Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  323  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101778110--101778274
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1.8
90
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2
206
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20
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101778295--101778408
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101783241--101783316
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2.9
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1
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1.23
101783271--101783313
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3.8
11
80
17
52
30
2
2
65
1.18
101783274--101783317
23
1.9
23
90
0
70
31
2
4
61
1.28
101792854--101792895
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2.5
17
88
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59
61
0
2
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2.0
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0
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0
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1.20
101794250--101794296
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20
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10
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35
0
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101796389--101796480
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82
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1
1
50
1.15
101796387--101796480
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1
1
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1
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2.0
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1
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2.0
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1.9
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80
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28
1.85
101837975--101838151
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182
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19
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31
1.97
101840437--101840470
6
5.7
6
100
0
68
17
50
17
14
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101844729--101844833
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2.0
53
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1
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0
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1.50
101844752--101844832
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3.1
25
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16
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33
18
0
48
1.49
101845105--101845181
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7
51
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101845091--101845190
48
2.1
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101845866--101845901
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101845887--101845982
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1.86
101847258--101847365
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2.1
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23
36
1.86
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12
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1.42
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2.3
21
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0
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10
10
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53
61
4
0
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1.15
101865927--101865994
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2.5
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75
55
4
0
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1.20
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9
59
52
2
0
44
1.15
101865917--101865967
20
2.6
20
90
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77
60
5
0
33
1.21
101865917--101865979
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19
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67
58
4
0
36
1.19
101865948--101866017
16
4.2
16
75
10
68
52
2
0
44
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101865936--101866041
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3.0
35
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2
0
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1.15
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21
2.1
21
100
0
88
0
34
18
47
1.49
101866848--101866886
15
2.6
15
83
0
51
0
33
23
43
1.54
101871184--101871238
18
2.9
18
79
17
51
50
0
5
43
1.25
101877980--101878061
3
27.7
3
80
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87
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2
6
29
1.32
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2.4
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2
71
64
7
13
14
1.49
101879048--101879080
15
2.2
15
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10
50
6
6
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11
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19
30
1.98
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19
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1.97
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23
23
23
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1.99
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101927898--101928035
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22
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1.99
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293
29
20
23
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101928317--101928571
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29
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1.99
101928368--101928606
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20
23
27
1.99
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2.1
21
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2.1
26
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0
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14
12
37
1.85
101945841--101945875
17
2.0
18
88
5
54
65
0
2
31
1.07
101952787--101952970
38
4.7
37
71
17
140
44
1
3
51
1.27
101952834--101952987
18
8.9
18
66
18
76
42
0
2
54
1.19
101952796--101952987
56
3.3
55
74
19
208
43
1
3
52
1.24
101952769--101953070
120
2.5
120
97
0
568
43
0
4
51
1.28
101953326--101953367
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
101953317--101953358
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
101953470--101953504
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
101953303--101953617
157
2.0
157
96
0
576
47
4
3
44
1.40
101953650--101953759
45
2.6
42
77
11
109
33
28
5
32
1.80
101953740--101953791
16
3.2
16
88
0
86
38
36
0
25
1.56
101959916--101959978
31
2.0
31
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0
108
23
17
17
41
1.90
101966340--101966695
131
2.7
131
83
1
419
30
17
18
34
1.94
101971230--101971261
16
2.0
16
100
0
64
50
6
6
37
1.53
101977604--101977633
12
2.5
12
94
0
51
26
0
0
73
0.84
101977754--101977813
30
2.0
29
87
3
84
56
11
5
26
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101977847--101977889
22
2.0
22
86
9
61
58
13
9
18
1.62
101979439--101979468
15
2.0
15
93
0
51
76
0
0
23
0.78
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24
4.3
24
72
12
63
67
0
0
30
1.03
101979439--101979525
40
2.2
38
86
12
113
67
0
1
31
0.98
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15
3.1
15
84
0
67
40
0
4
55
1.19
101979874--101979913
21
1.9
21
89
0
62
37
32
12
17
1.87
101988225--101988283
10
5.9
10
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11
50
57
0
0
42
0.98
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1.9
22
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9
59
59
0
0
40
0.97
101988206--101988311
40
2.6
42
73
10
96
60
0
4
34
1.18
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17
2.0
17
88
0
50
20
5
0
73
1.04
101989760--101989860
43
2.3
43
85
6
125
24
15
23
35
1.94
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20
2.8
20
84
7
69
26
3
3
66
1.24
101991751--101991793
20
2.2
20
86
0
59
30
16
23
30
1.96
101999316--101999362
7
6.7
7
83
9
51
65
4
4
25
1.29
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12
2.2
12
100
0
52
26
7
30
34
1.85
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22
2.2
22
88
0
69
10
4
16
68
1.33
102016885--102016932
19
2.5
20
80
16
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52
39
4
4
1.40
102018068--102018117
3
16.3
3
91
4
82
34
2
0
64
1.05
102018147--102018211
28
2.3
29
75
19
66
33
3
7
55
1.44
102018417--102018456
17
2.4
17
82
0
53
40
0
2
57
1.12
102030550--102030791
46
5.7
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17
174
30
21
21
26
1.98
102030550--102031216
44
15.9
43
70
12
336
29
19
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102030756--102031086
126
2.6
124
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7
456
29
19
22
29
1.98
102030883--102031210
170
1.9
170
90
4
518
28
19
22
29
1.98
102030931--102031212
82
3.4
81
72
12
239
28
18
23
29
1.98
102042588--102042886
88
3.4
86
69
14
234
31
19
21
28
1.97
102042541--102042965
175
2.4
175
87
2
597
30
19
22
28
1.98
102042765--102043090
129
2.5
129
89
2
483
30
18
21
30
1.97
102042894--102043229
175
1.9
175
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0
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19
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28
1.98
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2.4
304
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0
1244
30
18
21
28
1.97
102043065--102043384
129
2.5
129
91
0
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29
19
21
29
1.98
102043846--102043893
19
2.5
20
80
16
57
52
39
4
4
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325