Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  82  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
25
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35
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2
310
39
14
11
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.21
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0
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12
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88
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5
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140
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0
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17
17
28
1.93
28188473--28188509
18
2.1
18
100
0
74
35
16
21
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28211337--28211367
15
2.1
15
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5
55
32
3
0
64
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28213721--28213776
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11
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33
0
1
64
1.04
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24
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1.89
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15
23
19
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1
53
1.36
28217674--28217908
3
77.7
3
68
10
95
28
9
3
58
1.46
28219066--28219301
46
5.0
47
82
9
248
22
23
14
39
1.91
28219079--28219279
100
2.0
100
87
3
289
22
23
13
39
1.90
28222146--28222194
19
2.6
19
96
0
89
40
16
12
30
1.85
28222273--28222316
21
2.0
21
83
12
54
52
11
2
34
1.50
28224616--28224676
21
2.8
23
85
14
94
34
27
24
13
1.93
28224602--28224688
21
4.0
23
79
10
83
37
24
21
16
1.93
28227857--28227891
18
1.9
18
94
0
61
37
17
28
17
1.92
28228866--28228902
17
2.2
17
90
0
56
0
27
0
72
0.84
28230109--28230165
28
2.0
28
100
0
114
17
21
26
35
1.95
28238782--28238976
38
5.1
38
94
0
327
32
25
21
20
1.97
28244528--28244835
38
8.1
38
92
0
510
31
25
22
20
1.98
28246151--28246179
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
28249239--28249723
88
5.5
88
90
0
702
33
20
24
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28249252--28249669
44
9.5
42
65
15
168
33
20
23
22
1.97
28249872--28249994
41
2.9
42
84
4
140
30
21
21
26
1.98
28250295--28250348
19
2.8
19
72
5
56
51
35
3
9
1.52
28251426--28251487
28
2.2
27
81
13
72
27
3
3
66
1.23
28251456--28251497
15
2.8
15
82
7
50
26
2
2
69
1.13
28251561--28251602
22
1.9
22
90
0
66
40
7
0
52
1.29
28251559--28251625
20
3.2
20
82
4
71
37
5
1
55
1.34
28251711--28251792
41
2.0
41
80
4
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28
9
4
57
1.51
28251652--28251874
3
74.0
3
68
9
87
30
11
2
56
1.48
28251918--28251966
12
3.9
12
76
10
53
18
12
4
65
1.41
28253418--28253466
23
2.1
23
82
14
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42
0
0
57
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21
2.1
21
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0
61
25
18
25
31
1.97
28258631--28258660
15
2.0
15
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0
51
50
0
10
40
1.36
28262401--28262455
9
6.2
8
80
16
56
16
1
0
81
0.77
28262400--28262455
15
3.7
15
72
15
53
17
1
0
80
0.80
28262401--28262455
18
3.1
18
86
2
76
16
1
0
81
0.77
28263380--28263421
11
4.0
11
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9
52
85
0
7
7
0.73
28263384--28263426
21
2.0
21
86
0
59
86
0
9
4
0.71
28263384--28263418
10
3.4
10
92
4
52
88
0
5
5
0.63
28264052--28264083
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
28264876--28264900
7
3.6
7
100
0
50
12
0
0
88
0.53
28265763--28265851
44
2.0
44
100
0
178
22
17
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28267019--28267047
9
3.2
9
100
0
58
79
0
0
20
0.74
28280430--28280592
43
3.9
41
77
7
148
30
14
23
31
1.94
28281015--28281088
36
2.1
36
100
0
148
41
16
31
10
1.82
28281622--28281758
60
2.3
59
81
8
143
26
24
19
29
1.98
28284136--28284164
15
1.9
15
100
0
58
58
0
0
41
0.98
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28
2.0
28
85
0
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23
21
9
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1.80
28287490--28287556
21
3.2
21
73
12
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22
37
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19
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28287723--28287782
21
2.9
21
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21
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16
1.92
28288582--28288611
13
2.3
13
94
0
51
36
26
0
36
1.57
28288705--28289202
46
10.8
46
90
1
674
22
24
13
40
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325