Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  11  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2377103--2377155
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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0
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2.4
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3.0
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54
2.9
50
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12
183
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19
16
29
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0
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2.8
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1
3
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1.20
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18
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2
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1.14
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7
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16
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25
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1
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1.19
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2.1
35
82
4
89
31
0
2
65
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2
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3
70
1.22
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15
2.1
17
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11
52
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15
0
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1.30
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0
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55
82
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25
0
2
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6
86
9
52
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0
2
72
0.95
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24
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70
26
0
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40
1
0
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1.10
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20
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59
70
0
29
0
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104
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1
14
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1.49
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2.7
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162
30
15
26
27
1.96
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26
4.2
26
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0
189
32
7
24
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2552415--2552465
24
2.0
25
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37
23
13
25
1.92
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4.2
26
93
0
189
32
7
24
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1.83
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21
3.2
20
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8
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13
26
13
46
1.81
2566919--2566976
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2.6
22
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41
17
5
36
1.72
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19
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33
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19
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0
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0
0
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47
2.4
47
83
6
145
35
22
16
26
1.95
2580198--2580308
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
2582700--2582752
15
3.3
15
87
12
79
26
7
0
66
1.18
2582889--2582950
25
2.5
24
75
17
63
32
9
1
56
1.41
2583112--2583550
125
3.4
124
82
5
466
27
16
19
37
1.92
2584829--2584874
22
2.1
22
100
0
92
34
13
13
39
1.83
2585102--2585147
19
2.4
19
85
7
58
21
21
13
43
1.86
2589199--2589325
64
2.0
64
92
0
209
29
18
16
36
1.92
2589618--2590003
88
4.4
88
78
8
415
26
18
22
33
1.97
2589425--2590266
133
6.3
134
79
6
940
27
18
21
31
1.97
2590414--2590513
43
2.3
44
81
8
116
36
25
16
23
1.94
2590414--2590516
44
2.4
43
83
4
127
35
25
16
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2591559--2591645
44
2.0
44
84
13
117
26
6
0
66
1.16
2591587--2591639
15
3.3
15
85
12
70
26
5
0
67
1.12
2591562--2591672
22
5.0
23
74
21
80
28
6
0
64
1.17
2592002--2592440
130
3.4
127
83
6
512
27
15
19
38
1.92
2592002--2592440
125
3.4
125
84
5
511
27
15
19
38
1.92
2600505--2600563
4
14.8
4
100
0
118
49
25
0
25
1.51
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33
2.3
33
100
0
154
15
42
2
38
1.61
2615147--2615185
18
2.2
18
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9
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7
10
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1.59
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19
2.3
18
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8
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39
0
2
58
1.11
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32
2.2
33
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7
101
39
9
11
39
1.74
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16
2.1
16
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11
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48
0
9
42
1.35
2626501--2626535
18
1.9
18
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0
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40
14
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1.90
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12
3.1
12
100
0
74
35
16
32
16
1.91
2629856--2629921
34
1.9
35
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9
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48
1
6
43
1.36
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2.0
26
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0
11
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13
2.1
13
100
0
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14
0
55
1.40
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2.1
38
100
0
156
11
17
15
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1.69
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35
2.0
35
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2
97
35
9
11
43
1.74
2661898--2661956
29
2.0
29
100
0
118
27
6
10
55
1.58
2662359--2662400
4
10.5
4
85
10
59
26
2
23
47
1.64
2664991--2665033
20
2.2
20
91
0
68
30
13
2
53
1.53
2671431--2671456
13
2.0
13
100
0
52
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2681575--2681756
83
2.2
81
78
6
208
38
13
6
42
1.69
2681804--2681884
24
3.1
26
72
19
71
62
1
1
34
1.11
2681865--2681912
9
5.6
8
76
13
51
70
2
2
25
1.09
2681865--2681922
17
3.4
17
75
13
55
68
1
1
27
1.08
2681849--2681913
27
2.4
27
86
0
85
69
1
3
26
1.12
2682172--2682216
22
2.0
22
82
4
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4
0
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1.19
2682177--2682232
10
5.5
10
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1
0
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1.06
2682175--2682277
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10
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0
0
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1.01
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0
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0
0
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19
1.9
19
88
0
56
40
5
5
48
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325