Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  26  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9759474--9759507
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5
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1.9
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0
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38
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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25
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2.5
403
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4
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9905597--9906034
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41
1.73
9932626--9932652
6
4.5
6
100
0
54
48
0
0
51
1.00
9940731--9940762
15
2.1
15
100
0
64
34
40
6
18
1.76
9951535--9951568
16
2.1
16
94
0
59
52
8
11
26
1.67
9955006--9955037
16
1.9
16
93
6
55
78
3
0
18
0.89
9955263--9955297
13
2.7
13
90
0
52
77
5
17
0
0.96
9958351--9958420
19
3.7
19
74
14
72
64
0
0
35
0.94
9958633--9958692
32
1.9
31
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3
75
40
13
13
33
1.83
9961721--9961953
79
2.9
79
92
0
367
26
19
12
41
1.87
9962921--9963100
91
2.0
90
95
3
326
33
16
13
36
1.88
9967983--9968032
23
2.3
22
82
6
57
34
4
4
58
1.36
9968017--9968068
28
1.9
26
84
7
68
36
5
1
55
1.35
9973569--9973604
3
12.0
3
93
0
63
63
0
2
33
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9976635--9976702
30
2.2
30
84
7
84
44
5
7
42
1.56
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24
2.0
25
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4
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52
0
6
41
1.27
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25
2.2
25
78
6
60
55
0
5
39
1.23
9989205--9989273
30
2.3
29
78
11
79
53
4
11
30
1.56
9993712--9993771
27
2.2
27
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0
111
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15
23
26
1.94
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25
2.0
25
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27
14
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1.60
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4.0
46
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22
24
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2.0
38
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0
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0
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0
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0
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22
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15
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28
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22
42
1.79
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68
2.2
68
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2
192
28
6
21
43
1.78
10005789--10005842
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3.8
14
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4
90
37
18
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38
1.74
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2.0
25
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27
14
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53
1.60
10008174--10008522
46
7.8
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6
428
20
24
14
39
1.91
10008174--10008512
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3.8
89
88
5
440
20
24
15
39
1.91
10008441--10008516
38
2.0
38
97
0
143
25
26
17
31
1.97
10021504--10021550
24
2.0
23
84
8
60
40
2
0
57
1.11
10030149--10030211
32
2.0
32
87
6
92
25
6
23
44
1.77
10030121--10030316
96
2.0
97
95
1
349
25
11
19
43
1.84
10030245--10030305
32
1.9
32
83
12
81
24
6
24
44
1.77
10031517--10031610
46
2.1
46
95
2
172
39
8
6
45
1.60
10040717--10040826
54
2.0
54
98
0
211
34
20
8
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10042800--10042859
16
3.8
16
69
18
54
20
0
28
51
1.47
10042950--10043000
16
2.8
19
77
22
65
35
0
21
43
1.53
10043531--10043775
126
1.9
126
89
0
382
33
19
18
28
1.95
10043720--10043834
60
1.9
60
92
0
194
31
20
16
31
1.95
10043594--10043963
186
2.0
186
91
1
598
34
19
17
29
1.94
10043780--10044097
126
2.5
126
88
3
462
36
18
17
28
1.93
10045699--10045928
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5.0
46
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0
361
23
23
14
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2.4
16
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0
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0
30
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90
9
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5
15
0
78
0.91
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18
2.4
18
84
0
59
44
9
25
20
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325