Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  51  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18595859--18595899
20
2.1
20
86
4
57
70
0
7
21
1.11
18595974--18596031
15
3.7
15
81
11
55
63
3
12
20
1.42
18596020--18596067
25
2.0
24
83
4
60
64
0
10
25
1.25
18599976--18600014
17
2.3
17
86
8
53
0
30
2
66
1.05
18599985--18600044
25
2.3
26
81
16
72
3
26
3
66
1.23
18607620--18607821
39
5.2
39
90
2
325
14
24
21
38
1.92
18610784--18610823
12
3.5
11
83
10
53
70
0
30
0
0.88
18610789--18610829
19
2.2
18
91
8
64
70
0
29
0
0.87
18612362--18612386
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
18612425--18612542
53
2.2
53
92
0
191
16
18
22
41
1.90
18612418--18612551
53
2.4
58
79
13
170
17
18
21
42
1.89
18612673--18612707
18
1.9
18
94
0
61
37
14
17
31
1.89
18612753--18612793
18
2.3
18
86
0
55
36
12
17
34
1.87
18614812--18614853
21
2.0
21
81
9
50
19
26
0
54
1.44
18616607--18616645
17
2.3
17
86
8
53
0
30
0
69
0.89
18616616--18616696
21
3.7
20
74
20
63
3
24
2
69
1.17
18619374--18619437
21
3.0
21
78
17
60
73
4
12
9
1.23
18619404--18619472
4
17.0
4
75
19
63
72
2
23
1
1.06
18619402--18619471
33
2.1
34
89
2
106
74
2
21
1
1.03
18619391--18619472
29
2.9
28
77
15
87
73
2
20
3
1.11
18619404--18619483
20
4.0
20
79
12
74
70
2
26
1
1.08
18620623--18620669
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18620976--18621317
46
8.0
44
84
10
360
22
25
16
36
1.94
18621109--18621306
38
5.0
38
88
9
306
23
25
17
32
1.97
18621066--18621306
122
2.0
122
97
0
455
23
25
17
33
1.96
18621147--18621317
84
2.0
84
97
0
324
23
25
16
33
1.96
18634103--18634149
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
18634410--18634705
46
6.8
47
84
10
294
21
24
15
38
1.92
18634543--18634702
38
4.0
38
86
11
239
23
25
17
33
1.96
18636433--18636480
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
18640000--18640295
39
7.5
39
94
1
486
29
29
23
18
1.97
18642231--18642269
6
6.5
6
90
0
60
15
5
0
79
0.90
18652638--18652803
53
3.1
53
87
6
212
26
15
28
30
1.96
18658923--18658987
32
2.0
32
100
0
130
27
9
15
47
1.76
18665133--18665191
30
2.0
30
90
6
93
22
37
0
40
1.54
18669008--18669039
13
2.5
13
94
0
55
18
43
28
9
1.81
18671016--18671070
23
2.4
23
79
14
60
38
27
0
34
1.57
18671542--18671655
21
5.5
21
78
6
117
43
15
24
15
1.86
18674038--18674074
17
2.2
17
95
0
65
29
16
21
32
1.95
18674045--18674079
17
2.1
17
94
0
61
22
22
20
34
1.97
18674477--18674506
14
2.1
15
93
6
53
23
0
0
76
0.78
18674510--18674565
24
2.4
24
88
5
80
46
0
1
51
1.11
18674518--18674590
13
5.6
13
75
19
64
42
1
2
53
1.23
18674509--18674590
13
6.7
12
75
16
55
42
1
2
53
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18674568--18674622
22
2.6
21
85
8
67
36
1
1
60
1.18
18674688--18674726
14
2.8
14
100
0
78
35
0
5
58
1.20
18675010--18675052
18
2.3
19
92
8
70
41
0
6
51
1.29
18675070--18675109
20
2.1
19
85
4
53
62
0
7
30
1.23
18675560--18675626
20
3.3
20
70
15
66
38
7
2
50
1.46
18675556--18675637
40
2.0
41
90
2
130
36
7
3
52
1.47
18675562--18675648
40
2.2
40
85
4
113
37
6
3
51
1.46
18675748--18675788
19
2.2
19
86
0
55
48
0
0
51
1.00
18675700--18675840
69
2.0
70
87
1
203
48
3
4
42
1.41
18675760--18675793
17
1.9
18
88
5
52
58
0
0
41
0.98
18677975--18678078
30
3.5
30
83
0
127
24
27
21
26
1.99
18681931--18682005
30
2.6
28
76
13
82
57
0
0
42
0.98
18681946--18681999
17
2.9
17
82
15
63
61
0
0
38
0.96
18681984--18682009
13
2.0
13
100
0
52
61
0
0
38
0.96
18682044--18682144
24
4.3
23
78
16
93
56
4
0
38
1.21
18682067--18682110
12
3.6
13
77
22
51
56
6
0
36
1.26
18682175--18682249
9
8.1
9
71
21
50
46
1
0
52
1.09
18682175--18682228
17
3.1
18
81
10
67
44
1
0
53
1.11
18682222--18682325
33
3.2
33
81
9
106
53
1
2
41
1.26
18682361--18682429
24
2.8
24
82
12
77
76
0
4
18
0.94
18682371--18682431
8
7.4
8
73
14
52
78
0
4
16
0.91
18682377--18682430
10
5.2
10
76
8
54
81
0
3
14
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18682464--18682528
21
3.2
20
76
8
69
63
0
1
35
1.04
18682716--18682776
20
3.0
21
76
11
63
34
3
1
60
1.23
18682775--18682817
19
2.2
20
91
4
70
46
6
0
46
1.30
18683232--18683273
20
2.0
22
86
9
61
57
2
0
40
1.12
18683196--18683287
34
2.7
32
80
13
87
58
1
1
39
1.12
18683232--18683324
24
4.0
23
75
15
77
56
2
0
40
1.11
18683239--18683309
22
3.1
21
79
18
72
56
1
0
42
1.08
18683186--18683323
56
2.5
53
78
17
138
57
1
0
39
1.12
18683239--18683335
46
2.1
46
81
7
108
59
1
0
39
1.04
18686465--18686639
38
4.6
38
85
1
215
36
27
17
18
1.93
18686474--18686668
38
5.0
38
84
3
212
33
26
19
21
1.97
18692604--18692732
46
2.8
46
90
2
197
19
19
29
31
1.96
18694842--18694874
15
2.1
16
88
5
50
6
0
12
81
0.85
18697953--18698083
21
6.3
21
78
5
124
48
16
20
14
1.81
18697953--18698083
63
2.1
61
82
2
154
48
16
20
14
1.81
18698386--18698539
76
2.0
76
91
0
245
33
14
7
44
1.75
18701594--18701680
45
1.9
45
100
0
174
28
18
4
48
1.68
18715573--18715632
26
2.3
27
88
5
88
26
6
1
65
1.27
18715590--18715641
26
2.0
25
81
3
59
25
11
3
59
1.49
18715756--18715883
3
42.3
3
74
14
86
29
9
0
60
1.34
18716231--18716287
12
4.8
12
76
4
53
36
7
0
56
1.27
18716257--18716287
9
3.4
9
95
0
53
35
6
0
58
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18716358--18716400
19
2.3
17
84
15
50
18
11
2
67
1.32
18716368--18716431
18
3.5
18
75
10
58
20
12
1
65
1.33
18726259--18726291
16
2.1
16
100
0
66
12
39
12
36
1.80
18730199--18730265
21
3.0
23
76
21
72
64
0
5
29
1.17
18730226--18730312
44
2.0
44
82
13
108
65
0
8
26
1.20
18730224--18730352
15
8.9
14
72
18
70
65
1
6
25
1.26
18730245--18730352
29
3.8
28
73
22
73
64
1
7
25
1.30
18734980--18735108
46
2.8
46
91
0
213
31
28
19
20
1.97
18736760--18736809
9
5.6
9
85
0
64
24
8
26
42
1.82
18743251--18743391
43
3.3
43
89
0
219
20
31
21
25
1.98
18744432--18744683
138
1.8
138
95
0
459
49
13
8
28
1.72
18747033--18747058
7
3.7
7
100
0
52
46
38
0
15
1.46
18747463--18747549
41
2.2
40
85
2
111
65
6
4
22
1.36
18747771--18747989
41
5.4
41
90
1
316
21
23
21
33
1.97
18747771--18748018
82
3.0
81
86
2
311
20
23
21
34
1.97
18747771--18748020
123
2.0
123
83
3
308
20
23
21
34
1.97
18748920--18748955
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
18748907--18748947
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
18749094--18749205
38
2.8
40
72
5
102
30
26
19
23
1.98
18749444--18749482
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
18750798--18750843
5
8.6
5
81
13
56
58
2
0
39
1.10
18750797--18750857
14
4.4
14
82
15
74
55
1
0
42
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18750799--18750857
29
2.1
29
84
9
70
55
1
0
42
1.09
18752699--18752779
26
3.2
26
94
3
146
30
6
27
35
1.81
18757395--18757436
20
2.2
19
86
4
57
50
16
2
30
1.58
18759162--18759187
13
2.0
13
100
0
52
76
0
23
0
0.78
18762962--18763140
67
2.8
65
76
9
186
29
17
29
23
1.97
18764593--18764617
8
3.1
8
100
0
50
12
52
24
12
1.72
18766714--18766959
131
1.9
131
86
0
357
27
18
19
34
1.95
18768064--18768146
24
3.6
23
72
22
75
40
1
3
54
1.26
18768770--18768803
17
1.9
17
88
5
50
52
5
2
38
1.41
18780680--18780704
12
2.1
12
100
0
50
92
0
8
0
0.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325