Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  61  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22022715--22022799
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22106956--22107065
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1
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1
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2.5
25
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18
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2.3
44
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3
136
31
18
14
35
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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4
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1.36
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2.0
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2
0
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2.4
24
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28
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1
66
1.18
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22221941--22221992
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4.7
11
74
9
52
63
3
0
32
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22222576--22222630
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19
2.3
19
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54
62
4
0
33
1.15
22235538--22235564
13
2.1
13
100
0
54
22
29
33
14
1.94
22238007--22238090
16
5.5
15
69
19
57
34
1
2
61
1.16
22238002--22238072
29
2.4
29
78
17
76
33
1
1
63
1.12
22238352--22238392
16
2.4
18
80
12
50
26
4
0
68
1.10
22249549--22249594
23
2.0
23
82
0
56
17
0
4
78
0.91
22249565--22249628
24
3.0
21
80
19
62
23
0
6
70
1.10
22255167--22255197
14
2.2
14
100
0
62
12
19
6
61
1.53
22262884--22262952
27
2.4
28
79
15
79
39
36
5
18
1.75
22264007--22264037
12
2.6
12
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0
53
0
25
0
74
0.82
22264117--22264147
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
22264858--22264925
26
2.6
26
77
9
68
22
11
1
64
1.34
22265092--22265143
18
2.9
17
81
13
52
34
3
1
59
1.27
22265735--22265789
17
3.2
17
76
7
58
32
10
7
49
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22276234--22276650
73
5.7
72
89
3
611
29
17
22
30
1.96
22276234--22276690
222
2.1
219
86
5
650
29
16
22
31
1.96
22276608--22276841
88
2.7
88
79
4
240
28
17
20
33
1.95
22276946--22276999
21
2.6
21
81
0
63
29
12
31
25
1.93
22278683--22278900
3
71.3
3
64
20
53
29
5
4
60
1.40
22279432--22279486
17
3.2
18
84
7
78
30
12
9
47
1.73
22283497--22283934
219
2.0
219
96
0
806
28
8
5
57
1.51
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.1
24
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0
73
22
22
12
44
1.85
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28
2.1
27
87
9
80
49
0
0
50
1.00
22293297--22293382
18
4.2
20
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16
52
47
2
0
50
1.14
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17
2.1
17
89
0
54
16
2
2
77
1.00
22296927--22296969
22
1.9
23
86
13
63
32
0
2
65
1.06
22298998--22299090
31
3.2
27
75
10
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46
1
3
49
1.25
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17
2.7
20
78
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10
0
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1.37
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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7.8
10
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26
50
31
0
1
66
1.00
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9
13.9
9
68
18
67
28
0
2
68
1.08
22305631--22305754
24
5.2
24
72
21
91
29
2
0
67
1.08
22305586--22305699
17
6.6
17
71
17
60
28
0
2
68
1.09
22305619--22305755
9
15.7
9
71
20
71
29
2
0
67
1.07
22311800--22311894
45
2.1
45
96
0
172
29
8
10
51
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22315493--22315526
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
22320121--22320154
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
22321447--22321480
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
22326075--22326108
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
22329320--22329357
5
7.4
5
88
5
58
15
2
0
81
0.80
22342128--22342167
17
2.4
16
80
8
53
47
10
15
27
1.77
22342180--22342287
18
6.5
17
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20
50
47
12
12
26
1.78
22343715--22343850
30
4.5
30
80
0
155
46
2
20
30
1.63
22343706--22343850
60
2.5
60
82
2
177
47
2
19
31
1.61
22346677--22346770
35
2.7
34
74
11
84
32
8
0
58
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325