Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  115  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36255682--36256105
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181
22
23
22
31
1.98
36256347--36256650
44
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43
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18
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25
22
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1.98
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1.27
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20
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26
2.0
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20
20
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2.1
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2.1
42
91
0
142
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13
31
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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130
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4
7
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1.50
36281715--36281821
21
4.9
21
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20
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2
1
33
1.21
36281700--36281821
47
2.8
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135
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2
2
35
1.24
36281746--36281810
18
3.4
18
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1
1
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1.13
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70
16
116
55
3
7
33
1.45
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2.2
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3
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0
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19
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21
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18
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1.83
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174
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21
22
26
1.99
36289799--36290161
43
8.8
40
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23
166
28
24
22
24
1.99
36289799--36290501
84
8.4
84
84
7
893
29
21
22
26
1.99
36289799--36290501
166
4.2
169
83
9
808
29
21
22
26
1.99
36289799--36290501
250
2.8
250
89
2
1088
29
21
22
26
1.99
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44
4.8
44
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185
32
15
21
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1.95
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132
2.4
132
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404
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17
21
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174
2.2
175
91
0
606
33
19
20
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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100
0
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0
0
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1.00
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20
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0
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0
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26
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1.88
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26
2.5
27
76
17
63
41
5
1
51
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36362032--36362098
29
2.3
30
78
16
79
41
4
1
52
1.31
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3.3
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134
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15
5.4
15
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10
18
13
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1.64
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3.0
30
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18
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20
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1.9
18
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0
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0
17
1.06
36389875--36389933
10
5.4
12
71
22
58
64
0
1
33
1.04
36389826--36389937
42
2.7
42
77
11
115
63
0
6
30
1.19
36389892--36389937
12
3.8
12
88
5
65
65
0
2
32
1.05
36389875--36389975
42
2.4
42
83
9
118
65
2
0
30
1.14
36389999--36390041
18
2.4
18
84
3
52
65
0
0
34
0.93
36394272--36394301
3
10.0
3
92
0
51
63
0
3
33
1.11
36394259--36394300
15
3.0
15
90
10
63
61
0
7
30
1.22
36394405--36394516
49
2.4
47
76
17
108
56
4
7
32
1.47
36394576--36394697
11
10.6
11
66
20
54
54
4
5
36
1.44
36394623--36394707
21
3.7
23
71
16
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56
4
5
32
1.44
36394623--36394709
25
3.7
24
70
16
65
56
4
5
33
1.44
36396978--36397409
174
2.5
171
82
9
518
19
22
21
35
1.96
36396972--36397393
86
4.8
87
82
11
438
19
23
21
35
1.96
36397029--36397361
44
7.7
42
72
14
207
19
23
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36396990--36397403
44
9.5
43
69
15
117
20
23
21
34
1.97
36397480--36397603
64
1.9
64
90
0
194
37
12
17
32
1.88
36410399--36410461
27
2.4
27
81
2
74
30
9
1
58
1.39
36410399--36410483
27
3.3
26
74
21
72
31
9
1
57
1.38
36410416--36410483
24
2.7
27
78
17
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32
8
1
57
1.39
36410692--36410777
6
14.3
6
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9
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33
3
2
60
1.26
36410684--36410777
21
4.6
21
68
15
54
34
4
2
59
1.29
36410692--36410777
15
5.7
15
69
10
59
33
3
2
60
1.26
36410881--36410926
20
2.3
20
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0
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2
2
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1.21
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2.1
14
100
0
60
33
6
0
60
1.23
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2.5
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136
34
6
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54
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23
2.6
23
83
8
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34
3
5
56
1.38
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23
3.3
23
73
17
62
34
8
4
52
1.53
36411141--36411201
24
2.7
22
80
7
59
37
6
4
50
1.50
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29
2.1
29
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5
81
27
4
4
62
1.36
36411299--36411362
25
2.5
25
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2
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32
7
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53
1.55
36423594--36424008
163
2.4
168
83
10
476
28
17
19
34
1.94
36423761--36424135
85
4.4
86
80
11
393
27
17
20
34
1.95
36423934--36424082
76
2.0
75
85
4
201
29
14
21
34
1.93
36423850--36424144
161
1.8
164
82
3
391
28
16
21
33
1.95
36425773--36425857
27
3.3
26
74
21
72
31
9
1
57
1.38
36425790--36425857
24
2.7
27
78
17
74
32
8
1
57
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36426040--36426119
24
3.1
24
73
16
63
28
7
3
60
1.42
36426058--36426139
24
3.3
23
77
14
58
28
7
3
60
1.40
36426339--36426368
14
2.1
14
100
0
60
33
6
0
60
1.23
36426339--36426495
64
2.5
58
75
16
136
34
6
5
54
1.48
36426426--36426483
23
2.6
23
83
8
66
34
3
5
56
1.38
36426349--36426432
23
3.3
23
73
17
62
34
8
4
52
1.53
36426656--36426746
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3.5
25
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5
101
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2.5
20
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2
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1.21
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23
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99
33
24
7
35
1.83
36433364--36433414
16
3.2
16
80
5
59
41
1
25
31
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325