Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  45  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16681660--16681707
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15
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113
36
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0
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41
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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16809141--16809215
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12.2
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1.03
16823809--16823884
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75
16
77
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2
22
1
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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18
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1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16885202--16885227
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0
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1
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33
1.58
16891249--16891423
46
3.8
46
77
13
187
20
19
29
30
1.97
16891246--16891416
93
1.8
93
91
0
279
20
19
29
29
1.97
16893312--16893455
43
3.3
43
69
12
123
23
18
24
34
1.96
16893316--16893496
87
2.1
86
86
2
254
22
18
23
35
1.96
16893494--16893857
133
2.7
133
81
6
470
25
22
22
29
1.99
16893683--16894124
179
2.5
178
89
2
706
24
22
22
30
1.99
16895370--16895425
24
2.4
24
76
5
62
1
23
3
71
1.11
16895405--16895446
12
3.4
12
80
6
57
0
23
0
76
0.79
16895377--16895445
24
2.8
24
84
6
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1
20
2
75
1.01
16895384--16895447
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13
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0
21
1
76
0.87
16897967--16898007
21
2.0
21
90
0
64
14
24
21
39
1.91
16901519--16901887
125
2.9
126
95
0
659
38
14
17
29
1.90
16901988--16902037
13
4.2
12
80
14
52
68
0
4
28
1.08
16902341--16902371
14
2.2
14
94
0
53
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16902343--16902379
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2.0
18
94
5
65
67
0
0
32
0.91
16902765--16902800
18
2.0
18
100
0
72
16
0
55
27
1.42
16902783--16902882
29
3.2
29
83
13
103
17
1
50
32
1.53
16902779--16902853
37
2.0
37
97
0
141
16
0
53
30
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4.4
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19
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23
30
1.98
16906833--16907014
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2.1
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238
22
18
23
35
1.96
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2.6
133
84
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23
21
28
1.99
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179
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2
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23
22
30
1.99
16907261--16907549
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12
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24
23
24
27
2.00
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2.4
29
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7
97
17
1
48
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1.56
16914889--16914926
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1.9
20
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23
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1.88
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6.0
46
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0
433
37
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24
23
1.92
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2.5
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5
83
36
15
18
29
1.92
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33
2.4
33
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28
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25
30
1.96
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1.8
105
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30
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27
1.96
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4
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0
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10
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70
0
30
0
0.88
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2.2
18
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8
64
70
0
29
0
0.87
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13
2.0
13
100
0
52
38
0
15
46
1.46
16939166--16939213
19
2.5
20
74
16
55
58
0
8
33
1.28
16939329--16939353
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
16939379--16939406
6
4.7
6
100
0
56
14
14
17
53
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16939575--16939642
18
3.7
18
80
2
73
30
7
14
47
1.72
16944285--16944314
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
16945963--16946015
27
2.0
27
96
0
97
62
0
7
30
1.23
16945972--16946013
22
1.9
22
85
9
59
64
0
4
30
1.14
16957835--16958113
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8.0
35
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6
305
31
23
15
29
1.96
16957841--16958116
105
2.6
105
90
0
435
31
23
15
28
1.95
16960179--16960215
14
2.4
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53
48
0
0
51
1.00
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0
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17
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2.1
16
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5
50
76
5
14
2
1.09
16961525--16961620
39
2.5
39
80
6
108
20
23
28
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325