Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  39  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9607809--9607871
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2.9
22
79
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1
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1.13
9608066--9608118
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2.3
23
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0
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0
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0
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1
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2.1
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1.25
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1
1
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29
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32
0
1
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17
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1.08
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71
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17
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0
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0
0
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3
3
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1.27
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19
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33
3
3
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1.29
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2.2
18
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5
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2
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2
100
0
62
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9633415--9633475
24
2.5
25
89
2
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4
1
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1.30
9647436--9647549
47
2.5
44
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17
115
36
6
0
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1.24
9647819--9647884
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3.7
205
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2
1093
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17
3.6
16
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17
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34
1
0
63
1.04
9662504--9662569
17
3.9
17
69
25
50
36
1
0
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1.05
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1.84
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2.1
33
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0
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2.0
142
100
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0
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17
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45
0
2
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1.13
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19
2.1
20
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2
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1.45
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10
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0
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2
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9674495--9674542
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14
88
0
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20
2
77
0.88
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28
2.7
27
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91
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4
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37
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28
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21
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100
0
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12
0
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16
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53
12
12
2
71
1.24
9689301--9689341
19
2.1
20
86
4
57
31
9
2
56
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
13
91
4
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51
21
0
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1.48
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17
1.9
17
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11
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18
0
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1.00
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0
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16
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1.07
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22.0
3
90
9
107
66
0
1
32
1.01
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2.0
25
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4
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54
6
4
36
1.44
9701778--9701814
13
2.8
13
91
4
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21
0
27
1.48
9703262--9703292
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1.9
16
93
0
53
16
9
0
74
1.07
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3
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113
66
0
1
32
1.01
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48
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47
74
6
230
27
18
27
26
1.98
9704316--9704597
98
2.9
97
89
2
422
27
18
28
26
1.98
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2.0
32
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0
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12
14
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18
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15
24
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1.94
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6.7
46
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8
395
37
15
24
22
1.93
9718167--9718469
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3.5
84
91
4
459
35
15
24
23
1.94
9718299--9718513
90
2.4
90
85
3
270
38
14
24
21
1.92
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25
2.0
25
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8
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53
4
14
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1.60
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3.3
12
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0
0
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30
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1.64
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0
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14
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36
7
31
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1.83
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41
2.0
42
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7
96
24
9
17
48
1.76
9742432--9742898
157
2.9
156
85
7
613
40
10
3
44
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9747974--9748158
40
4.6
39
85
4
217
28
22
25
23
2.00
9747973--9748179
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22
26
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2.00
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211
26
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25
25
2.00
9756026--9756210
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4.6
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4
208
28
22
24
23
1.99
9756025--9756231
80
2.6
80
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4
238
27
22
25
25
2.00
9756024--9756231
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5.2
40
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204
27
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25
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9759171--9759206
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0
0
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0
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0
0
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20
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0
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0
96
26
21
26
26
1.99
9773395--9773428
15
2.2
16
90
10
54
67
5
5
20
1.33
9773421--9773743
3
107.7
3
72
5
170
59
0
8
31
1.34
9773516--9773660
76
1.9
76
81
2
175
60
1
8
30
1.35
9775098--9775575
44
10.8
44
70
11
214
26
20
20
32
1.97
9775332--9775578
130
1.9
130
89
3
390
27
21
19
31
1.98
9787272--9787322
14
3.5
16
80
17
58
70
3
3
21
1.20
9787315--9787621
3
102.7
3
71
8
126
57
1
9
31
1.41
9787315--9787621
12
25.4
12
70
12
139
57
1
9
31
1.41
9787387--9787437
13
3.8
13
80
12
50
58
1
9
29
1.41
9791570--9791631
30
2.1
30
88
11
92
30
3
8
58
1.43
9791755--9791787
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
9794627--9794712
39
2.2
38
83
10
102
37
1
3
58
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9794781--9794845
33
2.0
33
87
6
96
30
9
10
49
1.69
9797990--9798117
63
2.0
64
98
1
249
34
10
19
35
1.87
9798090--9798148
29
2.0
29
93
0
100
16
16
22
44
1.87
9801969--9802013
23
2.0
24
86
8
67
35
11
11
42
1.76
9802123--9802319
95
2.1
93
96
1
358
40
12
4
42
1.63
9802919--9802949
15
2.1
15
93
0
53
32
0
0
67
0.91
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15
4.5
15
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14
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29
7
0
62
1.22
9803657--9803774
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8
0
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1.32
9803693--9803738
15
2.9
15
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6
74
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8
0
65
1.21
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29
4.1
29
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27
7
1
63
1.31
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3
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0
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0
0
68
0.90
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16
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0
53
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0
3
32
1.09
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16
2.9
16
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12
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71
6
0
21
1.08
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21
2.0
21
86
9
59
47
4
4
42
1.45
9827913--9827953
20
2.0
21
85
9
57
75
4
2
17
1.08
9829262--9829793
176
3.0
176
90
1
843
26
21
21
30
1.98
9829310--9830012
44
16.2
43
68
14
268
26
22
21
30
1.99
9829763--9829831
34
2.0
34
97
0
129
24
30
21
23
1.99
9829588--9830003
209
2.0
210
90
1
665
25
24
21
29
1.99
9829943--9830035
44
2.1
44
87
0
132
29
25
19
25
1.99
9829797--9830061
88
3.0
87
71
10
214
27
22
21
28
1.99
9829829--9830098
88
3.1
86
71
10
249
27
22
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9831213--9831280
19
3.7
19
71
15
63
16
0
5
77
0.95
9831215--9831278
31
1.9
35
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12
100
15
0
6
78
0.95
9831211--9831274
27
2.4
27
89
5
94
15
0
6
78
0.95
9831218--9831280
23
2.7
23
79
15
76
17
0
4
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0.93
9838282--9838311
16
1.9
16
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6
53
73
0
0
26
0.84
9846406--9846530
31
4.1
31
72
6
112
47
14
11
27
1.78
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26
2.1
26
100
0
110
20
10
12
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2.2
23
96
0
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35
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100
0
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0
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3
13.3
3
100
0
80
67
0
0
32
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325