Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  300  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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22
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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40
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29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
30
1.96
95646298--95646345
20
2.3
21
85
3
62
18
0
0
81
0.70
95652260--95652351
44
2.1
44
86
8
125
33
21
20
23
1.97
95653537--95653574
14
2.4
17
87
12
55
55
0
0
44
0.99
95660464--95660555
44
2.1
44
86
11
127
34
23
21
19
1.96
95661407--95661445
21
1.9
20
84
5
51
7
7
7
76
1.15
95661590--95661631
13
3.4
12
81
12
50
59
2
0
38
1.10
95661448--95661733
157
1.8
158
81
3
362
41
9
4
44
1.57
95662813--95662919
43
2.5
43
78
3
108
30
14
22
31
1.94
95665857--95665901
11
3.9
11
80
11
54
35
0
0
64
0.94
95665852--95665907
24
2.3
24
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37
0
1
60
1.07
95668030--95668303
46
6.0
46
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0
370
40
14
23
21
1.91
95669243--95669539
46
6.5
46
90
1
427
19
20
13
46
1.83
95669348--95669417
22
3.1
22
65
15
61
17
18
14
50
1.79
95669511--95669631
45
2.7
45
84
3
138
23
25
14
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95669553--95669651
44
2.2
42
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18
119
19
24
19
37
1.94
95669660--95669705
22
2.1
22
88
8
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21
23
19
34
1.96
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31
2.1
31
100
0
132
34
18
25
21
1.96
95678842--95678934
27
3.4
27
75
11
100
6
32
0
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1.21
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2.1
27
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0
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5
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1
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1.32
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2.3
23
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0
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9
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0
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0.94
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17
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4
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10
10
0
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0.94
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10
0
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0.98
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2.0
39
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0
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5
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2
0
36
1.08
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2.0
37
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0
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17
8
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1.28
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2.5
125
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4
404
26
17
19
36
1.94
95694678--95694802
27
4.7
26
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14
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60
4
4
30
1.38
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16
2.3
15
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52
62
2
2
31
1.24
95697682--95697788
22
4.9
20
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5
6
30
1.48
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24
4.6
24
77
7
107
54
4
6
34
1.46
95697719--95697886
22
6.9
25
73
19
81
53
4
6
35
1.48
95697847--95697903
22
2.8
21
80
19
59
57
3
5
33
1.38
95698381--95698479
30
3.3
30
94
0
180
17
6
50
26
1.69
95698694--95698728
18
1.9
18
100
0
70
11
11
20
57
1.64
95699151--95699445
88
3.4
88
78
9
300
36
18
15
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95699133--95699448
175
1.8
174
81
6
397
35
18
16
29
1.93
95699377--95699926
71
7.2
76
77
11
443
35
19
16
28
1.94
95699455--95700012
155
3.6
153
79
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475
35
19
16
28
1.93
95699863--95700029
88
1.9
86
81
7
201
41
16
13
28
1.85
95700057--95700402
145
2.4
146
89
3
502
31
21
17
30
1.96
95699489--95700759
568
2.2
552
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10
1376
35
19
16
27
1.94
95700063--95700388
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4.5
73
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30
1.96
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478
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1257
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19
17
27
1.94
95700573--95700613
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3.2
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50
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12
14
1.36
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2.8
97
85
8
349
38
19
18
24
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325