Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  206  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64276561--64276680
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162
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18
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1
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
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2.0
23
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21
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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1.99
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28
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30
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1.65
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2.0
41
82
2
101
28
1
37
32
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64454807--64454848
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1.98
64465100--64465163
31
2.1
31
87
0
92
37
15
23
23
1.93
64466060--64466106
15
3.4
15
75
22
57
48
6
4
40
1.48
64466060--64466134
26
2.9
26
89
0
105
45
6
2
45
1.43
64466249--64466283
17
2.0
17
88
5
52
34
0
0
65
0.93
64466792--64466823
13
2.5
13
95
5
57
25
40
0
34
1.56
64469791--64469818
10
2.8
10
100
0
56
46
0
21
32
1.52
64469838--64470323
244
2.0
244
96
0
902
34
17
13
33
1.90
64470750--64470877
9
13.6
9
76
9
121
46
21
0
31
1.57
64470767--64470844
39
2.0
39
97
0
147
46
21
0
32
1.52
64470763--64470875
57
2.0
57
89
0
172
46
23
0
30
1.58
64473916--64474092
40
4.4
40
82
4
207
26
27
22
24
2.00
64473916--64474092
80
2.2
79
85
3
230
26
27
22
24
2.00
64496959--64497053
40
2.4
40
96
0
172
21
20
29
29
1.98
64502917--64502998
41
2.0
41
88
9
123
30
32
17
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64504034--64504087
11
5.1
11
77
8
67
31
20
14
33
1.93
64504026--64504087
21
3.0
21
88
4
90
33
19
12
33
1.90
64511931--64511984
11
5.1
11
77
8
67
31
20
14
33
1.93
64511923--64511984
21
3.0
21
88
4
90
33
19
12
33
1.90
64522459--64522510
27
1.9
28
84
7
72
17
21
23
38
1.93
64522540--64522740
27
7.4
27
77
6
160
28
9
20
41
1.83
64522563--64522712
81
1.9
81
81
8
189
27
8
22
42
1.81
64522744--64522941
27
7.3
27
84
2
220
39
8
23
28
1.84
64522744--64522941
54
3.7
54
84
4
247
39
8
23
28
1.84
64525174--64525319
31
4.7
31
93
0
249
28
25
15
30
1.96
64525343--64525433
42
2.2
42
84
2
121
35
19
14
30
1.92
64525566--64525701
26
5.3
26
84
3
163
28
23
18
29
1.98
64525566--64525701
52
2.7
52
86
7
183
28
23
18
29
1.98
64525751--64525817
20
3.3
20
91
4
100
31
17
10
40
1.84
64526622--64526779
81
2.0
80
80
10
180
29
8
22
40
1.82
64526623--64526798
27
6.6
27
76
8
155
27
8
23
40
1.83
64526830--64526969
27
5.2
27
85
0
190
37
7
26
28
1.83
64526833--64526969
54
2.5
54
90
0
211
37
7
25
29
1.83
64526833--64526989
54
2.9
54
86
0
170
37
7
24
30
1.83
64529191--64529305
31
3.7
31
95
1
205
26
25
17
30
1.97
64529329--64529420
42
2.2
42
86
0
130
34
19
14
31
1.91
64529553--64529688
26
5.3
26
86
3
172
28
23
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64529576--64529688
52
2.2
51
95
1
199
28
23
21
26
1.99
64529738--64529788
20
2.5
20
87
0
75
33
19
7
39
1.81
64530614--64530819
54
3.8
54
79
2
173
29
10
20
39
1.86
64530614--64530786
27
6.4
27
78
6
156
28
8
21
41
1.83
64530627--64530814
81
2.3
81
77
8
179
28
10
21
39
1.86
64530822--64530966
27
5.4
27
85
0
182
39
6
24
29
1.81
64530822--64530988
81
2.1
81
86
0
226
39
7
23
29
1.83
64530822--64530988
27
6.2
27
84
0
181
39
7
23
29
1.83
64530822--64530976
54
2.9
54
84
1
204
38
7
23
30
1.81
64530823--64531008
81
2.3
81
82
0
192
39
8
22
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325