.97
24870288--24870391
25
4.2
25
88
0
136
32
16
29
21
1.95
24872801--24872840
13
3.1
13
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0
71
25
40
12
22
1.89
24888839--24888925
41
2.1
41
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4
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2
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1.53
24890713--24890766
23
2.5
23
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7
0
31
1.24
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15
114
55
4
7
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1.47
24891477--24891524
22
2.2
22
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0
60
33
0
2
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20
1.9
20
84
10
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44
13
21
21
1.85
24893699--24893762
30
2.1
30
100
0
92
40
6
26
26
1.79
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51
2.9
46
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13
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24
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2.1
78
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5
263
38
10
26
24
1.88
24893732--24893855
51
2.5
50
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8
184
37
12
25
24
1.90
24893823--24893888
33
2.0
33
96
0
123
37
12
22
27
1.90
24893858--24893982
46
2.7
46
85
2
162
43
12
23
21
1.86
24893786--24893934
79
1.9
79
91
0
244
38
13
24
22
1.90
24894620--24894672
15
3.4
15
82
12
63
62
0
7
30
1.23
24894623--24894702
29
2.8
27
75
25
76
63
1
7
27
1.29
24894661--24894721
23
2.7
23
72
23
56
63
3
6
26
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24895684--24895748
9
7.0
9
75
13
60
33
3
1
61
1.21
24895684--24895748
19
3.5
18
75
12
60
33
3
1
61
1.21
24895676--24895733
28
2.1
27
84
9
73
36
5
0
58
1.20
24897572--24897641
34
2.1
34
100
0
140
37
20
21
21
1.95
24899742--24899793
27
1.9
27
84
0
68
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1
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1.09
24899747--24899802
14
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14
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1
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53
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0
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21
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3
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51
12
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1.65
24909168--24909207
19
2.2
18
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42
15
2
40
1.60
24913736--24913828
43
2.2
44
90
3
145
51
12
6
29
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325