Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  43  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15767363--15767503
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2.0
69
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0
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15773534--15773587
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1
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1.66
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2
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1.67
15781384--15781414
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2.6
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0
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0
0.82
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1.99
15782318--15782452
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6
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43
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2.8
28
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2.1
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1.84
15814690--15814971
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5.2
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22
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40
1.84
15814690--15814971
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3.5
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399
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13.1
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82
0
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5.2
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88
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25
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26
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15816028--15816121
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3.1
30
72
9
75
34
21
19
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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16
1.93
15823293--15823326
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2.1
16
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2
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19
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18
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2.1
20
91
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69
7
0
23
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15922054--15922115
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0
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0
0
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0
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80
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60
0
0
39
0.97
15931465--15931520
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0
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2.6
21
84
9
63
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16013376--16013424
18
2.5
19
81
15
55
65
4
12
18
1.41
16016098--16016146
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2.0
25
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64
6
20
2
71
1.18
16017683--16017724
18
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59
11
4
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1.51
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62
2
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2
2
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62
76
0
0
23
0.78
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1.30
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4.0
13
82
15
58
63
0
1
34
1.05
16017874--16017928
28
2.0
28
82
7
67
65
1
0
32
1.03
16018159--16018216
17
3.6
17
71
17
61
18
0
48
32
1.49
16018163--16018227
30
2.2
30
88
0
94
18
0
47
33
1.49
16019599--16019639
21
2.0
21
95
0
73
24
21
29
24
1.99
16020895--16020932
20
1.9
20
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10
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13
23
21
1.88
16022788--16023003
46
4.7
46
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1
317
39
14
24
22
1.91
16029124--16029150
13
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13
100
0
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0
55
1.40
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12
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18
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24
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10
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42
2.0
42
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2
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33
12
15
38
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16036889--16036919
16
2.0
16
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51
6
22
19
1.69
16046148--16046172
6
4.2
6
100
0
50
68
0
0
32
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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5
0
57
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6
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0
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0
0
17
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29
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15
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19
25
13
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19
3.7
19
74
12
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1
1
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0
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0
0
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0.97
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24
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1.96
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40
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7
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25
17
25
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22
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0
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2.3
23
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33
5
3
56
1.41
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2.3
20
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30
2
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1.9
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147
31
4
4
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1.35
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3
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10
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33
0
0
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2
0
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24
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29
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2.3
23
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34
23
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1.90
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20
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0
0
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24
2.0
24
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40
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39
3.6
39
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2
174
30
14
5
50
1.64
16096154--16096197
21
2.1
21
82
0
52
34
25
2
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16097159--16097201
17
2.5
17
88
7
61
76
0
13
9
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16097230--16097268
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2.4
16
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0
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2
1.02
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46
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0
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39
14
23
22
1.91
16099346--16099621
92
3.0
92
91
0
444
39
14
23
22
1.91
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138
2.2
138
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454
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14
23
20
1.90
16099361--16099669
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46
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2
395
41
14
22
21
1.90
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0
0
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302
26
24
28
20
1.99
16101268--16101517
100
2.4
103
87
6
355
26
24
28
20
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325