Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  114  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36078146--36078253
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0
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4.2
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180
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2.6
12
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2.0
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1.75
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2.9
13
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51
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2
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22
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2.0
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7
161
29
25
18
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1.98
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3.7
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2
143
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14
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1.95
36129086--36129144
19
3.3
18
70
15
50
64
1
1
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2.2
23
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1.9
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29
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1.98
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12
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26
3.8
26
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23
20
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1.99
36141766--36141864
26
3.9
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16
86
28
24
20
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1.99
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20
1.98
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3.9
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2.3
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22
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38
1.83
36143559--36143746
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6.9
27
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2
214
30
22
7
38
1.83
36143642--36144051
27
15.1
27
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1.83
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2.1
81
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2.6
80
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247
42
21
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28
1.80
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56
2.1
54
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6
139
44
16
9
30
1.79
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27
2.9
27
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11
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2.2
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0
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39
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28
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2.0
17
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80
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22
19
32
1.97
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2.6
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18
2
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1.25
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59
1.9
59
90
0
181
22
13
34
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.55
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1.84
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2.4
18
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38
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1.51
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83
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1
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1.60
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4
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2
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1.30
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24
2.0
24
95
0
85
40
2
4
53
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36190479--36190597
24
5.1
21
72
22
71
35
5
4
54
1.44
36190537--36190595
25
2.5
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3
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6
2
57
1.39
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24
2.3
26
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37
6
3
52
1.45
36190893--36190948
24
2.3
25
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37
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1
51
1.44
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16
4.1
16
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19
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33
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1
60
1.26
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18
2.3
18
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35
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3
28.0
3
68
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50
28
5
1
64
1.24
36195857--36195918
30
2.1
30
93
0
106
29
3
9
58
1.46
36197727--36197791
34
2.0
34
84
6
89
20
10
6
63
1.48
36203404--36203599
69
2.8
69
94
0
329
33
9
37
19
1.84
36204981--36205040
30
2.0
30
96
0
111
30
31
1
36
1.68
36207401--36207444
20
2.2
20
84
11
56
56
2
27
13
1.49
36207505--36207544
21
1.9
21
100
0
80
37
17
25
20
1.94
36210401--36210488
39
2.5
33
72
16
86
63
0
2
34
1.07
36210414--36210474
20
3.1
20
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13
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60
0
3
36
1.13
36210505--36210564
23
2.6
23
97
0
111
58
3
1
36
1.25
36210479--36210564
23
3.8
22
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8
86
54
2
2
40
1.26
36211266--36211294
11
2.5
12
94
5
51
79
0
0
20
0.74
36211882--36211914
9
3.8
9
88
4
50
33
0
9
57
1.30
36211926--36212057
65
2.0
64
87
7
187
37
4
6
51
1.49
36212100--36212151
24
2.1
25
82
7
61
36
0
7
55
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36215723--36215803
22
3.6
23
83
9
89
55
2
2
39
1.26
36216502--36216530
11
2.5
12
94
5
51
79
0
0
20
0.74
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26
1.9
26
84
8
66
32
2
12
54
1.49
36217101--36217142
20
2.0
21
86
4
59
33
0
9
57
1.31
36217192--36217231
21
1.9
21
89
0
62
37
2
2
57
1.26
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19
2.2
21
80
11
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75
0
2
22
0.92
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16
2.3
16
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9
58
62
2
0
35
1.10
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25
2.6
22
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4
3
35
1.37
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12
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0
0
19
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0
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13
18
1.88
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3.8
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72
16
224
28
16
22
32
1.96
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143
2.0
144
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345
26
17
22
33
1.96
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16.6
87
76
11
988
26
18
20
34
1.95
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2.2
14
100
0
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12
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6
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1.53
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5.2
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1.96
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2.8
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26
18
20
33
1.96
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75
3.0
74
86
5
331
27
18
23
30
1.97
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14
2.5
14
90
0
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17
20
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15
2.2
15
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0
57
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69
1.24
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3.4
27
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33
4
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52
1.53
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21
1.9
21
89
0
62
37
2
2
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1.26
36238645--36238695
24
2.1
25
88
3
77
33
0
9
56
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36239759--36239950
10
19.8
10
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18
77
32
4
2
60
1.27
36239829--36239882
18
3.1
17
80
17
65
33
1
0
64
1.04
36239821--36239950
10
13.4
10
71
11
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33
3
0
62
1.16
36239821--36239938
30
4.0
29
76
7
105
32
3
0
63
1.17
36253825--36253878
26
2.1
26
86
6
74
61
5
5
27
1.41
36253902--36253949
19
2.9
16
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14
53
70
4
8
16
1.27
36253961--36254318
3
118.3
3
66
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114
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2
8
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11
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2
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4
0
38
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1.18
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2.5
17
80
0
50
4
0
41
53
1.21
36255764--36255876
45
2.6
42
73
9
111
29
24
16
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325