Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  76  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26555872--26555966
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244
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27
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1.98
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1.98
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0
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20
20
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1.97
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4.6
42
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16
137
26
21
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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0
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0.93
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1.96
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411
2.8
411
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31
17
21
29
1.96
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2.1
17
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63
25
11
0
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1.28
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1.9
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7
32
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.61
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0
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1
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1.16
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1
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117
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11
14
36
1.83
26758197--26758288
17
4.7
22
84
13
73
36
9
15
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
220
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0
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1.96
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45
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0
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0
52
57
11
23
7
1.59
26786761--26787171
46
9.0
46
89
2
513
41
13
24
21
1.88
26786775--26787171
183
2.2
183
84
1
517
41
13
24
21
1.89
26787107--26787264
77
2.1
77
98
0
307
47
14
18
19
1.82
26793156--26793209
20
2.7
19
83
11
63
50
1
7
40
1.41
26796724--26797338
203
3.0
203
97
0
1162
42
11
13
32
1.80
26797297--26798370
529
2.0
531
99
0
2107
43
13
13
29
1.81
26801614--26801657
17
2.5
17
82
13
54
11
4
9
75
1.19
26801601--26801664
28
2.3
28
74
15
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12
4
14
68
1.35
26819159--26819215
26
2.1
28
83
6
73
31
7
1
59
1.34
26828012--26828047
18
2.0
18
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10
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69
0
0
30
0.89
26828337--26828389
17
2.9
18
86
8
81
35
15
11
37
1.83
26828508--26828546
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
26828739--26829012
45
6.1
45
76
8
243
25
26
16
31
1.96
26828952--26829246
78
3.8
78
90
2
450
25
23
18
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26829427--26829725
44
6.9
44
78
10
206
26
26
17
29
1.97
26829559--26829656
41
2.3
44
86
6
132
24
28
18
28
1.98
26840704--26840779
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
26840740--26840794
18
2.9
19
94
5
103
36
16
10
36
1.84
26840913--26840951
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
26846238--26846286
21
2.3
21
92
0
80
30
0
40
28
1.57
26849378--26849416
10
3.8
10
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18
53
41
0
0
58
0.98
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16
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15
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0
0
56
0.99
26849328--26849470
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2.6
56
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170
48
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2
40
1.48
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19
2.4
19
85
3
56
43
13
2
41
1.55
26856259--26856322
15
4.3
15
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7
76
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1.61
26862808--26862886
15
5.3
15
89
6
88
58
20
11
10
1.61
26862808--26862886
30
2.6
30
86
4
97
58
20
11
10
1.61
26866887--26866953
19
3.3
19
70
22
64
43
10
2
43
1.54
26866887--26866971
42
2.0
42
100
0
170
43
11
2
42
1.54
26866887--26866953
23
3.1
22
70
17
61
43
10
2
43
1.54
26866899--26866966
19
3.2
22
68
16
70
44
11
1
42
1.50
26870906--26870959
23
2.3
24
84
9
76
38
22
18
20
1.93
26872890--26872915
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
26875918--26876076
54
3.0
53
83
6
162
24
23
17
34
1.96
26882172--26882229
29
2.0
28
93
3
98
24
3
6
65
1.33
26882179--26882237
29
2.0
29
83
6
75
30
3
6
59
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26887796--26888411
137
4.5
138
85
5
859
28
7
6
56
1.53
26887798--26888411
279
2.2
275
86
5
871
28
7
6
56
1.53
26888456--26888488
11
2.8
12
86
9
50
72
0
3
24
0.98
26889655--26889698
15
2.7
16
86
10
54
59
2
6
31
1.36
26891886--26891943
10
5.8
10
86
8
73
24
10
1
63
1.35
26891886--26891943
20
2.9
20
87
5
82
24
10
1
63
1.35
26892672--26892747
39
1.9
39
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118
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10
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60
1.46
26895677--26895727
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3
0
76
0.94
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3
260
28
16
25
29
1.97
26897718--26897765
20
2.4
20
86
6
62
25
6
2
66
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325