Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  282  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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38
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3.9
26
94
3
170
35
26
5
32
1.81
87517843--87517873
16
1.9
16
93
0
53
25
16
6
51
1.68
87519760--87519804
21
2.1
21
84
8
56
48
2
2
46
1.26
87519749--87519916
61
2.7
61
74
6
169
54
2
3
39
1.33
87523240--87523291
24
2.2
24
89
0
77
1
13
30
53
1.50
87524377--87524509
40
3.5
40
70
14
116
36
19
19
24
1.95
87524296--87524552
75
3.4
75
82
2
286
38
20
17
23
1.93
87529716--87529786
36
2.0
35
81
8
81
47
1
9
40
1.45
87529830--87529874
11
4.1
11
82
0
54
60
4
0
35
1.17
87530359--87530393
11
3.1
12
88
12
56
48
0
51
0
1.00
87530492--87530559
33
2.1
33
83
10
86
29
0
5
64
1.17
87530585--87530615
6
5.3
6
92
7
55
83
0
0
16
0.64
87530603--87530641
17
2.3
17
86
8
53
71
0
10
17
1.12
87531728--87532630
74
11.7
74
75
13
640
33
18
16
32
1.93
87531728--87532630
149
5.8
149
80
10
915
33
18
16
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87532080--87532617
73
7.0
73
76
10
468
33
18
16
31
1.93
87532249--87532617
72
4.9
73
83
9
411
33
18
16
31
1.93
87532402--87532617
75
2.9
75
91
0
290
32
17
16
33
1.92
87544566--87544648
19
4.2
19
68
18
53
59
6
4
30
1.43
87544958--87544996
9
4.1
9
81
12
51
58
2
0
38
1.12
87544959--87544998
11
3.8
11
80
12
57
57
2
0
40
1.12
87544956--87544996
20
2.0
20
95
0
73
60
2
0
36
1.10
87545762--87545797
17
2.1
17
90
10
56
0
19
22
58
1.40
87546026--87546068
17
2.4
18
84
3
61
58
2
27
11
1.46
87547446--87547494
23
2.1
24
82
14
59
48
2
6
42
1.39
87551699--87551735
11
3.1
12
88
11
58
48
0
51
0
1.00
87552361--87552399
17
2.3
17
86
8
53
71
0
10
17
1.12
87554763--87554825
31
2.0
31
84
6
83
19
17
11
52
1.74
87555684--87555740
26
2.2
26
81
6
62
22
28
26
22
1.99
87555743--87555781
17
2.3
17
86
8
53
23
25
25
25
2.00
87555752--87555807
18
3.3
17
80
7
60
23
30
21
25
1.99
87555777--87555818
18
2.3
18
83
0
57
23
21
23
30
1.99
87558462--87558499
14
2.8
13
88
7
58
73
0
26
0
0.83
87559217--87559273
16
3.6
15
76
19
62
35
5
21
38
1.76
87559767--87559880
38
3.0
38
100
0
228
28
13
26
31
1.93
87566545--87569329
419
6.8
422
74
11
1890
26
19
12
42
1.87
87576925--87576987
30
2.1
30
93
0
108
23
4
12
58
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87577537--87577878
127
2.6
128
89
2
497
45
15
9
29
1.77
87577953--87578024
35
2.1
35
97
0
135
37
13
8
40
1.75
87578841--87578872
16
2.0
16
100
0
64
37
25
12
25
1.91
87581202--87581242
11
3.7
11
87
9
57
21
0
2
75
0.92
87581714--87581946
127
1.8
126
89
0
367
31
15
15
36
1.90
87585676--87585731
28
2.0
28
100
0
112
46
17
14
21
1.84
87586803--87586863
13
4.7
13
85
0
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29
8
24
1.84
87586802--87586863
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2.4
26
88
0
106
37
29
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1.85
87588671--87588766
3
32.0
3
93
4
167
32
2
0
65
1.04
87588817--87588882
29
2.2
28
84
10
78
27
7
0
65
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325