Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  59  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21507959--21508064
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19
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18
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0
1
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1.14
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1.46
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72
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0
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2.0
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0
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0
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10
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1.92
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14
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2.3
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0
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2.2
26
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20
2.0
22
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45
0
0
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2.0
16
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58
0
3
38
1.15
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15
5.1
15
73
17
61
50
1
2
45
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
65
90
0
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2.2
12
100
0
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19
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44
2.6
44
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2
149
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13
22
27
1.92
21555237--21555370
46
3.0
45
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4
153
35
14
23
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32
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26
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19
50
1.65
21557419--21557479
32
1.9
32
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22
2.0
22
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28
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68
2.1
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200
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4.2
14
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1.74
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29
2.3
29
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84
38
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5
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1.69
21558936--21559002
14
4.6
14
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10
57
38
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1.69
21559626--21559664
20
1.9
20
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10
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2.0
42
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4
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2.2
28
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5
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1.59
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15
2.5
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0
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0.94
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2.0
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11
2
35
1.53
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3.2
19
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22
61
51
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37
2.1
37
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4.0
48
81
8
196
23
17
28
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.0
21
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0
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4
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22
1.9
22
90
0
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7
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38
1.28
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4.2
16
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27
0
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44
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136
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27
32
1.79
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124
1.8
127
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396
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3
3
47
1.36
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54
0
0
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125
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2
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0
0
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1.40
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11
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0
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1.70
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1.41
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21616970--21617004
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0
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1.79
21617365--21617416
16
3.2
16
94
0
86
34
36
0
28
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21619666--21619690
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0
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0
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0.80
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2.5
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13
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4
0
35
1.16
21619670--21619741
31
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61
2
0
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1.11
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17
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3
144
29
23
13
33
1.93
21638184--21638245
28
2.2
28
80
13
74
48
19
0
32
1.49
21638649--21638735
38
2.3
39
83
2
104
32
31
19
17
1.95
21638700--21638751
23
2.3
23
89
0
77
36
30
17
15
1.91
21638662--21638785
62
2.0
61
83
7
153
36
31
16
15
1.90
21641513--21641576
33
1.9
33
81
6
76
28
23
29
18
1.98
21641699--21641818
46
2.6
46
82
2
134
45
14
22
18
1.85
21641906--21641948
13
3.3
13
76
0
50
34
2
25
37
1.69
21641906--21641987
26
3.1
26
76
15
71
39
4
20
35
1.74
21649382--21649598
46
4.6
46
79
10
183
28
18
30
22
1.97
21649474--21649649
97
1.8
94
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8
221
28
19
30
21
1.97
21651699--21651739
18
2.3
18
82
0
55
48
4
4
41
1.46
21654682--21654727
22
2.1
22
83
0
56
50
0
0
50
1.00
21654730--21654776
16
2.9
16
81
12
60
53
0
0
46
1.00
21655324--21655374
19
2.6
21
78
15
63
52
1
0
45
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21655324--21655369
20
2.3
20
85
14
60
56
2
0
41
1.11
21660273--21660361
46
1.9
46
97
0
169
41
13
5
39
1.68
21670699--21670797
51
1.9
51
95
0
180
44
10
9
36
1.70
21670903--21670961
28
2.1
28
100
0
118
27
18
16
37
1.93
21672047--21672088
21
2.0
21
81
9
50
40
4
7
47
1.52
21692795--21692847
23
2.4
22
78
12
56
41
3
1
52
1.30
21694721--21695159
222
2.0
222
99
0
869
28
20
15
35
1.93
21698634--21698673
21
1.9
21
84
0
53
32
5
5
57
1.42
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3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
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11
2.3
11
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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17
2.0
16
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11
50
70
8
17
2
1.25
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17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
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46
6.0
46
91
1
358
22
22
14
40
1.90
21717441--21717713
92
3.0
92
90
1
395
22
22
14
40
1.90
21721068--21721135
36
1.9
35
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55
1
5
36
1.33
21721124--21721179
9
5.9
9
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16
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67
1
1
28
1.10
21721348--21721402
20
2.8
19
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8
67
29
1
7
61
1.33
21721413--21721475
30
2.1
30
85
8
85
36
1
0
61
1.05
21722532--21722587
3
19.3
3
80
7
62
66
1
28
3
1.19
21722532--21722589
11
5.1
11
80
14
64
65
1
29
3
1.19
21724126--21724191
26
2.5
27
78
11
84
53
6
4
36
1.46
21724165--21724207
20
2.2
20
100
0
86
55
4
4
34
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21724143--21724243
46
2.2
46
82
8
127
59
3
2
33
1.31
21724176--21724218
11
4.1
11
76
11
54
55
6
2
34
1.39
21724139--21724301
45
3.6
45
67
24
103
57
6
2
33
1.38
21724223--21724322
20
4.8
20
70
21
64
58
9
2
31
1.41
21724275--21724326
20
2.4
21
84
15
70
57
5
1
34
1.33
21724334--21724388
25
2.1
27
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6
78
54
9
5
30
1.54
21724397--21724430
14
2.3
15
90
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52
55
0
8
35
1.31
21724450--21724514
3
21.7
3
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12
53
60
4
4
30
1.37
21724450--21724514
15
4.3
15
79
12
71
60
4
4
30
1.37
21724862--21724997
3
45.0
3
66
17
50
61
3
3
31
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325