Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  105  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
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1.21
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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51
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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19
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32
1.96
33880051--33880259
73
2.9
73
81
9
257
27
18
23
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33880199--33880437
87
2.7
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249
29
16
18
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1.93
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0
54
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12
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12
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0
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4
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11
1.17
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24
1.9
26
84
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35
0
6
58
1.23
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21
1.9
20
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5
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23
2
10
64
1.37
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24
2.3
24
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0
101
34
16
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40
1.80
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23
2.0
23
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0
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29
1.80
33926004--33926075
28
2.6
28
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0
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27
27
12
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1.93
33929148--33929211
18
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18
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0
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18
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26
15
1.91
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31
2.0
30
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27
4
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1.52
33934623--33934664
12
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54
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20
0
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18
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18
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10
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16
0
75
1.01
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1.90
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17
2.1
17
89
10
54
40
0
0
60
0.97
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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0
4
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24
20
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1.97
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24
2.2
23
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2.0
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26
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2.0
148
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0
0
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1.00
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0
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1.18
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0
0
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0
0
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7.7
12
70
17
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45
0
1
53
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34002325--34002372
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25
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0
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0
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0
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0
0
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0
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77
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325