Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  56  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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1
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1.48
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43
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14
22
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
1.83
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18
2.3
18
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1.84
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4.2
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100
0
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16
16
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41
17
18
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1.90
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0
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1.80
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0
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1.18
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2.8
39
95
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191
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32
20
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14800165--14800289
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4
189
28
30
19
21
1.97
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2.5
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15
22
30
1.95
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1.76
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1.77
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24
85
0
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32
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0
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16
2.4
17
86
8
53
21
0
2
76
0.91
14825539--14825585
16
3.0
15
80
17
51
21
0
2
76
0.89
14832149--14832195
18
2.6
18
77
12
60
31
29
14
23
1.95
14837381--14837626
131
1.9
132
80
4
291
28
19
17
34
1.95
14843077--14843388
132
2.4
132
94
0
534
30
18
23
27
1.98
14843283--14843476
87
2.2
88
98
0
372
30
19
22
27
1.98
14843188--14843600
132
3.1
131
81
7
365
29
19
23
28
1.98
14843149--14843589
220
2.0
220
94
1
778
29
19
23
27
1.98
14843366--14844103
131
5.6
130
83
5
873
28
18
26
26
1.98
14843366--14844103
260
2.8
260
90
3
1072
28
18
26
26
1.98
14844283--14845211
44
21.1
44
86
3
1183
28
14
30
25
1.95
14857138--14857180
18
2.4
19
88
11
72
44
23
16
16
1.86
14870488--14870765
46
6.0
46
87
0
342
40
12
24
22
1.89
14871046--14871078
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14885035--14885080
22
2.1
22
100
0
92
34
13
13
39
1.83
14886804--14886841
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
14888793--14889139
46
7.7
46
86
5
451
37
14
24
22
1.92
14888744--14889139
92
4.5
84
86
7
497
37
15
24
22
1.93
14892531--14892615
47
2.0
39
100
0
98
36
9
27
27
1.87
14892496--14892829
49
6.9
49
95
0
559
33
8
28
29
1.87
14892821--14893020
48
4.2
48
94
0
337
33
6
28
32
1.83
14902649--14902683
6
5.8
6
100
0
70
34
0
14
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1.42
14902778--14902863
44
2.0
44
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0
127
40
10
3
45
1.55
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6
4.5
6
100
0
54
48
0
0
51
1.00
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17
1.9
16
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6
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43
0
3
53
1.16
14906198--14906278
37
2.2
37
100
0
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20
11
16
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1.74
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21
1.9
21
90
10
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55
7
12
25
1.63
14913381--14913406
13
2.0
13
100
0
52
30
30
7
30
1.85
14914449--14914513
32
2.0
32
90
0
103
44
21
20
13
1.86
14915115--14915174
30
2.0
30
86
0
84
10
5
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25
1.49
14919101--14919141
21
2.0
21
95
0
73
19
26
21
31
1.97
14930449--14930595
43
3.4
43
75
12
140
27
17
27
28
1.97
14939164--14939201
18
2.1
18
90
9
60
57
2
13
26
1.49
14939222--14939290
35
2.0
35
100
0
138
36
11
26
26
1.90
14939947--14939978
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
14939966--14940009
17
2.4
18
77
14
54
56
9
0
34
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14939974--14940038
28
2.3
27
76
10
67
49
10
0
40
1.38
14940004--14940034
16
1.9
16
93
0
53
38
9
0
51
1.35
14941566--14941650
5
17.0
5
72
17
61
75
2
2
20
1.03
14941584--14941644
17
3.4
18
82
11
72
78
1
3
16
0.96
14941604--14941641
12
3.1
13
85
7
53
84
0
2
13
0.73
14941571--14941668
43
2.2
46
82
10
114
73
3
3
20
1.10
14947259--14947296
17
2.1
19
90
9
62
55
5
13
26
1.59
14948008--14948039
10
3.3
10
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62
0
6
31
1.20
14948027--14948070
17
2.4
18
77
14
54
56
9
0
34
1.31
14948035--14948099
28
2.3
27
76
10
67
49
10
0
40
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325