Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  250  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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79249615--79249714
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20
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5
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1.50
79263347--79263427
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0
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43
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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5
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0
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29
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31
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.9
100
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1.99
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25
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1.99
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2.7
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20
27
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1.98
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2.1
94
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226
29
19
27
22
1.98
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2.2
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85
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139
28
22
27
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1.99
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286
30
19
16
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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5
57
1.53
79491425--79491457
16
2.0
17
88
5
50
45
6
0
48
1.27
79491690--79491731
23
1.9
23
85
9
61
47
7
2
42
1.43
79492450--79492483
17
2.0
17
100
0
68
35
0
23
41
1.55
79494156--79494195
21
1.9
21
90
10
64
57
5
2
35
1.34
79496538--79496770
49
4.7
50
83
3
283
25
18
26
29
1.98
79496545--79496729
100
1.8
100
89
1
289
25
19
25
28
1.99
79513750--79513884
49
2.7
50
84
4
157
29
26
18
25
1.98
79520124--79520201
27
2.9
27
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7
70
44
15
11
28
1.81
79528321--79528411
28
3.2
28
75
9
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26
24
15
34
1.95
79528322--79528439
57
2.1
57
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157
25
24
15
34
1.94
79528337--79528433
29
3.4
29
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11
92
26
25
15
31
1.96
79528629--79528838
53
4.0
53
85
2
287
28
24
12
35
1.91
79535897--79535929
17
1.9
17
88
11
50
42
0
15
42
1.46
79545842--79546017
46
3.8
46
77
12
189
21
21
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79548956--79549124
90
1.9
90
83
2
223
28
26
19
25
1.99
79548955--79549214
90
2.8
90
76
6
218
26
27
21
25
1.99
79551787--79551850
25
2.6
25
85
5
76
59
1
1
37
1.16
79561134--79561260
33
3.8
33
72
12
82
28
26
19
25
1.99
79561206--79561281
33
2.3
33
88
0
107
30
27
17
25
1.97
79571369--79571413
22
2.1
22
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4
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31
11
4
53
1.56
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21
2.0
21
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0
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0
27
1.56
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42
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2
156
29
18
24
27
1.98
79605966--79606011
21
2.5
17
75
24
56
47
2
19
30
1.61
79605972--79606013
21
2.0
21
100
0
84
47
4
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1.65
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20
2.5
20
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3
62
62
2
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27
1.35
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17
2.4
18
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14
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56
9
0
34
1.31
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15
2.2
15
100
0
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12
0
39
1.40
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16
3.4
16
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0
1
24
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79609283--79609358
28
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0
1
26
0.93
79609284--79609358
22
3.5
22
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15
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72
0
1
26
0.93
79609295--79609358
11
5.7
11
85
14
87
71
0
1
26
0.94
79609309--79609358
6
9.0
6
85
14
72
72
0
0
28
0.86
79611136--79611308
46
3.7
46
76
10
190
22
21
26
29
1.99
79611134--79611303
93
1.8
93
92
0
286
22
21
27
28
1.99
79638957--79639027
33
2.2
33
84
5
90
35
23
21
19
1.96
79639300--79639419
33
3.6
33
74
6
91
32
28
15
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79638623--79639808
651
1.8
646
83
3
1484
30
26
19
23
1.98
79649493--79649584
11
8.5
11
71
8
64
19
5
5
69
1.28
79661506--79661557
26
2.0
26
100
0
104
19
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19
46
1.85
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15
2.1
15
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0
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29
0
6
64
1.18
79667591--79667651
30
2.0
30
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0
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39
6
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31
1.80
79676222--79676252
15
2.1
15
93
0
53
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6
0
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1.18
79676740--79676768
14
2.1
14
93
6
51
48
6
0
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1.29
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18
2.4
17
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2
4
39
1.34
79679417--79679511
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2.0
47
97
0
181
38
7
12
41
1.71
79680239--79680301
32
2.0
32
100
0
126
26
9
15
47
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325