Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  19  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7443249--7443280
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
7443492--7443549
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
7445952--7446164
46
4.6
46
85
0
282
38
13
26
21
1.90
7446148--7446180
16
2.1
16
94
0
57
42
9
30
18
1.81
7446102--7446226
62
2.0
62
87
0
178
40
12
26
20
1.87
7446056--7446271
108
2.0
107
85
2
290
40
13
26
19
1.88
7446164--7446271
46
2.4
45
85
4
137
45
12
23
18
1.84
7450900--7450939
18
2.2
18
86
8
55
22
2
2
72
1.09
7457654--7457683
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
7458240--7458365
30
4.2
29
72
8
83
32
21
5
40
1.76
7458887--7458946
12
4.9
12
76
15
52
75
0
23
1
0.90
7458896--7458951
10
5.4
10
80
16
53
76
0
21
1
0.87
7458887--7458941
22
2.5
23
85
5
69
76
0
21
1
0.88
7458884--7458949
19
3.2
20
74
21
57
74
0
24
1
0.91
7458898--7458940
13
3.2
13
80
3
50
76
0
20
2
0.89
7459357--7459386
16
1.9
16
93
6
53
36
3
0
60
1.14
7459931--7459967
17
2.2
17
90
4
58
35
8
10
45
1.69
7471788--7471818
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
7471898--7471928
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
7472835--7472889
22
2.4
23
81
6
67
3
3
32
60
1.32
7472858--7472905
22
2.1
23
84
3
62
8
6
25
60
1.49
7472850--7472898
22
2.2
23
89
7
75
8
4
30
57
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7488198--7488374
50
3.5
50
88
2
248
36
16
20
26
1.94
7488352--7488553
31
6.5
31
90
0
305
28
19
26
25
1.99
7488584--7488709
47
2.7
48
84
7
152
30
15
24
30
1.95
7495550--7495666
61
1.9
62
85
1
164
39
17
11
31
1.86
7496127--7496278
77
2.0
79
84
3
202
40
5
3
50
1.41
7496418--7496461
22
2.0
22
82
8
54
54
0
0
45
0.99
7496432--7496479
21
2.3
21
86
10
64
50
0
0
50
1.00
7497700--7497792
48
1.9
48
84
0
123
26
12
19
40
1.88
7497955--7497987
17
1.9
17
100
0
66
48
3
6
42
1.43
7498186--7498217
12
2.7
12
95
0
55
71
6
9
12
1.29
7500372--7500593
87
2.6
87
87
2
304
25
27
15
31
1.95
7500521--7500662
75
1.9
75
80
0
167
27
23
14
33
1.94
7501515--7501599
39
2.2
39
89
4
136
12
21
21
44
1.85
7512039--7512085
18
2.6
18
82
0
58
27
34
10
27
1.90
7524783--7524858
21
3.3
21
71
25
73
42
1
3
52
1.28
7524794--7524877
25
3.4
25
75
18
95
44
2
4
48
1.36
7524799--7524874
23
3.2
23
74
20
84
40
2
5
51
1.38
7524777--7524874
48
2.0
48
98
0
187
40
2
5
52
1.35
7524777--7524862
24
3.6
26
73
14
87
39
1
4
54
1.29
7525504--7525551
17
2.8
16
78
12
51
70
2
0
27
0.98
7534376--7534475
50
2.0
50
94
0
173
45
11
4
40
1.58
7534401--7534477
25
3.1
25
63
19
61
46
10
2
40
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7534754--7534786
12
2.7
13
86
13
52
45
0
0
54
0.99
7537253--7537280
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
7542855--7542930
38
2.0
38
100
0
152
18
21
26
34
1.96
7543338--7543382
22
2.0
22
91
0
72
48
15
2
33
1.57
7554818--7554848
3
10.7
3
93
6
55
0
29
0
70
0.87
7555291--7555318
3
9.3
3
100
0
56
64
0
0
35
0.94
7559220--7559406
47
3.9
48
81
5
182
25
16
28
29
1.97
7565488--7565545
23
2.4
24
80
5
64
27
1
5
65
1.23
7575426--7575451
10
2.6
10
100
0
52
42
7
38
11
1.70
7580394--7580421
14
2.0
14
100
0
56
35
7
7
50
1.57
7585160--7585207
22
2.2
22
88
7
71
68
0
12
18
1.20
7585155--7585217
33
1.9
32
84
9
83
66
1
14
17
1.33
7585160--7585207
11
4.4
11
78
0
51
68
0
12
18
1.20
7594033--7594151
21
6.0
20
68
20
63
59
4
0
36
1.17
7594673--7594704
3
10.7
3
93
0
55
68
3
0
28
1.04
7594944--7595067
10
12.5
10
68
13
51
30
0
9
59
1.29
7594958--7594997
21
1.9
21
94
0
71
32
0
7
60
1.25
7595041--7595153
9
12.1
9
69
20
72
32
0
5
61
1.18
7595040--7595085
20
2.3
21
75
17
53
32
0
8
58
1.28
7595091--7595131
19
2.2
19
86
4
66
29
0
2
68
1.03
7607013--7607221
31
6.7
31
84
6
253
26
25
18
28
1.98
7607020--7607221
62
3.3
62
90
0
305
26
25
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7607013--7607221
93
2.2
93
88
1
294
26
25
18
28
1.98
7607199--7607375
50
3.5
50
86
2
239
27
20
15
36
1.93
7612859--7612898
21
1.9
21
89
0
62
57
0
12
30
1.36
7612906--7612946
21
2.0
21
85
0
55
41
9
12
36
1.76
7613020--7613048
14
2.1
14
100
0
58
51
13
0
34
1.42
7614723--7614758
2
18.0
2
100
0
72
0
50
0
50
1.00
7616524--7616554
15
2.1
15
100
0
62
61
0
0
38
0.96
7616574--7616601
11
2.5
11
100
0
56
64
7
0
28
1.20
7616576--7616709
3
42.3
3
69
25
73
64
1
3
30
1.20
7616598--7616721
32
3.9
31
73
22
89
63
0
5
30
1.17
7619711--7619741
15
2.1
15
100
0
62
48
19
19
12
1.81
7623721--7623769
12
4.4
11
89
5
64
73
0
2
24
0.94
7623734--7623813
11
7.3
11
76
8
74
65
0
2
32
1.06
7623730--7623809
21
3.9
21
71
12
67
65
0
2
32
1.06
7623739--7623809
9
8.0
9
74
16
51
63
0
2
33
1.09
7623777--7623840
21
3.0
22
82
11
71
60
0
3
35
1.12
7623707--7623832
23
5.7
22
73
14
82
62
0
3
32
1.19
7624231--7624258
13
2.2
13
100
0
56
46
0
7
46
1.30
7624312--7624338
8
3.4
8
100
0
54
62
0
0
37
0.95
7624311--7624352
22
1.9
22
85
9
59
59
2
0
38
1.10
7624430--7624496
29
2.3
29
81
0
80
38
1
0
59
1.06
7624566--7624604
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7624734--7624765
15
2.0
17
88
11
50
31
3
6
59
1.38
7624863--7624919
27
2.1
28
90
3
89
43
7
7
42
1.58
7624863--7624928
27
2.3
27
84
10
78
46
6
6
40
1.53
7629895--7629982
42
2.1
42
100
0
176
44
2
6
46
1.42
7630223--7630330
55
2.0
55
81
7
130
30
5
11
52
1.59
7631170--7631236
33
2.0
33
100
0
134
52
11
17
17
1.74
7637662--7637753
48
1.9
48
84
4
123
23
16
27
32
1.96
7638550--7638578
11
2.5
12
88
11
51
27
0
0
72
0.85
7639183--7639250
22
3.0
22
81
10
84
41
19
23
16
1.90
7640422--7640510
7
13.3
7
73
17
64
49
1
1
48
1.16
7640431--7640473
20
2.2
20
86
0
59
51
0
2
46
1.13
7641890--7642070
46
3.8
46
73
13
177
19
18
30
30
1.96
7643693--7643742
19
2.6
19
87
0
82
20
32
32
16
1.94
7646410--7646704
38
7.0
38
72
19
212
30
24
15
30
1.96
7646450--7646674
48
4.9
48
78
11
256
30
22
15
31
1.95
7646502--7646704
86
2.4
86
94
0
352
29
24
15
30
1.96
7649796--7649842
19
2.3
20
76
20
53
38
4
17
40
1.69
7651327--7651370
24
1.9
22
86
9
61
34
0
18
47
1.49
7651560--7651686
51
2.4
53
87
6
170
17
21
18
42
1.89
7652322--7652366
20
2.2
20
84
0
54
35
17
2
44
1.62
7654063--7654381
46
6.9
46
88
0
388
39
15
25
20
1.91
7654668--7654700
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7655307--7655364
18
3.2
18
87
0
80
32
18
15
32
1.93
7655377--7655423
18
2.6
18
89
0
67
38
8
6
46
1.60
7657386--7657442
21
2.7
21
97
0
105
28
24
31
15
1.96
7688647--7688700
28
2.0
27
85
3
72
64
3
3
27
1.27
7688764--7688811
20
2.4
21
82
10
64
68
6
2
22
1.23
7693201--7693549
40
8.8
40
82
5
300
25
27
22
24
2.00
7693205--7693549
80
4.3
80
83
4
335
25
26
22
25
2.00
7695400--7695478
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
7695597--7695818
47
4.7
47
90
2
322
27
31
9
32
1.88
7695597--7695818
93
2.4
94
89
2
331
27
31
9
32
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325