Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          321   322   323   324   325   

This is table  241  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76221137--76221637
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89
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322
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76221150--76221637
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1.9
183
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1.99
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0
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8
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1.74
76225801--76225837
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12
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70
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76298852--76299491
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3.0
210
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100
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229
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15
0
30
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.48
76312191--76312362
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1.8
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76313638--76313788
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2.1
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76313734--76313782
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15
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6
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1.20
76346692--76346770
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3.0
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1
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31
1.20
76346698--76346757
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31
1.20
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24
21
23
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2.1
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22
18
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1.97
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44
68
14
184
18
22
21
37
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.95
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22
21
20
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1.96
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19
2.0
20
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1.97
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20
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119
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19
2.5
18
83
16
58
60
2
0
37
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76403189--76403245
28
2.1
27
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9
71
61
3
0
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1.13
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17
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20
23
14
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1.88
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3.1
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21
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25
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10
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1.85
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2.2
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100
0
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19
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32
93
0
104
52
18
3
26
1.60
76433925--76433998
32
2.5
30
85
10
91
52
18
2
25
1.59
76436210--76436263
22
2.5
22
96
0
99
27
9
18
44
1.80
76445299--76445384
44
2.0
44
92
0
145
27
30
12
29
1.93
76445245--76445637
178
2.2
177
86
3
538
26
25
18
29
1.98
76464914--76464958
13
3.4
13
82
11
56
46
15
17
20
1.84
76469592--76469680
43
2.0
44
82
8
110
32
7
19
40
1.80
76470175--76470216
21
1.9
23
85
9
61
57
14
2
26
1.50
76477261--76477368
26
4.2
26
91
0
180
34
7
23
35
1.83
76482166--76482255
45
2.0
45
97
0
171
32
2
12
53
1.50
76486167--76486220
20
2.7
20
78
16
58
44
20
1
33
1.62
76487817--76487910
5
18.4
5
95
4
170
59
0
1
39
1.04
76488088--76488139
20
2.6
20
78
9
61
44
25
0
30
1.54
76493222--76493254
13
2.6
13
85
4
50
33
0
12
54
1.37
76493326--76493764
29
15.1
29
86
2
472
37
13
26
22
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76495075--76495107
16
2.0
17
88
5
50
63
0
9
27
1.24
76496581--76497214
44
14.0
44
71
8
335
29
22
17
31
1.96
76496587--76497026
89
5.0
88
77
7
370
28
22
17
31
1.96
76496584--76497026
177
2.5
177
82
3
507
28
21
17
31
1.96
76496587--76497030
133
3.3
133
74
7
319
28
22
17
31
1.96
76502460--76502500
22
2.0
20
85
9
55
58
9
2
29
1.43
76502651--76502698
23
2.1
23
85
14
64
64
10
0
25
1.25
76504738--76504772
14
2.6
13
86
8
52
48
8
14
28
1.73
76504704--76505111
89
4.6
86
84
7
482
34
20
17
27
1.95
76505028--76505170
75
1.9
75
91
0
232
29
24
16
29
1.97
76504847--76505714
224
3.6
242
80
8
841
33
21
16
27
1.95
76505269--76505726
73
6.2
73
82
3
522
34
21
16
27
1.94
76505272--76505793
73
6.9
74
80
5
485
34
21
16
27
1.95
76510789--76510980
40
4.8
40
90
1
217
27
27
21
24
1.99
76510760--76510979
80
2.8
80
80
4
239
28
26
20
24
1.99
76518902--76519093
40
4.8
40
89
3
192
28
27
19
24
1.99
76518873--76519092
80
2.8
79
80
6
230
29
27
19
24
1.98
76529811--76529851
22
2.0
20
85
9
55
58
9
2
29
1.43
76529998--76530050
24
2.2
24
83
12
65
62
9
1
26
1.36
76536077--76536133
3
19.0
3
82
7
71
64
3
3
28
1.26
76552223--76552400
61
2.9
59
71
16
150
43
1
3
51
1.28
76552315--76552373
26
2.3
25
85
8
82
40
0
1
57
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76552328--76552383
15
4.0
15
73
17
57
44
0
0
55
0.99
76552370--76552440
15
4.4
16
76
15
65
47
2
0
49
1.16
76552354--76552422
22
3.3
22
69
22
67
43
2
0
53
1.15
76552662--76552729
16
4.2
16
92
0
118
35
36
0
27
1.58
76553024--76553053
11
2.7
11
94
0
51
63
3
20
13
1.43
76558771--76558849
28
2.8
28
79
11
81
30
12
2
54
1.51
76559384--76559442
28
2.1
28
100
0
118
27
37
22
13
1.91
76562065--76562172
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
76567846--76567951
26
4.2
26
89
3
171
34
24
7
33
1.84
76572397--76572439
21
2.1
20
87
12
61
48
20
11
18
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325