Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  137  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Number
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Indels
Score
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1.96
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0.68
43021342--43021402
28
2.2
28
93
0
104
34
26
8
31
1.86
43021511--43021584
27
2.7
27
77
6
78
20
22
22
33
1.97
43022066--43022104
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
43022704--43022740
11
3.5
11
82
14
51
40
10
0
48
1.38
43022693--43022744
20
2.7
19
85
5
68
42
9
0
48
1.36
43022716--43022747
15
2.1
16
94
5
57
37
9
0
53
1.34
43026060--43026086
12
2.2
12
100
0
54
48
0
7
44
1.31
43028664--43028798
25
5.6
25
78
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25
22
21
30
1.99
43028691--43028798
46
2.3
45
82
7
126
25
22
22
30
1.99
43037157--43037302
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40
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0
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28
25
22
23
1.99
43039789--43039829
18
2.3
18
86
0
64
24
31
2
41
1.68
43050339--43050809
47
9.9
47
94
1
798
32
8
29
29
1.86
43050339--43050809
143
3.3
143
95
0
829
32
8
29
29
1.86
43050339--43050809
190
2.5
191
93
2
799
32
8
29
29
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43050928--43051006
37
2.1
37
88
0
113
24
17
31
26
1.97
43052223--43052489
121
2.2
120
91
3
421
23
22
28
26
1.99
43052223--43052493
40
6.8
40
89
4
411
23
21
28
25
1.99
43054545--43054597
21
2.4
23
81
12
58
45
0
28
26
1.54
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25
3.3
25
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10
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32
5
29
32
1.79
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47
5.9
47
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9
443
32
8
28
30
1.87
43055899--43056185
106
2.8
105
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6
461
32
8
28
30
1.87
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26
2.3
27
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2
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0
26
36
1.57
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2.0
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1
630
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7
28
31
1.84
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4.1
72
70
9
285
33
6
28
30
1.83
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5.7
47
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0
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32
8
30
29
1.86
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1.8
215
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0
746
32
7
28
30
1.86
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37
2.1
37
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0
122
24
18
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25
1.98
43064739--43064815
22
3.5
22
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0
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24
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22
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1.99
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5
6.0
5
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0
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23
1.91
43074524--43074586
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2.0
32
100
0
126
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22
3
44
1.68
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27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
43086753--43086835
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
43086725--43086836
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
43094005--43094102
27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
43094033--43094115
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
43094005--43094116
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43108848--43108895
23
2.0
24
92
4
80
8
10
52
29
1.65
43110088--43110121
15
2.3
15
94
0
59
35
0
8
55
1.31
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67
2.0
67
90
2
211
36
23
17
22
1.95
43117612--43117938
163
2.0
163
89
2
496
40
18
9
31
1.83
43118824--43118853
3
9.7
3
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7
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0
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0
0.92
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2.0
64
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202
28
14
14
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20
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305
24
23
25
26
2.00
43146673--43146774
40
2.6
40
86
10
147
24
23
26
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325