Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  313  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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25
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
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(0-2)
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2.0
18
94
0
63
25
58
0
16
1.38
95073150--95073267
60
2.0
61
83
9
154
25
5
6
62
1.41
95073256--95073292
19
2.0
18
94
5
65
32
0
0
67
0.91
95073264--95073294
14
2.2
14
94
0
53
32
0
0
67
0.91
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126
1.9
126
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1
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29
16
15
38
1.90
95075838--95075961
19
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19
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10
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37
11
13
37
1.81
95075838--95075961
18
6.8
18
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5
144
37
11
13
37
1.81
95075846--95075961
35
3.2
35
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3
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12
12
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1.81
95076254--95076300
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25
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1.84
95078516--95078565
15
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15
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1.86
95082299--95082406
44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
95083934--95084007
21
3.5
21
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15
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82
1
13
2
0.84
95083954--95084001
15
3.1
16
82
8
64
83
0
14
2
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7.6
7
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18
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0
14
1
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22
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1
13
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21
22
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207
4.4
207
94
0
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17
23
29
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1.84
95086773--95086861
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0
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0
0
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2.0
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0
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12
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0
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66
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27
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2.1
19
100
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0
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26
2.0
24
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7
73
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6
0
30
1.18
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0
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22
1.9
22
85
0
57
11
9
16
61
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95115360--95115417
27
2.2
27
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3
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5
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1.32
95117130--95117202
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3.0
25
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1.85
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34
2.1
34
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0
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0
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0
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0
0
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2
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0
70
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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