Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  62  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Score
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228
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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34
11
10
43
1.74
22476522--22476600
34
2.3
35
86
6
108
31
16
8
43
1.79
22476545--22476598
16
3.2
16
75
14
56
35
14
9
40
1.78
22476544--22476714
38
4.7
37
78
6
152
35
12
8
42
1.74
22476591--22476766
74
2.4
75
81
4
187
37
11
9
41
1.74
22476624--22476900
36
7.7
34
72
13
141
33
11
10
43
1.76
22476534--22476922
35
10.9
35
73
11
204
33
12
10
43
1.75
22485630--22485851
119
1.9
118
84
4
304
30
14
20
34
1.92
22485742--22485919
68
2.6
68
83
5
191
29
14
20
34
1.93
22485811--22486039
120
1.9
119
81
7
275
30
13
19
36
1.91
22485931--22486107
67
2.6
65
82
7
185
29
14
20
35
1.92
22485179--22486224
187
5.5
190
94
4
1747
29
13
20
36
1.91
22485997--22486313
119
2.6
121
90
6
500
26
13
21
38
1.91
22486238--22486473
82
2.9
78
83
12
291
24
19
19
36
1.94
22486582--22486777
51
3.8
51
85
12
244
30
15
18
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22487042--22487143
31
3.4
30
83
5
127
29
21
3
45
1.70
22487042--22487158
29
3.9
29
82
6
128
29
21
3
45
1.68
22504666--22504762
23
4.2
23
84
5
133
41
26
20
11
1.86
22507607--22507708
46
2.2
46
96
1
188
37
13
24
24
1.92
22507689--22507729
21
2.0
21
95
0
73
39
19
21
19
1.93
22507710--22507798
44
2.0
46
95
4
164
38
14
22
24
1.92
22507643--22507773
65
2.0
67
95
3
239
38
16
22
22
1.93
22526266--22526342
14
5.0
15
71
20
52
42
14
9
33
1.77
22526282--22526321
20
2.0
20
90
0
62
50
12
10
27
1.72
22526270--22526336
34
1.9
35
90
3
109
46
13
8
31
1.74
22542822--22542849
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
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24
2.2
24
75
12
58
34
3
1
60
1.25
22553409--22553433
13
1.9
13
100
0
50
92
0
8
0
0.40
22559643--22559696
2
27.0
2
96
0
99
0
1
48
50
1.11
22564630--22564701
30
2.3
32
78
4
85
38
2
2
55
1.29
22565766--22565834
19
3.5
19
84
5
84
57
0
1
40
1.07
22565766--22565833
20
3.5
20
80
11
77
58
0
1
39
1.07
22565769--22565843
19
4.1
17
75
20
62
54
0
2
42
1.14
22566104--22566153
19
2.9
17
73
23
50
28
2
4
66
1.21
22566647--22566690
22
2.0
22
82
8
54
25
6
9
59
1.53
22568481--22568515
19
1.9
17
88
11
52
40
8
2
48
1.49
22577465--22577532
34
2.0
33
86
13
95
39
0
8
51
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22577841--22577886
23
2.0
24
83
12
60
47
6
6
39
1.55
22588276--22588311
15
2.5
15
90
4
56
66
0
33
0
0.92
22592857--22592961
55
1.9
54
83
14
135
20
19
34
25
1.96
22609443--22609582
53
2.6
53
86
2
192
30
27
16
25
1.97
22611530--22611557
14
2.0
14
100
0
56
50
0
14
35
1.43
22615077--22615156
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3.3
23
69
16
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60
8
11
20
1.57
22617458--22617812
158
2.2
158
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1
514
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21
15
31
1.94
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41
0
0
58
0.98
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2.1
27
90
6
89
59
5
7
28
1.45
22638584--22638610
12
2.2
12
100
0
54
37
14
25
22
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325