Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  2  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
267444--267548
25
4.2
24
80
13
90
36
19
23
20
1.95
267455--267548
25
3.8
25
85
2
118
36
18
23
22
1.95
275421--275525
25
4.2
24
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13
99
35
19
24
20
1.96
275432--275525
25
3.8
25
88
2
127
35
18
24
22
1.96
283410--283514
25
4.2
24
82
13
99
35
19
24
20
1.96
283421--283514
25
3.8
25
88
2
127
35
18
24
22
1.96
291996--292201
55
3.8
53
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10
193
34
17
26
20
1.95
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12
2.1
12
100
0
50
40
36
8
16
1.77
293534--293598
22
3.0
22
84
8
96
35
50
0
13
1.42
293525--293552
9
3.1
9
100
0
56
35
53
0
10
1.36
293986--294079
3
31.3
3
70
19
56
28
4
1
65
1.18
293986--294083
18
5.6
18
76
15
82
29
4
1
65
1.18
296283--296417
35
3.7
37
76
12
136
32
10
22
34
1.88
303187--303321
35
3.7
37
77
12
136
33
10
22
34
1.88
306807--306983
50
3.5
50
93
3
302
34
16
23
25
1.95
306959--307107
31
4.8
31
91
3
237
26
19
27
26
1.99
307126--307290
47
3.6
47
80
8
164
30
15
25
29
1.96
307226--307333
42
2.6
42
82
7
121
32
15
24
27
1.95
312652--312677
6
4.3
6
100
0
52
34
0
34
30
1.58
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29
2.6
29
73
2
78
56
10
4
29
1.52
331868--331922
24
2.3
23
78
9
65
58
5
1
34
1.32
341062--341093
2
16.0
2
100
0
64
50
50
0
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
345158--345249
48
1.9
48
95
0
166
19
30
8
41
1.82
353857--353886
6
5.0
6
100
0
60
16
0
0
83
0.65
354075--354115
19
2.0
19
86
13
55
43
4
2
48
1.37
354558--354589
16
2.0
16
100
0
64
43
25
6
25
1.77
355925--355982
21
2.8
21
77
15
57
17
37
36
8
1.80
356794--356994
103
2.0
99
89
7
309
37
11
0
49
1.46
370129--370172
21
2.0
23
82
8
56
56
4
0
38
1.20
375046--375098
20
2.7
19
82
2
52
45
1
1
50
1.23
375099--375155
30
1.9
30
82
13
73
47
1
0
50
1.11
375480--375548
31
2.2
31
84
5
95
55
7
17
20
1.65
377484--377658
46
3.8
45
76
7
154
27
29
21
21
1.99
381393--381654
43
6.1
43
89
0
375
12
22
32
32
1.92
381984--382110
45
2.9
44
83
10
154
24
23
27
24
2.00
385344--385571
46
5.0
46
91
1
332
21
23
14
39
1.91
386374--386405
16
2.0
16
93
0
55
28
18
6
46
1.73
392621--392713
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
393069--393113
3
15.0
3
80
0
54
57
6
0
35
1.25
393069--393115
18
2.6
18
93
0
76
55
8
0
36
1.31
393073--393113
12
3.4
12
93
0
64
56
7
0
36
1.27
393814--393848
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
393854--393894
14
2.6
17
85
14
61
53
0
0
46
1.00
393849--393894
14
3.0
15
84
12
58
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
393874--393917
12
3.7
11
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14
52
45
2
0
52
1.13
393875--393927
24
2.2
24
83
6
63
49
1
0
49
1.12
394813--394848
15
2.4
15
90
0
54
2
16
8
72
1.21
394847--394931
23
3.9
21
72
23
77
49
1
0
49
1.08
394851--394930
19
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20
73
20
58
50
1
0
48
1.08
395816--395850
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
395854--395931
15
4.9
17
65
22
53
50
1
0
48
1.09
395856--395896
14
2.6
17
85
14
61
53
0
0
46
1.00
395876--395914
12
3.4
11
80
13
51
46
2
0
51
1.14
395850--395930
24
3.4
24
77
13
87
49
1
0
49
1.08
396799--396846
25
1.9
25
95
0
87
4
16
8
70
1.27
396823--396857
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
396861--396938
15
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1
0
48
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396863--396903
14
2.6
17
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14
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53
0
0
46
1.00
396883--396921
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11
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2
0
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1.14
396857--396937
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13
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1
0
49
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401838--401880
21
2.0
21
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20
4
51
1.66
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37
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98
27
29
22
20
1.98
403160--403225
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2.7
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22
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0
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403368--403414
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18
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8
0
36
1.31
403372--403412
12
3.4
12
93
0
64
56
7
0
36
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
404150--404227
15
4.9
17
65
22
53
50
1
0
48
1.09
404152--404192
14
2.6
17
85
14
61
53
0
0
46
1.00
404172--404210
12
3.4
11
80
13
51
46
2
0
51
1.14
404146--404226
24
3.4
24
77
13
87
49
1
0
49
1.08
408346--408388
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7.3
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15
54
79
2
0
18
0.85
408337--408388
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2.9
18
83
16
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75
1
0
23
0.91
408337--408391
13
4.5
13
80
17
57
74
1
0
23
0.91
408338--408393
10
5.2
10
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14
58
76
1
0
21
0.87
408338--408393
23
2.5
23
88
5
80
76
1
0
21
0.87
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18
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18
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24
70
49
3
2
44
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0
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20
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0
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1.12
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15
2.7
15
88
7
55
25
5
2
67
1.23
436246--436332
18
4.7
18
70
13
61
55
3
3
37
1.34
436647--436681
17
2.0
18
88
5
54
25
2
0
71
1.00
456748--456784
19
1.9
19
88
0
56
59
0
27
13
1.35
458105--458156
25
2.1
25
88
0
77
36
7
15
40
1.76
459695--459850
42
3.7
43
76
12
169
24
19
25
30
1.98
459675--459850
42
4.1
42
74
13
146
25
19
25
29
1.99
459675--459850
85
2.1
85
92
0
289
25
19
25
29
1.99
461618--461642
13
1.9
13
100
0
50
0
20
0
80
0.72
470845--470928
28
3.0
28
87
1
123
46
29
3
20
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
473447--473480
17
2.1
16
88
5
50
2
14
5
76
1.09
473469--473519
14
3.6
14
76
7
50
17
13
0
68
1.21
473669--473705
14
2.4
17
86
13
53
51
0
0
48
1.00
474696--474739
23
2.0
22
86
4
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77
2
9
11
1.08
475709--475773
23
2.8
23
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2
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7
7
40
44
1.62
481658--481710
20
2.7
20
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8
65
41
0
5
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1.25
482154--482209
22
2.5
22
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11
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82
1
7
8
0.92
482681--482727
25
1.9
24
86
4
67
46
0
4
48
1.21
483193--483257
23
2.8
23
97
2
121
7
7
40
44
1.62
485424--485593
53
3.2
53
81
8
202
25
25
16
32
1.96
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183
2.0
183
94
0
626
35
9
22
33
1.86
489478--489523
23
2.0
23
100
0
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8
8
43
1.66
493705--493746
5
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5
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10
50
73
0
21
4
1.01
498980--499243
101
2.6
101
96
0
483
29
23
15
32
1.95
498983--499243
51
5.2
51
90
1
400
29
22
15
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1.95
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101
2.6
101
95
0
474
29
22
15
32
1.95
505767--506027
51
5.2
51
89
1
391
29
22
15
32
1.95
511591--511648
21
2.8
21
97
0
107
29
34
8
27
1.87
517249--517301
27
2.0
27
82
10
65
54
5
3
35
1.42
527684--527709
13
2.0
13
100
0
52
23
15
15
46
1.83
533383--533412
9
3.3
9
100
0
60
0
0
20
80
0.72
537807--537845
18
2.2
18
86
9
53
66
0
5
28
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
545742--545897
54
2.8
54
85
7
183
38
19
17
23
1.93
550092--550124
15
2.2
15
89
10
50
39
3
18
39
1.66
550876--550915
18
2.3
18
95
4
73
32
15
0
52
1.43
551932--551977
20
2.4
19
80
16
51
39
6
0
54
1.26
552366--552435
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2.4
29
84
11
83
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1
2
37
1.22
552394--552444
7
7.1
7
86
4
75
58
0
0
41
0.98
552394--552444
22
2.4
22
90
3
77
58
0
0
41
0.98
552367--552441
14
5.2
14
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9
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1
2
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1.20
558009--558040
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100
0
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0
0
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17
2.1
17
88
5
52
38
2
0
58
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325