Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  10  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2097771--2097873
29
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0
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1.97
2105892--2106312
136
3.1
136
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0
781
32
24
18
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1.97
2106559--2106610
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2.0
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2111902--2112118
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3.3
64
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31
25
17
25
1.97
2111868--2112289
136
3.1
136
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0
763
32
24
18
24
1.97
2115123--2115161
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2.6
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12
51
2
15
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0.95
2115201--2115234
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30
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2.4
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0
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0
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1.19
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2.0
24
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4
58
56
0
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2.1
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12
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0
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0
0
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0
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0
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51
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0
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24
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2
0
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2.0
65
86
3
179
39
11
12
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2154323--2154363
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11
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0
0
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2.1
18
100
0
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47
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2156042--2156250
78
2.7
78
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0
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19
12
30
1.89
2176876--2176936
13
4.8
13
80
7
72
39
8
16
36
1.78
2180957--2181029
37
2.0
37
100
0
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20
5
10
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1.47
2180966--2181029
18
3.5
18
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12
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21
6
7
64
1.43
2186381--2186435
17
3.5
17
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19
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9
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80
0.99
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30
2.4
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10
8
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79
0.99
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16
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17
71
20
61
11
5
3
79
1.02
2186469--2186540
10
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10
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4
4
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51
0
0
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1.00
2186587--2186728
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4.0
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2
2
55
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2186780--2186828
21
2.3
21
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64
22
6
0
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1.08
2186893--2186940
17
2.8
17
70
3
51
16
4
2
77
1.03
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18
3.9
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24
0
1
74
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18
0
2
79
0.84
2187020--2187118
35
2.8
34
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14
112
35
2
2
60
1.20
2187020--2187118
34
2.8
35
79
14
114
35
2
2
60
1.20
2187072--2187118
24
1.9
25
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12
62
38
0
2
59
1.09
2187147--2187221
20
3.7
20
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28
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37
4
10
48
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14
2.3
15
94
5
59
54
0
0
45
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2187370--2187416
22
2.1
23
84
11
62
61
0
2
36
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2187373--2187509
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3.9
36
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2
1
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1.19
2187400--2187424
13
1.9
13
100
0
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0
4
32
1.12
2187559--2187601
18
2.5
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14
61
81
4
2
11
0.93
2187622--2187678
13
4.1
14
75
22
57
80
1
7
10
0.96
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17
3.8
16
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19
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77
1
11
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1.05
2187622--2187700
30
2.7
29
88
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115
79
1
10
8
0.98
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5
14.8
5
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20
50
78
2
10
7
1.04
2187635--2187705
17
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17
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16
64
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2
11
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1.04
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1.9
23
90
0
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0
0
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2
0
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1.08
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5
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6
0
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1.18
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2.4
19
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10
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46
0
2
51
1.13
2207719--2207784
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2.7
23
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13
62
46
4
1
46
1.32
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10
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6
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1.53
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2.2
19
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20
20
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19
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0
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12
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1
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1.12
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20
2.0
20
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10
53
69
0
2
28
1.02
2220776--2220903
34
3.7
35
81
8
147
65
0
2
31
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2220799--2220925
68
1.9
68
86
3
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1
1
32
1.12
2220776--2220926
58
2.5
61
69
26
60
65
1
1
31
1.12
2220800--2220927
12
11.0
12
74
17
101
64
1
1
32
1.13
2220914--2220952
21
2.0
21
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10
55
46
2
2
48
1.29
2220959--2221015
29
2.0
29
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6
89
64
0
0
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26
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0
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32
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10
100
0
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0
0
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5
61
44
1
0
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0
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8
5
13
1.27
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3
34.0
3
96
3
190
32
1
32
32
1.69
2234862--2234904
22
2.0
22
95
0
77
34
9
30
25
1.87
2241721--2241755
15
2.3
15
90
0
52
14
40
31
14
1.86
2247987--2248079
33
2.8
33
85
0
105
22
12
49
15
1.78
2249855--2250110
40
6.5
39
88
7
358
23
28
23
24
2.00
2250814--2250841
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
2258016--2258269
39
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39
87
8
340
23
28
24
23
1.99
2262236--2262271
3
12.3
3
91
5
56
0
27
0
72
0.85
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22
2.7
22
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13
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0
27
0
72
0.85
2262606--2262673
25
2.8
25
75
20
72
66
1
0
32
1.01
2284856--2284914
16
3.6
16
77
6
57
67
3
23
5
1.26
2290831--2290855
13
1.9
13
100
0
50
24
0
12
64
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2301168--2301227
30
2.0
30
81
12
70
33
1
8
56
1.39
2301401--2301438
18
2.2
18
90
4
60
26
2
10
60
1.43
2302404--2302444
21
2.0
21
85
4
57
43
2
0
53
1.13
2306505--2306529
1
25.0
1
100
0
50
0
0
0
100
0.00
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5
10.0
5
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8
68
0
34
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7
1.27
2317316--2317367
21
2.5
21
100
0
104
0
34
57
7
1.27
2317515--2317574
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
2317545--2317603
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
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15
2.1
16
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11
50
69
0
0
30
0.88
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7
6.4
7
85
14
67
56
0
0
43
0.99
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8
8.5
8
78
16
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55
0
0
44
0.99
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21
2.0
21
85
0
55
31
21
26
19
1.97
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20
2.6
20
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20
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58
7
0
33
1.27
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3
15.0
3
100
0
90
33
0
0
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0.92
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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39
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39
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1
510
18
23
29
29
1.98
2336524--2336858
155
2.1
156
90
3
530
18
23
29
28
1.98
2338185--2338220
18
2.0
18
100
0
72
11
16
22
50
1.77
2339372--2339427
27
2.1
27
96
0
103
35
12
21
30
1.90
2340347--2340446
33
3.1
32
77
18
116
79
12
5
4
1.04
2340363--2340446
30
2.7
30
82
12
91
80
9
5
3
0.98
2342936--2342971
12
3.0
12
87
0
54
25
22
5
47
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2349366--2349655
24
12.1
24
97
0
519
36
25
17
20
1.94
2353942--2354075
51
2.6
51
91
5
216
33
5
24
36
1.78
2353942--2354075
26
5.2
26
96
2
218
33
5
24
36
1.78
2359767--2359901
26
5.2
26
97
0
227
34
5
24
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1.78
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4
7.0
4
100
0
56
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0
0
25
0.81
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3.3
59
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2
327
61
3
7
27
1.38
2369133--2369269
51
2.7
51
87
0
193
29
20
16
32
1.95
2368915--2369358
189
2.3
191
83
2
527
29
18
18
33
1.95
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51
5.4
45
74
13
192
29
20
17
32
1.95
2368860--2369361
44
10.8
45
71
13
230
28
19
18
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325