Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  311  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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126
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2
2
32
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98574883--98574921
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28
1.95
98584915--98585434
132
4.0
130
79
6
510
34
16
20
29
1.94
98590729--98590870
73
2.0
73
88
1
214
30
14
4
49
1.65
98597045--98597109
34
2.0
34
84
6
89
30
26
16
26
1.97
98598942--98599049
26
4.2
26
92
0
180
36
23
7
33
1.83
98600922--98600961
13
3.2
13
85
3
55
70
2
2
25
1.13
98603912--98604035
46
2.7
46
82
6
144
30
16
23
29
1.96
98604007--98604181
50
3.6
50
74
9
182
27
18
22
31
1.97
98604005--98604216
94
2.3
94
83
0
280
28
19
20
31
1.97
98604433--98604583
45
3.4
45
75
9
121
31
17
19
31
1.95
98604386--98604601
89
2.4
89
84
3
256
32
17
21
28
1.96
98604389--98604541
44
3.5
43
77
3
162
30
20
20
28
1.98
98604452--98604586
45
3.0
46
76
8
134
34
17
20
27
1.95
98604464--98604630
89
1.9
89
82
2
210
35
17
20
26
1.95
98606262--98606361
52
1.9
52
85
4
139
32
4
4
60
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98606278--98606361
26
3.2
26
73
6
71
29
4
4
60
1.38
98606439--98606508
27
2.7
26
82
4
86
32
5
2
58
1.36
98606645--98606765
42
3.0
41
72
15
110
31
5
4
58
1.40
98609796--98609835
16
2.6
15
84
7
53
35
7
0
57
1.27
98617043--98617069
9
3.0
9
100
0
54
22
55
11
11
1.66
98621026--98621053
11
2.5
11
100
0
56
35
14
0
50
1.43
98623363--98623428
28
2.3
29
78
2
71
31
24
3
40
1.70
98632767--98633674
44
20.2
44
71
10
455
32
16
19
30
1.95
98632764--98633290
133
4.0
132
82
4
598
32
15
20
31
1.93
98635167--98635225
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2.3
23
76
23
57
22
8
8
61
1.52
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11
2.5
11
100
0
56
35
14
0
50
1.43
98635247--98635296
21
2.4
22
76
10
59
26
8
0
66
1.19
98635300--98635326
14
1.9
14
100
0
54
33
0
7
59
1.25
98638450--98638624
87
2.0
87
98
0
341
30
18
24
26
1.98
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22
4.7
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16
71
32
3
1
63
1.16
98639244--98639341
9
10.8
9
72
13
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33
3
1
62
1.18
98639248--98639390
7
21.4
7
65
17
63
33
3
2
60
1.25
98639489--98639573
23
3.6
22
73
10
62
32
5
1
60
1.29
98639525--98639569
14
2.9
15
87
12
65
35
4
2
57
1.31
98642164--98642200
15
2.5
15
95
0
65
18
13
10
56
1.66
98642769--98642813
17
2.6
17
80
16
56
48
8
6
35
1.61
98643275--98643362
19
4.6
20
77
13
78
67
2
4
26
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98643275--98643362
38
2.3
38
81
9
108
67
2
4
26
1.22
98643504--98643543
21
1.9
21
89
0
62
55
0
15
30
1.41
98643735--98643799
19
3.4
19
78
16
64
27
9
1
61
1.35
98643801--98643870
30
2.3
30
79
16
65
42
4
1
51
1.30
98649926--98650056
57
2.3
57
80
5
140
42
2
3
51
1.29
98650623--98650732
55
2.0
55
100
0
220
20
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98653524--98653582
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1.9
31
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50
8
8
32
1.63
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15
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0
0
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0
2
25
0.96
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5
5.4
5
100
0
54
40
0
0
59
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325