Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  235  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74119189--74119343
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51
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23
1.98
74137285--74137375
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2.0
45
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2.7
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13
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27
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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17
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100
0
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33
35
17
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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176
26
12
28
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1.92
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142
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1.76
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3.8
26
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123
36
20
23
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74326980--74327044
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3.0
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21
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22.0
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56
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231
45
9
23
22
1.81
74336524--74336943
96
4.4
95
93
2
630
32
8
29
29
1.87
74336524--74336943
47
8.8
47
94
2
696
32
8
29
29
1.87
74336793--74336868
22
3.3
22
64
10
62
30
11
30
27
1.92
74337062--74337140
37
2.1
37
88
0
113
24
17
31
26
1.97
74341475--74341521
19
2.5
20
75
10
53
31
0
6
61
1.21
74341529--74341573
23
2.0
23
86
8
65
64
2
11
22
1.36
74342429--74342511
25
3.3
25
84
3
105
25
26
19
28
1.98
74349593--74349624
15
2.0
17
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11
50
25
0
31
43
1.55
74349649--74349965
158
2.0
158
93
0
535
28
10
24
36
1.88
74353010--74353148
57
2.4
58
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3
156
30
23
17
28
1.97
74354178--74354211
16
2.1
17
89
10
54
23
14
0
61
1.33
74354585--74354690
25
4.2
25
75
9
117
21
21
28
28
1.99
74354878--74354907
9
3.2
9
95
4
51
53
10
13
23
1.69
74363488--74363563
11
7.5
11
74
16
83
35
11
19
32
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74363487--74363563
20
3.8
20
96
0
145
35
11
19
33
1.88
74363499--74363555
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
74363613--74363685
26
2.8
26
91
0
119
28
23
23
24
1.99
74363907--74364023
38
3.3
33
82
16
121
38
16
21
23
1.93
74363922--74364030
38
2.9
38
95
0
191
38
15
21
24
1.92
74366355--74366458
3
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3
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9
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57
1
8
31
1.40
74366424--74366470
14
3.1
15
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6
60
59
4
6
29
1.41
74366532--74366677
3
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3
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57
2
9
30
1.42
74366643--74366685
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2.4
18
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0
50
60
0
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1.23
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2.2
50
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3
132
27
31
22
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1.97
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4.7
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217
23
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1.94
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33
2.1
33
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0
129
30
0
21
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1.51
74383556--74383598
9
4.6
9
77
11
50
34
0
2
62
1.08
74383556--74383614
19
3.1
18
79
11
55
38
0
1
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1.08
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1.9
22
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46
2
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43
1.44
74388661--74388703
20
2.2
20
100
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20
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194
29
20
28
21
1.98
74405697--74405869
49
3.6
49
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3
172
25
20
28
26
1.99
74409805--74409857
28
1.9
27
92
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88
28
15
26
30
1.96
74410509--74410541
18
1.9
17
88
11
50
42
6
15
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1.71
74414939--74414969
16
1.9
16
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0
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54
22
0
22
1.44
74417480--74417536
6
9.3
6
80
3
60
43
3
3
49
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74418529--74418571
21
2.1
20
83
12
52
51
13
11
23
1.74
74423024--74423052
6
4.8
6
100
0
58
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13
0
1.20
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18
2.2
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60
0
0
39
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20
2.0
20
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7
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2
46
1.44
74430920--74430958
15
2.6
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16
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28
1.77
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0
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0
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0
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2.0
155
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0
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20
0
33
1.51
74458661--74458775
43
2.7
43
87
5
153
31
28
18
21
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325