Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  120  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2.0
54
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22
16
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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29
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18
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2
779
28
17
25
28
1.98
37621132--37621375
131
1.9
131
87
3
366
29
16
15
38
1.90
37621132--37621404
131
2.1
130
83
5
336
29
17
15
37
1.91
37623429--37623503
27
2.7
27
78
10
71
46
9
1
42
1.44
37623839--37623904
25
2.8
24
73
15
73
53
12
0
34
1.38
37623826--37623900
25
3.1
25
73
17
70
54
12
0
33
1.37
37628212--37628262
5
10.0
5
83
12
68
76
0
1
21
0.88
37631407--37631458
27
1.9
27
88
0
77
21
15
51
11
1.74
37639705--37639989
47
6.1
47
90
0
410
34
10
28
25
1.90
37639825--37639899
22
3.3
22
72
17
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32
13
29
25
1.93
37639963--37640145
46
4.0
46
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0
285
33
9
31
25
1.87
37641630--37641664
11
3.2
11
92
8
54
42
0
0
57
0.99
37641588--37641659
31
2.3
31
77
13
76
36
5
0
58
1.22
37641631--37641734
9
11.9
9
67
23
53
32
0
3
62
1.20
37655875--37655965
39
2.3
39
84
3
121
34
18
23
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37655960--37656175
39
5.5
39
91
1
342
20
23
28
28
1.99
37657813--37658289
206
2.3
206
88
1
679
31
18
21
28
1.97
37659920--37659949
15
2.0
15
100
0
60
40
0
0
60
0.97
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19
2.4
19
77
0
56
36
0
2
60
1.09
37660291--37660331
9
4.7
9
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14
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29
0
4
65
1.13
37661109--37661154
23
2.0
24
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45
13
4
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1.63
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38
2.0
38
100
0
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5
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5
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1
19
0.92
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1.92
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2.0
238
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0
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1.90
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1.86
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27
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39
0
3
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1.17
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11
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11
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33
0
2
64
1.05
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33
2.3
33
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32
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1.97
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5.5
46
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2
371
44
13
23
19
1.85
37683927--37683970
17
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17
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10
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52
2
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1.53
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38
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38
83
1
383
16
19
30
33
1.94
37698093--37698151
21
2.8
21
81
0
64
16
27
33
22
1.95
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27
2.0
27
82
10
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25
14
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50
1.73
37700079--37700120
13
3.2
13
83
16
50
21
0
2
76
0.90
37700078--37700120
18
2.4
18
85
11
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23
0
2
74
0.93
37700469--37700514
16
2.9
17
81
12
53
78
2
4
15
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37704373--37704507
48
2.8
48
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2
164
31
27
15
25
1.96
37705876--37706046
93
1.8
93
89
2
272
29
27
20
22
1.99
37705871--37706043
46
3.7
46
77
10
181
30
26
20
23
1.98
37713426--37713594
93
1.8
91
92
2
284
30
28
18
21
1.97
37716053--37716182
52
2.6
50
89
8
201
30
12
28
29
1.93
37716052--37716229
51
3.5
52
87
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233
29
14
28
27
1.95
37721953--37722066
43
2.7
43
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16
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1.97
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2.0
30
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0
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20
18
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1.85
37731466--37731616
48
3.3
42
74
15
122
29
25
17
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325