Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  312  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98660455--98660541
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98668014--98668119
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2.1
51
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23
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101
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268
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2.0
20
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26
10
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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98708400--98708822
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19
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0
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2
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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100
0
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57
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14
14
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98829479--98829510
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0
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100
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28
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0
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40
1.87
98853698--98853734
5
7.4
5
100
0
74
37
0
0
62
0.96
98855234--98855283
26
1.9
26
95
0
91
10
22
26
42
1.84
98866658--98866742
31
2.8
31
71
10
77
30
4
3
61
1.33
98867210--98867270
21
2.8
20
76
11
59
50
3
0
45
1.17
98867226--98867272
7
6.7
7
88
9
69
48
0
0
51
1.00
98867217--98867272
21
2.7
21
86
5
69
48
1
0
50
1.11
98870819--98870903
30
2.9
30
87
1
118
30
16
21
31
1.95
98871082--98871175
47
2.0
47
100
0
188
25
6
17
51
1.69
98871088--98871192
47
2.2
46
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27
7
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47
1.74
98872524--98872600
39
2.0
39
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12
15
1.83
98872563--98872627
23
2.8
23
88
0
94
44
27
13
13
1.82
98874004--98874067
24
2.8
21
80
20
67
62
4
0
32
1.16
98874009--98874061
21
2.3
23
84
15
67
62
5
0
32
1.19
98874045--98874086
19
2.2
19
83
8
50
66
2
2
28
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98874096--98874209
25
4.7
25
72
17
80
52
3
7
35
1.48
98874153--98874224
25
2.7
26
76
22
69
52
4
5
37
1.44
98874689--98874783
3
31.7
3
73
12
70
61
4
5
29
1.37
98877308--98877450
46
3.0
49
83
7
204
38
25
13
23
1.91
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20
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20
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0
0
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11
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0
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0
7
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1.26
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6
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0
56
28
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4
1.77
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20
2.2
19
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0
0
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0.93
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28
2.3
29
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1.45
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2.1
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29
1.46
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17
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0
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3
100
0
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0
34
0
0.93
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2.6
17
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10
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53
0
0
46
1.00
98896503--98896547
15
2.9
16
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48
0
0
51
1.00
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0
0
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1.00
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2.0
18
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62
0
5
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1.18
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16
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0
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45
12
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1.56
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18
3.3
18
75
9
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30
15
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17
2.1
19
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0
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2.3
43
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0
184
27
21
21
28
1.99
98901994--98902036
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2.5
17
80
0
50
13
25
27
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1.94
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27
2.3
26
78
8
70
37
0
11
51
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98906954--98906998
22
2.0
23
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4
65
31
4
0
64
1.13
98914645--98914712
20
3.5
20
84
11
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35
1
5
57
1.32
98917051--98917084
17
1.9
18
88
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52
29
0
2
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133
1.9
133
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372
33
16
18
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23
2.5
24
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71
12
5
10
1.28
98926124--98926166
22
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15
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0
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13
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29
1.66
98932784--98932846
28
2.1
28
85
8
81
49
14
6
30
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325