Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr04 98600468 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  98600468

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  293  of  325  ( 38914 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89897285--89897987
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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18
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26
7
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
100
0
98
46
4
12
36
1.60
90045059--90045114
21
2.7
21
82
0
76
19
19
33
26
1.96
90057891--90057949
30
2.0
30
100
0
118
44
3
16
35
1.65
90060997--90061067
34
2.1
33
97
2
133
60
5
2
30
1.34
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17
2.1
17
88
0
52
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0
0
34
0.93
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2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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30
2.7
29
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7
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60
0
2
37
1.10
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24
2.0
23
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12
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68
0
0
31
0.90
90072488--90072527
19
2.1
19
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0
0
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1.30
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5
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0
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27
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37
0
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1.39
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3
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0
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0
0
67
0.91
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36
2.2
36
91
4
126
31
1
22
45
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90103096--90103164
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3.0
23
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12
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0
20
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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100
30
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31
26
1.93
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17
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0
0.92
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0
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1.24
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19
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1.94
90128875--90129047
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21
26
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1.94
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0
1
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29
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0
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30
1.23
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2.4
26
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23
1.24
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20
2.2
20
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47
2
0
50
1.14
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0
0
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14
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0
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1.30
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3.3
124
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15
26
1.91
90166032--90166074
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1.9
22
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27
1.49
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2.1
60
100
0
248
58
3
9
29
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90166062--90166150
28
2.9
31
65
17
78
57
4
8
29
1.49
90166062--90166157
32
3.1
32
67
15
94
58
4
8
29
1.46
90174713--90174754
19
2.2
19
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45
0
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1.52
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1.9
30
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0
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13
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27
1.94
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284
28
20
29
22
1.98
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374
28
19
29
22
1.98
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390
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1.98
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0
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12
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31
1.92
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29
2.1
30
82
2
74
34
1
3
60
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325