Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  90  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
24
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2
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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49
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2.3
23
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2.3
23
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2.3
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115
38
1
5
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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0
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42
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114
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16
22
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1.95
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43
2.6
42
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116
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1.96
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17
2.0
17
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18
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42
14
10
33
1.79
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8
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1.60
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0
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1.58
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28
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1
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25
2.0
25
88
0
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4
32
6
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30215736--30215766
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16
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13
13
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1.53
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11
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11
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59
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34
1.28
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18
3.4
18
70
19
58
54
4
9
31
1.53
30241579--30241625
21
2.2
22
78
17
55
44
4
17
34
1.68
30243743--30243797
24
2.2
26
84
12
71
61
7
5
25
1.44
30245369--30245398
14
2.1
14
93
0
51
20
40
13
26
1.89
30245431--30245903
44
10.6
43
75
8
358
27
20
21
30
1.98
30245431--30245903
89
5.3
89
76
7
424
27
20
21
30
1.98
30245423--30245860
224
2.0
225
80
5
503
27
20
20
31
1.97
30245423--30245957
135
4.0
136
75
9
348
26
20
20
31
1.98
30245474--30245903
179
2.4
179
86
1
585
27
21
21
30
1.98
30259055--30259093
20
2.0
20
89
0
60
48
15
17
17
1.81
30261299--30261369
3
23.7
3
88
5
108
69
0
29
1
0.98
30261390--30261429
21
1.9
21
94
0
71
22
30
20
27
1.98
30262783--30262829
23
2.0
23
84
8
60
12
8
10
68
1.40
30265293--30265414
61
2.0
61
100
0
244
50
13
11
24
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30269346--30269416
36
2.0
35
89
5
108
22
11
7
59
1.56
30272040--30272089
6
8.3
6
97
0
82
0
64
0
36
0.94
30275064--30275121
22
2.5
25
78
18
63
32
0
5
62
1.18
30275204--30275228
13
1.9
13
100
0
50
44
8
8
40
1.63
30275505--30275567
31
2.0
31
100
0
126
41
3
12
42
1.59
30276727--30276760
17
2.0
17
100
0
68
11
35
0
52
1.38
30286401--30286433
12
2.8
12
100
0
66
66
0
9
24
1.20
30287323--30287370
10
4.9
10
76
2
53
66
2
6
25
1.26
30287394--30287423
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
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32
1.9
32
100
0
124
38
25
4
30
1.77
30294344--30294377
14
2.5
14
90
4
52
76
0
2
20
0.92
30297134--30297166
12
2.8
12
100
0
66
66
0
9
24
1.20
30298056--30298103
20
2.5
20
86
3
62
64
2
6
27
1.28
30298127--30298156
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
30300009--30300046
20
1.9
20
88
0
58
42
2
0
55
1.14
30304376--30304416
21
2.0
21
90
0
64
60
7
2
29
1.36
30305934--30305986
23
2.2
24
83
3
63
60
7
1
30
1.35
30306761--30306977
88
2.5
88
84
3
251
36
20
21
21
1.95
30307137--30307246
43
2.6
42
81
5
114
39
23
17
20
1.92
30307176--30307418
86
2.8
85
83
6
319
35
22
21
20
1.96
30307270--30307636
43
8.5
42
72
12
253
34
22
22
20
1.97
30307263--30307540
129
2.2
129
90
2
425
33
22
21
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30307177--30307635
43
10.7
42
67
11
223
34
22
22
20
1.96
30307099--30307636
216
2.5
213
86
5
692
35
21
22
20
1.96
30307391--30307675
87
3.3
86
88
2
383
33
22
23
20
1.97
30308684--30308728
21
2.2
21
88
4
65
6
13
0
80
0.91
30308683--30308728
20
2.2
22
80
11
60
6
13
0
80
0.89
30309509--30309578
3
23.0
3
88
8
106
30
2
0
67
1.05
30309796--30309829
3
11.0
3
87
6
50
32
0
0
67
0.91
30316482--30316610
66
2.0
66
90
3
206
31
19
10
38
1.86
30316722--30316925
88
2.3
88
87
2
277
37
19
21
22
1.95
30316729--30316873
44
3.3
43
69
13
125
36
20
22
21
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325