Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  39  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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28
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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54
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14591107--14591160
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3.4
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35
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1.58
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19
82
7
57
61
3
1
33
1.23
14604172--14604228
23
2.4
25
88
11
86
50
12
0
36
1.40
14607080--14607120
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
14615643--14615694
25
2.2
23
86
6
68
36
3
13
46
1.62
14619129--14619154
7
3.7
7
100
0
52
88
0
0
11
0.52
14621933--14621962
5
6.2
5
96
3
53
80
0
0
20
0.72
14630466--14630501
18
1.9
19
94
5
65
75
2
0
22
0.94
14630672--14630725
24
2.2
25
80
6
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64
1
7
25
1.30
14632208--14632246
20
2.0
20
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0
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1.52
14633838--14633896
28
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25
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44
8
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1.61
14633996--14634068
30
2.4
30
78
17
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49
4
1
45
1.29
14636455--14636518
33
2.0
30
85
8
83
40
0
1
57
1.08
14638481--14638604
62
2.0
62
100
0
248
27
6
8
58
1.52
14658317--14658353
2
18.5
2
100
0
74
0
48
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14660818--14660859
21
2.1
19
91
8
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52
4
0
42
1.22
14663683--14663722
14
2.9
14
88
0
62
47
12
0
40
1.41
14666090--14666142
18
2.9
18
85
0
79
32
28
15
24
1.95
14668117--14668150
16
2.1
17
88
5
52
41
5
23
29
1.78
14670600--14670640
20
2.1
20
95
4
75
41
0
9
48
1.36
14670627--14670679
17
3.1
18
82
15
60
52
5
5
35
1.49
14672165--14672200
17
2.1
17
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0
54
11
16
8
63
1.49
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1.9
35
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3
91
41
13
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32
1.81
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18
5.2
18
88
0
141
26
22
17
33
1.96
14685970--14686062
36
2.6
36
92
0
159
26
22
17
33
1.96
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2.4
11
100
0
52
88
0
11
0
0.52
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15
2.7
16
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13
54
63
13
2
20
1.40
14699283--14699311
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
14701565--14701601
16
2.2
18
85
9
51
54
8
2
35
1.44
14701617--14701667
26
1.9
27
88
4
77
41
1
3
52
1.31
14701617--14701678
27
2.3
26
86
2
79
41
1
4
51
1.33
14705233--14705337
45
2.3
45
85
3
131
22
20
17
39
1.93
14717485--14717509
13
1.9
13
100
0
50
16
0
40
44
1.47
14720006--14720064
29
2.0
29
87
9
84
55
13
3
27
1.54
14722945--14723016
21
2.9
27
68
23
75
34
9
6
48
1.63
14724074--14724110
19
1.9
19
94
0
65
0
43
10
45
1.39
14724155--14724188
13
2.7
13
95
4
61
0
29
8
61
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14726483--14726530
18
2.8
18
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22
50
43
0
0
56
0.99
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15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
14726548--14726742
56
3.1
65
65
22
182
41
2
6
49
1.40
14726466--14726786
119
2.7
120
98
1
619
43
1
4
50
1.32
14726619--14726670
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
14726748--14726789
15
2.7
16
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14
52
45
0
2
52
1.13
14726739--14726780
15
2.9
15
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10
52
47
0
0
52
1.00
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16
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0
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0
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1.58
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4
100
0
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0
0
25
0.83
14733624--14733673
26
1.9
26
84
8
66
36
16
6
42
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325