Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  46  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
16
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
19
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11
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0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17140735--17140857
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28
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0
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1
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3
2
50
1.28
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22
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2
0
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1
0
41
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23
4.1
22
74
13
71
54
1
0
43
1.07
17145313--17145386
37
2.0
37
85
12
100
68
2
5
22
1.23
17145308--17145359
18
2.9
18
80
5
61
67
0
3
28
1.08
17145402--17145453
8
6.1
8
78
10
50
78
0
3
17
0.89
17154735--17154769
2
18.0
2
94
5
63
0
48
0
51
1.00
17161442--17161532
41
2.2
41
96
2
164
28
12
13
46
1.79
17172966--17173005
16
2.3
19
87
12
59
10
2
17
70
1.27
17180391--17180429
3
13.3
3
94
5
71
69
0
30
0
0.89
17192789--17192821
7
4.6
7
92
7
57
84
0
15
0
0.61
17193186--17193417
25
9.5
24
81
9
169
21
23
18
37
1.94
17193235--17193435
47
4.2
47
86
5
278
19
22
18
38
1.94
17193186--17193417
97
2.4
97
87
6
337
21
23
18
37
1.94
17193357--17193434
22
3.4
22
77
10
93
17
24
17
39
1.91
17203552--17203663
51
2.2
51
91
0
179
26
22
11
39
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17206014--17206072
30
1.9
31
86
3
84
47
3
20
28
1.66
17211376--17211412
20
1.9
20
88
5
58
40
0
8
51
1.32
17213572--17213844
46
6.0
46
90
1
361
38
15
24
20
1.92
17213572--17213844
91
3.0
92
87
2
370
38
15
24
20
1.92
17213572--17213844
137
2.0
137
85
1
368
38
15
24
20
1.92
17216006--17216611
131
4.6
130
75
8
415
26
20
17
34
1.95
17229183--17229212
15
1.9
16
93
6
53
53
6
20
20
1.67
17236768--17236805
17
2.1
19
90
9
62
0
23
0
76
0.79
17238146--17238259
42
2.7
41
89
5
158
27
26
15
30
1.96
17238231--17238398
47
3.6
46
86
3
201
29
26
15
27
1.96
17238189--17238398
95
2.3
95
82
8
238
29
26
15
28
1.96
17238420--17238568
31
4.8
31
94
0
244
24
28
20
26
1.99
17238544--17238720
50
3.5
50
90
0
282
25
22
15
36
1.94
17241847--17241871
12
2.1
12
100
0
50
8
8
0
84
0.79
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39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
17243697--17243736
20
2.0
20
85
9
55
2
15
5
77
1.04
17243867--17243934
31
2.3
28
78
9
73
41
2
1
54
1.24
17243913--17243951
21
1.9
20
84
5
51
46
2
0
51
1.14
17248859--17248901
21
2.0
21
82
8
52
23
20
4
51
1.66
17249191--17249215
12
2.1
12
100
0
50
8
8
0
84
0.79
17249874--17249966
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
17251058--17251082
11
2.3
11
100
0
50
8
16
8
68
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17251051--17251097
16
3.2
14
80
11
51
4
14
8
72
1.24
17251239--17251306
31
2.3
28
78
9
73
41
2
1
54
1.24
17251280--17251328
21
2.5
20
80
6
55
48
2
0
48
1.12
17252481--17252541
30
2.1
29
93
3
104
24
14
22
37
1.92
17261256--17261295
19
2.1
19
86
9
55
40
0
0
60
0.97
17264101--17264130
15
2.0
15
93
0
51
30
0
6
63
1.20
17264842--17264877
15
2.6
13
91
8
54
50
0
0
50
1.00
17264754--17264985
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2.0
116
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7
3
48
1.46
17271000--17271039
14
2.9
14
88
7
55
77
0
20
2
0.88
17301024--17301066
14
3.0
14
79
3
50
30
2
6
60
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325