Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  125  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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4.0
40
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1.98
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Period
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Copy
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Indels
Score
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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29
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4.7
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0
305
25
18
30
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39150735--39150829
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36
2.7
36
83
3
124
42
25
13
18
1.87
39177947--39178028
43
1.9
43
85
7
114
26
19
21
31
1.97
39177945--39178047
43
2.4
42
81
10
113
24
19
25
31
1.98
39182555--39182602
25
2.0
25
84
8
64
18
2
16
62
1.42
39186141--39186288
43
3.5
41
77
10
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29
15
23
31
1.95
39189921--39189988
35
1.9
35
96
0
127
48
22
4
25
1.69
39193683--39193807
27
4.6
27
77
7
110
43
20
12
24
1.86
39193697--39193832
55
2.5
55
87
2
184
42
19
13
24
1.87
39193717--39193832
27
4.3
27
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2
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39
18
13
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1.89
39200529--39200695
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0
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25
20
31
1.98
39208456--39208625
39
4.3
39
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0
259
21
25
21
31
1.98
39239559--39239695
68
2.0
68
94
2
240
18
35
20
24
1.95
39244814--39244878
29
2.2
30
83
8
80
20
24
10
44
1.83
39248545--39248609
28
2.3
28
86
7
96
30
27
7
33
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39248715--39248777
28
2.2
29
86
8
85
22
20
23
33
1.97
39248729--39248788
29
2.1
28
84
3
75
26
23
18
31
1.97
39249242--39249280
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
39255628--39255696
22
3.3
22
64
32
60
21
21
27
28
1.99
39255620--39255802
41
4.5
41
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3
237
25
24
25
25
2.00
39262005--39262064
29
2.0
32
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9
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38
6
41
13
1.70
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28
2.3
28
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0
101
31
28
7
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1.85
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19
2.1
19
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0
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5
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1.26
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2.3
28
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32
26
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32
1.88
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2.0
28
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23
21
21
32
1.98
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19
2.1
19
85
0
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15
5
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1.26
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2.0
30
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0
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31
22
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1.84
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35
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1
304
35
13
12
37
1.83
39291918--39292621
205
3.4
205
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0
1122
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20
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1.96
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2.2
44
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1.97
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29
1.98
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4.4
132
91
0
920
26
24
18
30
1.98
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7
9.7
7
76
15
52
6
9
0
84
0.76
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8
8.6
8
76
14
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5
8
0
85
0.74
39294136--39294188
12
4.5
11
84
13
63
7
5
0
86
0.69
39299867--39299918
23
2.3
22
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12
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38
7
15
38
1.76
39299875--39299920
23
2.0
23
88
12
69
39
6
10
43
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39308930--39309061
48
2.8
48
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4
169
33
25
18
22
1.97
39315033--39315084
26
2.0
26
100
0
104
42
15
23
19
1.89
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25
2.0
25
91
0
80
46
10
10
32
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39323842--39323967
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3.0
42
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2
180
30
26
19
23
1.98
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3.0
21
95
0
110
1
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19
2.1
18
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51
52
0
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1.9
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100
0
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1
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2.2
25
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0
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11
33
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25
1.91
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20
2.7
20
85
0
72
44
24
22
9
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325