Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  33  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7816400--7816460
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1.99
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80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
7840793--7840900
40
2.7
38
85
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128
21
29
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7849934--7850040
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189
36
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4.2
26
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0
180
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2.1
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1.99
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3.6
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1.94
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1.9
167
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430
35
16
19
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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1.94
7913236--7913305
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2.5
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2
106
28
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1.95
7913236--7913317
27
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103
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7920428--7920536
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1.99
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1.99
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1.8
124
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2.0
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0
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3
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1.98
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3.7
29
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119
27
31
14
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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21
21
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1.69
7968542--7968592
8
6.4
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81
0
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21
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1.69
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1.9
18
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0
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17
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1.21
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14
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10
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1.96
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2.1
56
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132
28
15
32
23
1.95
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19
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29
19
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16
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19
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180
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238
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0
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53
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0
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320
28
28
17
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8025279--8025576
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3.5
86
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354
28
28
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25
1.97
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2
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0
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0
0
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1.00
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2.0
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0
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0
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21
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39
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26
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8033220--8033297
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3
72
12
59
39
30
2
26
1.70
8033523--8033560
3
12.7
3
83
10
51
0
2
28
68
1.03
8047704--8047757
24
2.3
23
87
6
81
31
12
3
51
1.57
8047710--8047757
24
2.0
24
95
0
87
31
10
4
54
1.53
8049863--8049930
16
4.2
16
79
17
63
44
2
1
51
1.25
8049940--8049973
17
2.0
17
88
0
50
29
17
0
52
1.45
8052788--8052843
21
2.7
19
74
15
58
66
5
7
21
1.37
8052914--8052943
14
2.1
14
100
0
60
33
0
6
60
1.23
8053306--8053335
6
5.0
6
100
0
60
16
0
0
83
0.65
8053800--8053841
19
2.2
20
82
4
50
52
2
2
42
1.27
8054720--8054763
21
2.0
22
86
4
63
9
18
0
72
1.10
8055746--8055777
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
8056305--8056336
2
15.5
2
93
6
55
46
0
3
50
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8057295--8057326
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
8058697--8058729
17
2.0
17
94
5
59
27
0
6
66
1.15
8061733--8061800
33
2.0
34
88
2
102
35
20
10
33
1.87
8061733--8061802
34
2.1
34
86
5
97
35
20
11
32
1.88
8068325--8068376
21
2.3
23
80
9
63
1
34
0
63
1.06
8072094--8072170
20
3.8
20
68
13
50
37
1
3
57
1.26
8073345--8073418
34
2.2
34
95
2
132
52
0
9
37
1.34
8080138--8080194
28
2.0
28
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0
78
40
14
3
42
1.62
8081649--8081735
3
30.3
3
68
21
53
63
4
1
31
1.22
8081669--8081735
19
3.5
19
72
25
52
65
4
1
28
1.21
8083331--8083378
24
2.0
24
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4
78
31
16
6
45
1.72
8086602--8086629
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3.5
8
100
0
56
46
0
0
53
1.00
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44
2.0
46
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8
121
38
24
3
33
1.72
8096668--8096706
16
2.4
16
91
8
62
28
23
7
41
1.82
8098133--8098162
15
1.9
16
93
6
53
56
0
0
43
0.99
8098161--8098205
19
2.4
19
88
0
72
33
0
6
60
1.23
8098834--8098965
70
1.9
70
86
6
191
31
11
14
43
1.81
8113097--8113188
40
2.2
43
81
7
111
48
21
14
15
1.80
8113124--8113228
20
5.0
21
78
13
101
49
20
16
13
1.79
8114414--8114448
18
1.9
18
88
0
52
71
2
8
17
1.23
8117695--8117800
22
4.8
22
81
4
79
21
26
12
39
1.89
8124133--8124233
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8131990--8132090
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
8134200--8134247
19
2.5
19
86
0
60
22
12
31
33
1.91
8134212--8134250
19
2.1
19
95
0
69
17
20
28
33
1.96
8138623--8138771
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
8138664--8138771
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
8142741--8142773
17
1.9
17
93
0
57
15
15
12
57
1.65
8146735--8146795
30
2.0
31
81
9
72
42
3
4
49
1.40
8148217--8148401
46
4.0
46
87
0
264
20
23
13
42
1.88
8148222--8148401
92
2.0
91
92
1
297
20
23
13
42
1.87
8150815--8150882
30
2.3
30
84
5
84
27
19
5
47
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325