Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  21  of  325  ( 38914 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4980495--4980634
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2.6
55
88
2
194
18
23
22
35
1.96
4980495--4980634
27
5.2
28
88
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166
18
23
22
35
1.96
4982123--4982171
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0
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0
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1.9
26
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64
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1.38
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0
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0
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2
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23
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4985715--4985883
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2.1
81
88
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23
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3.2
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2.0
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24
15
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26
3.2
26
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3
146
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27
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1.81
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24
2.2
24
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0
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53
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41
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0
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17
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5.1
26
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1.80
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2.7
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1.88
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27
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20
25
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16
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5.5
11
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20
57
36
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20
32
1.87
5005251--5005310
20
3.0
20
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113
35
10
20
35
1.86
5005360--5005502
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5005360--5005502
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3.0
47
90
5
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28
22
22
26
1.99
5005360--5005503
71
2.0
72
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4
220
29
22
22
26
1.99
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2.1
31
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23
1.94
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1.9
25
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0
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25
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1.96
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3.0
20
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0
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34
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24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
5013465--5013607
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
5013465--5013608
71
2.0
72
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220
29
22
22
26
1.99
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2.1
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90
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23
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0
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2.0
21
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0
0
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1.20
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2.1
25
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0
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2.2
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0
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24
2.0
24
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0
69
50
10
6
33
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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1.00
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23
17
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52
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23
18
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1.96
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11
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2
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0
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1.20
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25
15
29
1.96
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132
2.3
130
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4
316
29
25
17
28
1.97
5076110--5076502
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43
74
9
281
30
24
16
29
1.96
5076172--5076574
178
2.3
175
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3
540
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25
15
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1
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1.16
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1
3
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1.17
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15
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2
3
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1.9
25
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8
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62
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0
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0
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0
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15
3.2
16
81
10
63
24
0
7
67
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5115572--5115597
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
5115873--5115905
2
16.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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0
180
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17
25
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100
0
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0
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0
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3.6
13
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0
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23
42
23
10
1.85
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21
2.3
21
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0
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20
32
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0
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1.51
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5
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7
57
18
0
0
81
0.70
5132898--5132928
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
5135904--5136030
40
3.2
39
76
8
130
22
28
24
24
2.00
5135920--5136070
40
3.8
40
77
6
137
23
26
23
26
2.00
5135920--5136069
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
26
2.00
5140576--5140616
5
8.6
5
89
10
59
19
2
0
78
0.87
5140576--5140615
9
4.3
9
90
6
62
20
2
0
77
0.88
5140576--5140616
14
2.9
15
89
10
59
19
2
0
78
0.87
5143935--5143967
5
6.6
5
100
0
66
18
0
0
81
0.68
5147010--5147051
18
2.3
18
100
0
84
38
19
16
26
1.92
5149034--5149079
23
2.1
23
84
8
60
60
0
2
36
1.09
5149964--5150048
19
4.2
21
90
4
70
36
18
9
35
1.84
5149981--5150061
19
4.2
19
96
3
144
35
17
9
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5150422--5151132
205
3.5
205
96
0
1298
27
22
19
30
1.98
5151104--5151211
44
2.4
44
89
3
162
25
28
16
28
1.97
5151142--5151595
44
10.3
44
72
11
322
27
24
17
30
1.97
5151155--5151595
132
3.3
132
90
0
679
27
24
17
31
1.97
5152479--5152518
7
5.7
7
91
8
64
0
10
0
90
0.47
5152479--5152518
15
2.9
14
89
10
64
0
10
0
90
0.47
5157415--5157468
19
2.8
19
94
0
90
35
16
11
37
1.84
5169898--5169958
14
4.5
13
80
15
63
31
0
0
68
0.89
5169925--5169953
3
10.0
3
92
7
51
31
0
0
68
0.89
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21
2.4
21
96
3
93
58
6
4
32
1.41
5176643--5176669
3
9.0
3
100
0
54
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0
0
33
0.92
5177991--5178028
13
3.0
13
80
7
51
36
2
15
44
1.61
5180969--5181006
19
2.1
19
90
5
60
42
0
2
55
1.14
5184501--5184530
14
2.1
14
100
0
60
40
26
13
20
1.89
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
5189633--5189661
13
2.1
14
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6
51
75
0
6
17
1.01
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23
2.3
23
93
0
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50
11
0
38
1.39
5191115--5191177
23
2.6
24
74
20
60
26
3
17
52
1.60
5191613--5191648
2
18.5
2
94
5
65
52
0
0
47
1.00
5193794--5193825
2
16.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
5194098--5194130
3
11.0
3
87
12
50
33
0
0
66
0.92
5197967--5198034
29
2.3
29
94
2
118
57
17
17
7
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5198813--5198888
36
2.1
36
100
0
152
40
17
7
34
1.78
5199692--5199781
45
2.0
45
97
0
171
27
13
14
44
1.82
5200331--5200363
15
2.1
16
88
5
50
36
3
0
60
1.12
5200834--5200863
14
2.1
14
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6
51
66
0
0
33
0.92
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16
2.1
16
100
0
68
38
17
0
44
1.49
5205998--5206027
15
1.9
16
93
6
53
86
0
13
0
0.57
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72
1.9
72
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3
198
31
22
17
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18
1.9
18
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41
0
2
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14
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44
1
1
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1.17
5213860--5213917
27
2.2
26
84
9
73
41
1
1
55
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325