Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  247  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.95
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136
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2.8
203
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4.3
136
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461
33
13
21
31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.97
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29
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20
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216
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29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.94
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2.0
27
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0
92
30
12
20
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78418253--78418325
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15
61
76
2
14
5
1.09
78427446--78427502
5
11.0
5
77
17
55
77
1
15
5
1.03
78427570--78427594
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
78427570--78427655
30
2.9
31
77
8
90
66
1
19
12
1.31
78431342--78431374
13
2.5
13
95
0
57
66
9
6
18
1.40
78432286--78432348
11
6.0
10
72
17
56
79
1
15
3
0.94
78432286--78432348
5
12.0
5
77
12
56
79
1
15
3
0.94
78432286--78432344
16
3.8
15
84
4
64
79
1
15
3
0.94
78432286--78432344
32
1.9
30
83
13
75
79
1
15
3
0.94
78432423--78432447
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
78432423--78432504
30
2.8
30
74
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87
65
2
19
12
1.36
78436200--78436231
13
2.5
13
94
0
55
65
9
6
18
1.42
78437132--78437197
21
3.1
20
79
14
62
78
4
15
1
0.98
78437143--78437199
5
11.0
5
78
10
53
78
3
15
1
0.96
78437147--78437195
26
1.9
25
84
12
64
79
4
14
2
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78437274--78437355
30
2.8
30
76
9
87
67
1
20
10
1.28
78437279--78437348
24
2.9
24
74
6
61
62
1
24
11
1.36
78439593--78439678
30
2.9
30
78
11
97
27
20
18
32
1.96
78456671--78456851
49
3.7
49
82
4
238
29
27
17
26
1.97
78456671--78456852
99
1.8
99
91
2
303
29
26
17
26
1.97
78461614--78461676
29
2.2
29
91
0
99
39
3
26
30
1.72
78468571--78468629
29
2.0
29
100
0
118
23
16
33
25
1.96
78469651--78469689
18
2.1
19
90
4
62
64
0
17
17
1.30
78469852--78469913
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2.4
26
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0
70
41
11
12
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1.79
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2.2
40
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0
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20
40
20
19
1.92
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39
7.2
39
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0
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28
23
1.99
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21
2.0
21
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0
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18
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27
1.98
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1.8
96
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5
244
26
29
18
25
1.98
78490481--78490666
48
3.9
48
71
9
155
26
29
18
25
1.98
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37
2.0
37
100
0
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1.80
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22
2.0
23
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52
0
0
47
1.00
78498623--78498661
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2.1
18
85
4
51
66
2
0
30
1.05
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16
2.1
17
89
5
54
45
0
5
48
1.26
78501568--78501606
15
2.4
17
83
8
55
41
10
0
48
1.37
78502476--78502520
16
2.8
17
83
6
58
15
17
20
46
1.84
78516724--78516845
43
2.9
42
79
9
149
28
24
15
31
1.96
78518449--78518522
20
3.8
19
72
15
53
35
16
33
14
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78518478--78518581
20
5.3
20
65
13
63
29
14
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18
1.90
78518450--78518661
39
5.4
39
91
0
289
33
15
32
18
1.92
78518470--78518531
19
3.2
19
71
13
63
33
16
33
16
1.91
78522832--78522937
14
7.6
14
76
6
90
32
15
14
38
1.87
78522832--78522943
28
4.0
28
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11
140
32
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1.86
78522842--78522950
56
1.9
56
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0
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78523037--78523096
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2.0
30
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0
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58
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0
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3.1
18
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10
60
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5
0
36
1.21
78529552--78529594
17
2.5
17
85
10
61
53
4
0
41
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325