Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  72  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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189
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2.3
138
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3.2
21
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14
54
26
23
9
40
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.9
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33
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0
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20
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0
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21
1.11
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20
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70
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1.95
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1.9
18
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5
52
58
2
8
29
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
0
80
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1.96
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29
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25531671--25531775
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2.0
53
94
0
183
26
9
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47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25534075--25534149
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20
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1
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0
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22
45
1.70
25567425--25567454
14
2.1
14
93
0
51
16
0
36
46
1.47
25568299--25568411
25
4.5
25
74
12
88
34
24
18
22
1.96
25568299--25568411
50
2.3
50
81
6
122
34
24
18
22
1.96
25568722--25568755
16
2.1
17
88
5
52
32
20
0
47
1.51
25569275--25569299
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
25570098--25570171
36
2.1
35
94
2
130
29
2
9
58
1.44
25574542--25574587
16
2.9
16
87
3
58
78
0
13
8
0.97
25575942--25575987
23
2.0
23
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0
65
23
8
13
54
1.66
25576577--25576634
20
2.9
20
86
0
80
22
37
25
13
1.91
25577464--25577638
38
4.5
38
80
2
179
32
24
20
22
1.98
25577721--25577783
31
2.0
31
96
0
117
30
23
12
33
1.92
25582491--25582548
15
3.8
15
88
2
89
51
13
0
34
1.42
25582697--25582725
2
14.5
2
100
0
58
51
48
0
0
1.00
25588660--25588720
21
2.9
21
82
0
86
34
22
22
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25589090--25589147
15
3.8
15
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2
89
51
12
0
36
1.39
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5
6.2
5
96
3
55
56
0
0
43
0.99
25590418--25590500
16
5.5
16
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17
63
56
2
0
40
1.12
25590472--25590500
8
3.6
8
100
0
58
62
0
0
37
0.96
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38
4.1
38
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3
233
31
25
21
21
1.98
25596728--25596758
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1.9
16
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0
53
22
0
12
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1.27
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0
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33
33
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26
1.80
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2
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1.50
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2.0
43
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0
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2.0
70
100
0
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19
36
1.83
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15
2.1
15
100
0
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21
1.88
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14
2.9
14
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3
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51
0
0
48
1.00
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14
4.3
14
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12
52
48
1
1
48
1.21
25636731--25636764
18
1.9
18
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5
52
2
29
5
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1.34
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2.0
41
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0
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23
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27
2.00
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2.4
17
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29
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26
1.88
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2
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2
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53
50
0
0
50
1.00
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2.1
25
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30
0
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58
1.33
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2
21.5
2
90
0
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51
0
44
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25669411--25669488
38
2.1
38
97
0
147
42
7
11
38
1.70
25670704--25670746
22
2.0
22
81
9
52
25
0
18
55
1.42
25671238--25671381
17
8.4
17
78
5
137
47
10
11
31
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25671237--25671380
35
4.1
35
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7
141
46
10
11
31
1.73
25671578--25671624
20
2.5
19
77
16
53
44
8
17
29
1.78
25671981--25672077
7
13.1
7
77
14
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0
20
0
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0.73
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8
12.0
8
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0
21
0
78
0.74
25671981--25672079
19
5.1
19
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0
21
0
78
0.75
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0
20
0
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0
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0
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0
12
0
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0.55
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17
2.6
17
86
6
58
0
21
0
78
0.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325