Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  28  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6539014--6539197
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61
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1.98
6544775--6544958
101
1.8
99
86
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262
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27
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2.0
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2.0
42
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6567727--6567757
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2.0
22
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2.0
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2.0
112
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304
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19
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5
1
51
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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2
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0
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0
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10
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38
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0
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2.0
16
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0
29
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6620812--6620859
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5
100
0
96
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0
0
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2.0
21
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1.24
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0
0
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23
23
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22
1.99
6650518--6650560
20
2.2
20
86
0
59
4
18
16
60
1.52
6650515--6650584
30
2.3
30
80
4
79
7
21
17
54
1.66
6653669--6653764
33
2.7
35
77
18
101
38
0
3
58
1.14
6653688--6653761
33
2.2
33
92
0
121
37
0
4
58
1.17
6653683--6653765
3
27.7
3
71
9
62
37
0
3
59
1.15
6657036--6657278
118
2.1
119
91
0
389
41
9
8
41
1.66
6657275--6657316
19
2.3
19
91
4
68
30
14
9
45
1.77
6658552--6658600
17
2.7
18
84
12
64
28
2
0
69
1.00
6660280--6660348
28
2.5
28
92
2
113
18
10
26
44
1.81
6662018--6662182
53
3.1
53
88
6
221
26
15
28
29
1.96
6669508--6669673
53
3.1
53
88
6
221
25
15
28
30
1.96
6677000--6677165
53
3.1
53
89
6
230
26
15
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6683617--6683929
46
6.8
46
91
1
430
21
24
14
40
1.90
6691348--6691385
18
2.1
18
85
9
51
55
5
10
28
1.56
6697450--6697990
273
2.0
273
89
0
841
33
15
14
36
1.89
6702314--6702344
9
3.4
9
95
0
53
45
12
19
22
1.84
6716054--6716126
21
3.6
19
78
10
65
47
1
0
50
1.09
6716348--6716418
13
5.4
14
85
6
62
39
25
7
28
1.82
6719189--6719226
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
6720881--6720990
48
2.3
48
82
0
121
35
14
19
30
1.91
6720915--6721005
24
3.8
24
69
16
71
32
14
20
31
1.93
6720965--6721015
24
2.1
24
81
0
57
29
15
23
31
1.95
6729537--6729578
4
10.2
4
94
5
75
73
0
2
23
0.94
6729733--6729770
3
13.0
3
83
5
51
63
0
5
31
1.17
6729827--6729862
18
2.0
18
88
0
54
77
0
5
16
0.94
6729932--6729970
12
3.2
12
89
7
53
71
0
0
28
0.86
6731468--6731602
44
3.1
44
80
4
164
31
20
15
31
1.94
6732842--6732950
45
2.4
47
81
9
136
35
22
15
25
1.94
6733712--6733790
4
18.8
4
73
12
61
5
25
3
65
1.30
6735519--6735633
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
6735519--6735633
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
6737247--6737330
26
3.2
26
98
0
159
38
23
3
34
1.72
6741283--6741397
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
6741283--6741397
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6742999--6743056
26
2.2
26
96
0
107
37
24
3
34
1.72
6748886--6748996
47
2.4
47
81
6
136
36
21
16
26
1.94
6749759--6749791
4
8.2
4
100
0
66
0
24
0
75
0.80
6749765--6749892
47
2.7
47
91
3
197
10
24
3
61
1.44
6750271--6751053
44
17.6
44
75
6
576
30
20
15
33
1.94
6750286--6751047
133
5.7
133
82
5
754
30
20
15
33
1.94
6750345--6751053
89
8.0
89
77
4
558
30
20
15
33
1.93
6750272--6751053
266
2.9
264
80
5
853
30
20
15
33
1.94
6756484--6756707
110
2.0
109
81
9
258
29
13
17
39
1.88
6757530--6757777
71
3.5
71
77
14
215
61
4
8
25
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325