Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  93  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27247977--27248031
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20
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0
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0
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0
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12
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34
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27257020--27257085
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2.3
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4
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2.4
75
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212
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1.90
27260677--27260842
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4.6
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11
23
33
1.90
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75
2.4
74
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216
31
11
23
33
1.90
27268173--27268337
35
4.6
35
84
9
174
31
11
23
33
1.90
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2.9
16
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1.9
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1.99
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1.97
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1.8
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1.99
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28
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1.98
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2.1
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0
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30
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1.95
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2.4
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39
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20
1.89
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2.6
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0
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1.95
27305670--27305716
23
2.0
23
91
0
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23
27
12
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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0
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21
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1.93
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0
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12
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0
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52
1.38
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22
1.99
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21
29
25
23
1.99
27329882--27330030
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
27329923--27330030
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
27337991--27338139
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
27338032--27338139
40
2.7
38
85
8
128
21
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25
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1.99
27343530--27343592
24
2.6
24
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17
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1.98
27355471--27355527
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2.1
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3.1
10
90
0
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22
29
22
25
1.99
27355753--27355792
20
2.0
20
85
4
55
22
35
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20
1.96
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3.3
10
88
8
50
2
20
17
58
1.51
27364741--27364810
27
2.5
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2
124
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30
1.95
27364741--27364822
27
3.0
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15
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30
1.96
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4.7
29
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3
146
23
30
16
29
1.96
27367735--27367924
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58
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170
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32
16
26
1.96
27368566--27368861
143
2.1
141
98
1
565
39
28
10
21
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27375911--27375980
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2.5
28
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2
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14
27
30
1.95
27381665--27381812
41
3.6
40
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12
149
22
22
28
26
1.99
27381656--27381834
41
4.4
41
75
13
145
22
21
29
26
1.99
27386207--27386253
14
3.4
14
77
16
62
23
17
10
48
1.77
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2.0
27
100
0
106
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11
43
1.84
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30
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30
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79
36
13
24
26
1.92
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20.0
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94
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0
0
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1.99
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39
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0
0
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2.00
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21
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1.99
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119
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120
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330
25
21
27
25
1.99
27429915--27430174
40
6.5
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308
25
21
28
25
1.99
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79
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77
85
6
306
26
21
27
25
1.99
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42
2.5
42
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111
32
25
15
25
1.95
27441747--27441862
43
2.7
42
85
5
171
31
17
23
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27441750--27441881
42
3.1
40
76
12
122
31
15
23
29
1.96
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20
2.3
20
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40
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8
38
1.74
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2.2
25
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40
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0
175
24
27
21
26
2.00
27452778--27452929
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
27460861--27461043
40
4.6
40
83
3
181
23
26
22
27
1.99
27462223--27462294
35
2.0
37
94
5
130
29
25
2
43
1.69
27464105--27464250
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
27464137--27464288
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
27472212--27472394
40
4.6
40
83
3
181
23
26
22
27
1.99
27475214--27475544
164
2.0
164
97
0
626
33
11
23
31
1.90
27478063--27478110
20
2.4
20
76
13
53
60
2
10
27
1.41
27478228--27478341
3
38.3
3
75
1
86
60
1
8
28
1.37
27479138--27479177
21
1.9
21
84
0
53
82
5
2
10
0.91
27485027--27485066
22
1.9
20
85
10
53
37
5
12
45
1.64
27487196--27487318
43
2.9
43
85
2
158
30
27
17
24
1.97
27491585--27491749
43
3.8
43
79
6
154
30
27
18
23
1.97
27491585--27491743
86
1.9
85
81
4
194
29
27
18
23
1.98
27492855--27492881
13
2.1
13
100
0
54
48
22
0
29
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27493388--27493443
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
27494931--27494980
26
1.9
26
84
8
66
42
22
12
24
1.87
27499629--27499805
46
3.9
44
77
11
185
21
20
28
29
1.98
27499626--27499798
93
1.9
93
92
0
292
21
20
29
28
1.98
27504614--27504666
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
27512297--27512329
17
1.9
17
93
0
57
6
9
0
84
0.76
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3
13.3
3
100
0
80
32
0
0
67
0.91
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8
5.1
8
97
2
75
11
0
0
88
0.53
27513206--27513367
3
54.3
3
81
6
161
29
5
1
64
1.24
27521355--27521385
5
6.2
5
100
0
62
41
0
0
58
0.98
27523328--27523405
36
2.2
35
84
4
95
48
16
11
23
1.78
27528526--27528697
3
58.3
3
80
12
196
31
4
0
63
1.19
27528863--27528951
12
7.7
12
69
14
53
28
15
2
53
1.54
27529058--27529145
3
31.0
3
70
11
51
27
5
4
62
1.37
27529062--27529100
14
2.8
14
96
0
69
25
5
5
64
1.35
27529330--27529417
34
2.6
32
75
20
79
27
14
0
57
1.37
27529408--27529507
3
34.0
3
76
6
80
32
7
2
59
1.36
27532577--27532611
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
27534299--27534358
26
2.3
26
80
5
68
21
28
11
38
1.89
27534922--27534968
10
4.6
10
85
12
51
34
0
4
61
1.15
27539169--27539206
11
3.4
11
96
3
67
26
2
18
52
1.58
27541309--27541479
43
4.0
43
77
11
188
30
28
17
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27541312--27541469
86
1.8
85
84
9
214
29
28
18
23
1.98
27541798--27541823
12
2.2
12
100
0
52
50
7
0
42
1.31
27542588--27542612
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
27546176--27546245
27
2.6
27
93
2
122
32
27
11
28
1.91
27552441--27552519
42
1.9
41
89
2
122
29
30
17
22
1.97
27553204--27553234
16
1.9
16
93
0
53
0
0
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51
1.00
27554230--27554281
24
2.2
24
85
0
68
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3
7
51
1.49
27556026--27556195
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1.9
89
84
4
227
26
18
25
29
1.98
27559062--27559197
49
2.7
50
79
10
163
25
30
19
25
1.98
27559062--27559282
99
2.3
98
81
9
255
24
29
19
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325