Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  255  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2.1
22
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0
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0
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1.30
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2.0
28
100
0
112
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0
10
42
1.38
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2.0
67
95
0
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1.75
79897791--79897855
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1.9
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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79937077--79937140
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2.2
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183
22
30
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22
1.99
79947717--79947824
40
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128
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23
1.99
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3
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22
0
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79952069--79952288
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143
25
0
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79952222--79952288
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64
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0
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1.50
79952250--79952305
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0
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22
19
29
1.98
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115
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20
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1.98
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2.1
28
90
0
93
35
25
3
36
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
1.98
79964495--79964687
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217
23
22
31
22
1.99
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26
1.99
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223
24
20
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1.99
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79
78
10
226
25
19
28
26
1.99
79972814--79973034
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5.6
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189
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19
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1.99
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1.99
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27
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1.99
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18
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1.96
80000751--80000820
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2.7
26
97
0
131
65
7
5
21
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80008170--80008367
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1.96
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1.84
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0
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0
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103
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1.99
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2.7
38
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8
128
21
29
25
23
1.99
80041264--80041430
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
80045730--80045913
40
4.6
39
74
6
129
22
27
22
27
1.99
80057420--80057553
52
2.6
50
82
6
155
32
24
14
27
1.95
80060543--80060742
43
4.7
43
79
9
176
24
19
25
31
1.98
80063692--80063751
30
2.0
30
90
0
93
18
6
28
46
1.74
80065299--80065340
12
3.6
12
75
18
52
26
9
14
50
1.73
80072244--80072310
28
2.4
28
94
0
116
16
40
22
20
1.91
80073258--80073476
46
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46
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12
169
23
28
19
28
1.98
80087688--80087744
11
5.5
11
76
16
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10
19
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1.86
80087687--80087744
20
2.9
20
100
0
116
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10
18
34
1.85
80087784--80087903
26
4.7
26
88
3
154
26
21
21
30
1.99
80094384--80094491
26
4.2
26
95
0
189
31
6
25
37
1.81
80099649--80099680
15
2.1
15
94
0
55
68
9
6
15
1.36
80102195--80102231
17
2.2
17
90
0
56
32
18
0
48
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80102393--80102422
14
2.1
14
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0
51
60
0
10
30
1.30
80105234--80105285
20
2.5
20
87
3
77
30
11
5
51
1.61
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16
4.2
16
71
12
61
28
1
4
65
1.20
80106870--80106932
32
1.9
32
83
3
81
28
1
3
66
1.16
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19
2.3
19
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0
59
74
13
2
9
1.16
80108364--80108430
30
2.3
30
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84
35
5
4
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1.46
80109404--80109445
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1.9
22
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0
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2
2
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1.27
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18
2.2
18
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0
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1.68
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2.1
16
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0
0
30
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11
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33
0
44
1.53
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22
2.4
22
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25
27
0
46
1.53
80111297--80111351
11
4.9
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25
27
0
47
1.52
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19
1.9
19
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0
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2
16
37
1.62
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143
2.5
143
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623
44
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15
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2
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35
0
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1.39
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20
2.5
20
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2
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27
1.28
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27
2.3
26
76
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63
50
11
0
38
1.38
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15
2.0
15
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0
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40
10
0
50
1.36
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1.9
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3
215
28
23
16
31
1.96
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25
3.2
23
80
15
81
71
0
2
25
0.98
80120903--80121001
5
18.6
5
75
15
67
70
0
2
27
0.98
80120906--80120998
8
11.5
8
73
18
77
70
0
2
26
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80127377--80127439
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
38
1.38
80127406--80127435
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
80128974--80129039
19
3.2
21
81
12
75
69
6
3
21
1.24
80128974--80129029
20
2.8
19
79
12
60
71
3
1
23
1.11
80138058--80138213
6
25.8
6
75
18
146
48
14
17
19
1.81
80138037--80138213
30
6.1
29
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13
179
48
14
17
19
1.81
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2.4
54
98
0
247
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2.5
26
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16
1.93
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3.1
27
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80
36
25
21
15
1.94
80138715--80138797
27
3.1
26
89
5
121
36
21
22
19
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325